164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2372 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_2372  Polysulphide reductase NrfD  100 
 
 
408 aa  798    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.103022  normal  0.75303 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2383  Polysulphide reductase NrfD  73.77 
 
 
408 aa  512  1e-144  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.290901 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02130  polysulphide reductase  41.82 
 
 
389 aa  246  6.999999999999999e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0481  Polysulphide reductase NrfD  46.56 
 
 
413 aa  241  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1867  Polysulphide reductase NrfD  40.11 
 
 
411 aa  234  2.0000000000000002e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0715566 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1631  Polysulphide reductase NrfD  40.43 
 
 
393 aa  230  4e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27690  polysulphide reductase  39.52 
 
 
384 aa  229  5e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2403  Polysulphide reductase NrfD  44.09 
 
 
406 aa  228  1e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.418724  normal  0.657025 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27750  polysulphide reductase  40.05 
 
 
388 aa  221  1.9999999999999999e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.273464  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3262  Polysulphide reductase NrfD  33.59 
 
 
442 aa  186  9e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0389204 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4225  Polysulphide reductase NrfD  29.67 
 
 
389 aa  151  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000782128  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1906  polysulphide reductase, NrfD  30.02 
 
 
413 aa  150  4e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.105136  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13670  polysulphide reductase  32.04 
 
 
414 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0454  polysulphide reductase NrfD  27.3 
 
 
389 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02400  polysulphide reductase  30.97 
 
 
378 aa  135  1.9999999999999998e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1603  polysulphide reductase, NrfD  26.5 
 
 
385 aa  133  5e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00601969  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4229  Polysulphide reductase NrfD  28.77 
 
 
386 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1845  Polysulphide reductase NrfD  26.58 
 
 
384 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0829523  normal  0.148655 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0041  Polysulphide reductase NrfD  28.49 
 
 
383 aa  126  5e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0260  Polysulphide reductase NrfD  26.67 
 
 
383 aa  125  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0239  Polysulphide reductase NrfD  29.75 
 
 
386 aa  124  3e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2523  Polysulphide reductase NrfD  27.59 
 
 
416 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1424  polysulphide reductase, NrfD  27.59 
 
 
416 aa  119  9e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1150  polysulphide reductase, NrfD  26.81 
 
 
385 aa  119  9e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0596071  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2436  Polysulphide reductase NrfD  26.76 
 
 
416 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.136872  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0140  polysulphide reductase, NrfD  27.49 
 
 
383 aa  114  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0274  Polysulphide reductase NrfD  27.39 
 
 
384 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00211929  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2275  reductase, transmembrane subunit, putative  26.1 
 
 
387 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0707  Polysulphide reductase NrfD  26.49 
 
 
385 aa  112  8.000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2406  polysulphide reductase NrfD  25.07 
 
 
417 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.148885  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0066  Polysulphide reductase NrfD  25.31 
 
 
387 aa  107  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.411771 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2552  molybdopterin oxidoreductase  26.51 
 
 
430 aa  105  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1709  polysulphide reductase, NrfD  26.26 
 
 
397 aa  102  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0260794  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3666  Polysulphide reductase NrfD  24.93 
 
 
380 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.396142  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1779  polysulphide reductase, NrfD  25.79 
 
 
387 aa  100  5e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.263014 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0447  Polysulphide reductase NrfD  27.47 
 
 
389 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.542742  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1759  Polysulphide reductase NrfD  25.91 
 
 
453 aa  95.9  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4782  Polysulphide reductase NrfD  26.34 
 
 
400 aa  94.7  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2196  Polysulphide reductase NrfD  26.36 
 
 
414 aa  93.6  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.203832  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3083  Polysulphide reductase NrfD  25.35 
 
 
448 aa  89.4  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1196  Polysulphide reductase NrfD  26.3 
 
 
348 aa  89.4  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1258  Polysulphide reductase NrfD  24.7 
 
 
483 aa  88.6  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1636  polysulphide reductase, NrfD  24.46 
 
 
466 aa  87.4  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.513529  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01305  molybdopterin oxidoredutase membrane subunit  24.1 
 
 
593 aa  86.3  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1798  Polysulphide reductase NrfD  26.55 
 
 
391 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1664  polysulphide reductase, NrfD  25.14 
 
 
425 aa  83.6  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1812  polysulphide reductase, NrfD  26.28 
 
 
456 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0842  polysulphide reductase NrfD  24.44 
 
 
482 aa  80.5  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.363179  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2775  polysulphide reductase, NrfD  28.57 
 
 
472 aa  79  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0295745  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0834  Polysulphide reductase NrfD  23.88 
 
 
448 aa  79.3  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.352451 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0048  polysulfide reductase, subunit C, putative  24.53 
 
 
391 aa  79  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.939472 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0527  Polysulphide reductase NrfD  24.57 
 
