More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1567 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1567  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 323 aa  657    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0815521  normal  0.0242929 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0154  transcriptional regulator, LuxR family  49.84 
 
 		 320 aa  313  3.9999999999999997e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0157  transcriptional regulator, LuxR family  50.47 
 
 		 321 aa  267  2e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00820  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  41.59 
 
 		 320 aa  245  8e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04540  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  39.37 
 
 		 320 aa  242  7e-63  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0675  transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 319 aa  227  2e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.101969  normal  0.010777 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12520  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  34.28 
 
 		 320 aa  199  7.999999999999999e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.816981 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0476  transcriptional regulator, LuxR family  21.89 
 
 		 336 aa  74.7  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.123705  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0209  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 223 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0184  transcriptional regulator, LuxR family  33.73 
 
 		 507 aa  54.3  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.131926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3851  two component LuxR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 227 aa  53.5  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 454 aa  53.1  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1954  two component transcriptional regulator, LuxR family  48 
 
 		 221 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.682063 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 207 aa  53.1  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1927  two component transcriptional regulator, LuxR family  48 
 
 		 221 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2497  two component LuxR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 229 aa  53.1  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000315398  normal  0.0281112 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3443  transcriptional regulator, LuxR family  20.6 
 
 		 335 aa  52.8  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00126305  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2525  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.14 
 
 		 215 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1291  transcriptional regulator, LuxR family  30.99 
 
 		 300 aa  52  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.979242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1837  transcriptional regulator, LuxR family  34.62 
 
 		 487 aa  52  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  49.02 
 
 		 471 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2538  regulatory protein, LuxR  31.73 
 
 		 907 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.896851  normal  0.0163895 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0269  transcriptional regulator, LuxR family  35.8 
 
 		 499 aa  51.6  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16610  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  32.1 
 
 		 491 aa  50.4  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0119595  normal  0.714327 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2758  transcriptional regulator, LuxR family  33.05 
 
 		 523 aa  50.4  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1005  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.96 
 
 		 211 aa  50.4  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02650  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  37.5 
 
 		 505 aa  50.4  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1355  two component LuxR family transcriptional regulator  44 
 
 		 230 aa  50.1  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2929  transcriptional regulator, LuxR family  34.09 
 
 		 462 aa  50.1  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0898  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 217 aa  50.1  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000112877  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13370  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  44.83 
 
 		 537 aa  50.1  0.00006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.925648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0016  LuxR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 267 aa  50.1  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0316  LuxR family transcriptional regulator  30 
 
 		 341 aa  49.7  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2575  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  50 
 
 		 917 aa  49.7  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4334  transcriptional regulator, LuxR family  34.86 
 
 		 160 aa  49.7  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03136  transcription regulator protein  39.66 
 
 		 89 aa  49.7  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.625217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0209  transcriptional regulator, LuxR family  30 
 
 		 487 aa  49.3  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.213353  normal  0.452607 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4275  two component LuxR family transcriptional regulator  42 
 
 		 226 aa  49.3  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.798613  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2375  DNA-binding response regulator, LuxR family  36.84 
 
 		 209 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248491  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0338  transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 341 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3973  putative GAF sensor protein  36.47 
 
 		 399 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.057323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0654  two component LuxR family transcriptional regulator  44 
 
 		 256 aa  48.9  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.639317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2630  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.51 
 
 		 243 aa  48.5  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0327  transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 341 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01320  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  35.06 
 
 		 261 aa  48.9  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0523  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.86 
 
 		 230 aa  48.9  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  46 
 
 		 900 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  29.66 
 
 		 234 aa  48.1  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1431  transcriptional regulator, LuxR family  41.38 
 
 		 498 aa  48.5  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0577596  normal  0.857351 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01760  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  32.63 
 
 		 546 aa  48.1  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000265618 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1298  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.47 
 
 		 228 aa  48.5  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.70055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0473  transcriptional regulator, LuxR family  43.4 
 
 		 488 aa  47.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.815594  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0354  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.27 
 
 		 222 aa  48.5  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0578  transcriptional regulator, LuxR family  40.35 
 
 		 474 aa  47.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.28219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0625  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.23 
 
 		 216 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.732521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05591  DNA-binding response regulator  38.71 
 
 		 241 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.843109 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1384  LuxR family DNA-binding response regulator  43.14 
 
 		 207 aa  47.8  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000639089  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05474  transcription regulator protein  40.32 
 
 		 177 aa  47.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.303514 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2245  DNA-binding response regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 213 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3342  LuxR family transcriptional regulator  48 
 
 		 461 aa  47.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.7323  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13310  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  45.28 
 
 		 469 aa  47.4  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0175254  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1389  transcriptional regulator, LuxR family  32.39 
 
 		 320 aa  47.4  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1505  transcriptional regulator, LuxR family  43.75 
 
 		 522 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0565  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.29 
 
 		 213 aa  47.4  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 237 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3078  DNA-binding response regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 213 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000185138 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4046  LuxR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 266 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4320  LuxR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 266 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01507  putative transcriptional regulator, LuxR family protein  35 
 
 		 159 aa  47.4  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.993499  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4561  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.51 
 
 		 217 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1008  transcriptional regulator, LuxR family  40.74 
 
 		 495 aa  47.4  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.831923  normal  0.0679507 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 213 aa  47.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1106  two component LuxR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 223 aa  47  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.584765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1929  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.07 
 
 		 209 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2569  transcriptional regulator, LuxR family  44 
 
 		 508 aa  47  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0621  two component LuxR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 212 aa  47.4  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23170  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  33.33 
 
 		 474 aa  47  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.23412 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27360  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  37.74 
 
 		 517 aa  47  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0445329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1740  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.11 
 
 		 228 aa  47.4  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4126  transcriptional regulator, LuxR family  25.19 
 
 		 210 aa  47  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353041 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3591  two component LuxR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 240 aa  47  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.552533  hitchhiker  0.00313735 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5384  two component response regulator  36.92 
 
 		 216 aa  47  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3764  two component LuxR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 232 aa  47  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3002  LuxR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 210 aa  47  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000242381  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1902  two component LuxR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 207 aa  47.4  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000041006  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0859  two component LuxR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 210 aa  47  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.883984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0267  two component LuxR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 241 aa  47  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4801  two component LuxR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 259 aa  47  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.433912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1936  response regulator receiver  41.18 
 
 		 207 aa  47.4  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000150819  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4528  response regulator receiver  45.28 
 
 		 213 aa  47  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  43.14 
 
 		 242 aa  46.6  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3004  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.07 
 
 		 223 aa  46.6  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0522265  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 237 aa  47  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3486  hypothetical protein  31.13 
 
 		 206 aa  47  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2015  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.91 
 
 		 232 aa  46.6  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.706703  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3000  two component LuxR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 263 aa  46.6  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.42213  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4503  two component LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 221 aa  47  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178457  normal  0.0169691 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2048  response regulator  43.75 
 
 		 209 aa  46.6  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.102554  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2265  LuxR family DNA-binding response regulator  43.75 
 
 		 209 aa  46.6  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.201191  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2290  DNA-binding response regulator, LuxR family  43.75 
 
 		 209 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000736213 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>