120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0592 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_0592  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 137 aa  263  7e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.592767  normal  0.718334 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0980  transcriptional regulator, PadR-like family  34.69 
 
 		 127 aa  67  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000128414  normal  0.0555897 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1121  transcriptional regulator, PadR-like family  36.63 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000122824  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0584  putative transcriptional regulator, PhaQ-like  33.59 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.02813e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1119  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000828793  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2081  transcriptional regulator, PadR-like family  28.87 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000022052  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2210  PadR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000983736  normal  0.0100315 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1117  transcriptional regulator, PadR-like family  38.6 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.742645 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1035  PadR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 108 aa  53.9  0.0000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00460025  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0345  PadR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000392744  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0870  transcriptional regulator, PadR-like family  35.79 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.126206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0311  PadR-like family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2045  PadR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 116 aa  51.2  0.000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0276  PadR-like family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 138 aa  50.8  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00724542  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1205  PadR family transcriptional regulator putative  31.68 
 
 		 150 aa  50.4  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1207  PadR family transcriptional regulator putative  31.68 
 
 		 150 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0174936  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1468  transcriptional regulator, PadR family  31.68 
 
 		 150 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3978  transcriptional regulator, PadR family  31.68 
 
 		 150 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4580  transcriptional regulator, PadR-like family  42.47 
 
 		 134 aa  50.1  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1228  PadR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1328  PadR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1284  PadR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 121 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.865226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2392  PadR family transcriptional regulator  31 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0642121  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2076  transcriptional regulator, PadR-like family  32.29 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.668384  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3146  PadR-like family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 185 aa  49.7  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280559 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1366  transcriptional regulator, PadR family  31.68 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.261083  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1403  transcriptional regulator, PadR family  32.32 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3822  transcriptional regulator, PadR-like family  34.65 
 
 		 114 aa  49.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1228  PadR-like family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 120 aa  48.9  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1041  PadR-like family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.812068  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4083  PadR-like family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.176428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  42.47 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2308  transcriptional regulator, PadR-like family  34.48 
 
 		 124 aa  48.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0520  PadR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 111 aa  48.1  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 109 aa  48.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1229  PadR-like family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  41.18 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2928  transcriptional regulator, PadR-like family  44.74 
 
 		 106 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.425588  hitchhiker  0.00045831 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2451  hypothetical protein  32.1 
 
 		 165 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.073124  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2413  hypothetical protein  32.1 
 
 		 165 aa  47.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000015361  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2631  hypothetical protein  32.1 
 
 		 165 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3563  PadR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 125 aa  47.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2649  hypothetical protein  32.1 
 
 		 165 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000115894 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1427  PadR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 150 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2376  hypothetical protein  32.1 
 
 		 165 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.247862  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5211  PadR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 109 aa  47.4  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3696  PadR-like family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 128 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1963  PadR-like family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 103 aa  47.4  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5082  transcriptional regulator, PadR family  27.71 
 
 		 109 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2658  hypothetical protein  32.1 
 
 		 165 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287076  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5114  PadR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 121 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1921  PadR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 114 aa  47.4  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0690  PadR-like family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 132 aa  47.4  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.112925  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17520  transcriptional regulator, PadR family  34.41 
 
 		 112 aa  47.4  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.311111  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4845  PadR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 188 aa  47  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0170  transcriptional regulator, PadR-like family  31.82 
 
 		 121 aa  47  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0778  transcriptional regulator, PadR-like family  42.65 
 
 		 115 aa  47  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  33.82 
 
 		 107 aa  47  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0763  PadR-like family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 108 aa  46.2  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.31288  normal  0.603278 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0660  PadR-like family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 128 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0691  PadR-like family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 128 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0681  transcriptional regulator, PadR-like family  42.65 
 
 		 128 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25120  predicted transcriptional regulator  42.11 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0742  transcriptional regulator, PadR-like family  36.78 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.238359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5217  PadR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 118 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0699  PadR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000596024  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5305  PadR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 118 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5597  PadR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 118 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.459425  normal  0.499532 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1641  PadR-like family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3127  transcriptional regulator, PadR-like family  39.08 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.177743  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2361  PadR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 120 aa  45.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1974  transcriptional regulator, PadR-like family  34.38 
 
 		 117 aa  45.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.37722 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4304  hypothetical protein  32.43 
 
 		 119 aa  45.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0734  hypothetical protein  40 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2509  PadR-like family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 165 aa  45.1  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0736667  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4327  transcriptional regulator, PadR-like family  33.77 
 
 		 117 aa  45.1  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0595  transcriptional regulator, PadR-like family  31.25 
 
 		 112 aa  44.3  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4626  PadR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 114 aa  44.7  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.658032 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5149  transcriptional regulator, PadR-like family  33.33 
 
 		 117 aa  44.3  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0918525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2655  hypothetical protein  28.4 
 
 		 165 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2669  hypothetical protein  28.95 
 
 		 165 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.010535 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07890  transcriptional regulator, PadR family  37.84 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.312386  normal  0.193392 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4325  PadR-like family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 109 aa  43.5  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.405564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0133  transcriptional regulator, PadR-like family  37.04 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0204  transcriptional regulator, PadR-like family  33.78 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100896 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 168 aa  43.5  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0209  transcriptional regulator, PadR-like family  30.77 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0210423 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3465  transcriptional regulator, PadR-like family  40.85 
 
 		 230 aa  43.5  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.236404 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3025  transcriptional regulator, PadR-like family  33.64 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361179  normal  0.13274 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0755  PadR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.916558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4394  PadR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3065  transcriptional regulator, PadR-like family  34.78 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.599102  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02430  transcriptional regulator, PadR family  30.43 
 
 		 174 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.467679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33800  transcriptional regulator, PadR family  37.84 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.377597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2248  PadR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 183 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0137325  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0474  transcriptional regulator, PadR-like family  35.59 
 
 		 113 aa  42  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1102  transcriptional regulator, PadR family  29.27 
 
 		 110 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0819  transcriptional regulator, PadR-like family  27.71 
 
 		 138 aa  42  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.886825  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3845  transcriptional regulator, PadR-like family  32.84 
 
 		 174 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0735  PadR-like family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073319 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>