 
494 aa  78.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3346  Polysulphide reductase NrfD  28.05 
 
 
402 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000267  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3543  Polysulphide reductase NrfD  22.71 
 
 
469 aa  77.8  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3002  polysulphide reductase, NrfD  21.74 
 
 
468 aa  77  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130542 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2474  molybdopterin oxidoreductase, membrane subunit  25.82 
 
 
400 aa  75.9  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.750101  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2414  Polysulphide reductase NrfD  24.36 
 
 
451 aa  75.9  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0075882  normal  0.349671 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0124  Polysulphide reductase NrfD  26.37 
 
 
624 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0105  Polysulphide reductase NrfD  25 
 
 
624 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267927 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1423  Polysulphide reductase NrfD  24.82 
 
 
603 aa  74.7  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.15148  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2712  Polysulphide reductase NrfD  24.24 
 
 
472 aa  74.3  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.544038  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0451  Polysulphide reductase NrfD  24.71 
 
 
445 aa  72.8  0.000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0223  Polysulphide reductase NrfD  25 
 
 
484 aa  72.8  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0290  Polysulphide reductase NrfD  23.53 
 
 
490 aa  72  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0581587  hitchhiker  0.000681201 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0797  polysulphide reductase, NrfD  22.93 
 
 
478 aa  70.5  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1207  Polysulphide reductase NrfD  27.68 
 
 
305 aa  69.7  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0849  Polysulphide reductase NrfD  22.61 
 
 
478 aa  69.7  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0845  Polysulphide reductase NrfD  22.61 
 
 
478 aa  69.7  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.207631  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4429  polysulphide reductase, NrfD  22.39 
 
 
466 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.217558  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1562  Polysulphide reductase NrfD  24.36 
 
 
435 aa  68.6  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.382538  normal  0.988263 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1594  Polysulphide reductase NrfD  23.12 
 
 
463 aa  67.8  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3475  Polysulphide reductase NrfD  23.24 
 
 
477 aa  67  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.198201  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2271  molybdopterin oxidoreductase, transmembrane subunit, putative  23.66 
 
 
419 aa  67  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1239  polysulphide reductase, NrfD  21.3 
 
 
454 aa  66.6  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.39739  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5666  Polysulphide reductase NrfD  24.66 
 
 
476 aa  66.6  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544636  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3984  Polysulphide reductase NrfD  22.22 
 
 
478 aa  66.2  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.545328  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3933  polysulphide reductase NrfD  24.36 
 
 
493 aa  65.9  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.053608  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5954  Polysulphide reductase NrfD  23.77 
 
 
445 aa  64.7  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.604828  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0864  polysulphide reductase, NrfD  24.56 
 
 
415 aa  64.3  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0258189  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3196  Polysulphide reductase NrfD  23.05 
 
 
412 aa  63.2  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3085  polysulphide reductase NrfD  22.09 
 
 
405 aa  63.2  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.488046  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2211  molybdopterin oxidoreductase  21.62 
 
 
451 aa  61.2  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.554905  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1066  Polysulphide reductase NrfD  22.46 
 
 
412 aa  60.8  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4681800000000002e-26 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0214  polysulphide reductase, NrfD  22.81 
 
 
397 aa  60.5  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1872  Polysulphide reductase NrfD  23.14 
 
 
448 aa  60.1  0.00000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0540714  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1740  putative tetrathionate reductase subunit C  28.35 
 
 
361 aa  59.7  0.00000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.214544 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1801  polysulphide reductase NrfD  23.23 
 
 
408 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1957  Polysulphide reductase NrfD  24.04 
 
 
403 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0356047  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1464  polysulphide reductase NrfD  21.88 
 
 
471 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.920048  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4045  polysulfide reductase, subunit C  27.1 
 
 
313 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0273  molybdopterin oxidoreductase, transmembrane subunit, putative  22.37 
 
 
409 aa  58.9  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0509  polysulphide reductase, NrfD  27.51 
 
 
314 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4141  polysulphide reductase, NrfD  21.88 
 
 
476 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6892  Polysulphide reductase NrfD  23.75 
 
 
454 aa  56.6  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2935  molybdopterin oxidoreductase, transmembrane subunit, putative  23.32 
 
 
418 aa  56.2  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.52066  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1957  Polysulphide reductase NrfD  22.4 
 
 
403 aa  56.2  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1511  Polysulphide reductase NrfD  25.3 
 
 
382 aa  56.2  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2252  polysulphide reductase NrfD  24.26 
 
 
402 aa  55.8  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.38952  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_175  molybdopterin oxidoreductase, formate dehydrogenase membrane subunit  24.46 
 
 
403 aa  55.8  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.100817  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2265  Polysulphide reductase NrfD  22.13 
 
 
403 aa  55.8  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>