More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4879 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_4879  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 		 657 aa  1344    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.511853 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5846  hypothetical protein  76.75 
 
 		 727 aa  1085    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.909355 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  29.75 
 
 		 309 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  28.42 
 
 		 456 aa  89.4  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0862  pentapeptide repeat-containing protein  26.8 
 
 		 872 aa  88.2  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0163712  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  27.17 
 
 		 485 aa  87.4  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0723  pentapeptide repeat-containing protein  25.87 
 
 		 880 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0542  hypothetical protein  26.25 
 
 		 880 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0612  pentapeptide repeat-containing protein  25.87 
 
 		 880 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.65281  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1681  pentapeptide repeat-containing protein  25.87 
 
 		 880 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  28.52 
 
 		 401 aa  86.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  26.72 
 
 		 333 aa  83.2  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2131  pentapeptide repeat-containing protein  25.48 
 
 		 880 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  28.09 
 
 		 452 aa  82.8  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  27.31 
 
 		 286 aa  81.6  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2033  pentapeptide repeat-containing protein  25.48 
 
 		 877 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  29.66 
 
 		 267 aa  81.6  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  29.9 
 
 		 336 aa  81.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  31.21 
 
 		 343 aa  81.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  31.21 
 
 		 343 aa  81.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  29.9 
 
 		 336 aa  81.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  27.85 
 
 		 493 aa  80.9  0.00000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  29.08 
 
 		 319 aa  79.7  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  25.86 
 
 		 449 aa  80.1  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3552  pentapeptide repeat-containing protein  27.85 
 
 		 415 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  27.21 
 
 		 401 aa  78.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  29.44 
 
 		 386 aa  78.6  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  27.03 
 
 		 381 aa  77.4  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  25.95 
 
 		 489 aa  77.4  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0203  pentapeptide repeat protein  25.36 
 
 		 886 aa  77  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.713128  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  23.93 
 
 		 862 aa  77  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  26.16 
 
 		 949 aa  76.6  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  31.07 
 
 		 219 aa  75.9  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  24.78 
 
 		 844 aa  75.5  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  29.25 
 
 		 576 aa  74.7  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  24.75 
 
 		 825 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  24.75 
 
 		 825 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  24.75 
 
 		 825 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  24.75 
 
 		 825 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  28.74 
 
 		 389 aa  74.7  0.000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  30.77 
 
 		 203 aa  74.3  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3764  pentapeptide repeat protein  26.63 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  24.41 
 
 		 862 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  26.44 
 
 		 416 aa  73.6  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  29.95 
 
 		 263 aa  73.2  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.11 
 
 		 14916 aa  72.4  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  24.65 
 
 		 332 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  25.43 
 
 		 870 aa  72.4  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3289  pentapeptide repeat containing protein  30.73 
 
 		 237 aa  72  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.051928  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  25.64 
 
 		 312 aa  72  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5006  pentapeptide repeat-containing protein  27.84 
 
 		 267 aa  71.6  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.993691  normal  0.304437 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  24.41 
 
 		 825 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4774  pentapeptide repeat-containing protein  29.84 
 
 		 266 aa  71.6  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3780  pentapeptide repeat protein  22.78 
 
 		 866 aa  71.2  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  27.51 
 
 		 348 aa  71.2  0.00000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  32.16 
 
 		 245 aa  70.9  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0707  pentapeptide repeat protein  32.93 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4586  pentapeptide repeat protein  30.12 
 
 		 453 aa  70.9  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.0812819 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  24.41 
 
 		 825 aa  70.9  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6284  pentapeptide repeat-containing protein  26.29 
 
 		 381 aa  69.7  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  27.17 
 
 		 1191 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  31.41 
 
 		 515 aa  69.7  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  31.07 
 
 		 483 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2443  Protein of unknown function DUF2169  25.55 
 
 		 846 aa  69.7  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  26.36 
 
 		 872 aa  69.7  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  28.96 
 
 		 441 aa  69.3  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  26.87 
 
 		 225 aa  68.6  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  26.32 
 
 		 250 aa  68.9  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  28.98 
 
 		 1033 aa  68.9  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  25.1 
 
 		 351 aa  68.6  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  26.82 
 
 		 567 aa  68.6  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  27.49 
 
 		 311 aa  68.9  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26570  Pentapeptide repeat protein  23.21 
 
 		 343 aa  68.9  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.146804  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  28.27 
 
 		 734 aa  68.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1544  RDD domain-containing protein  27.1 
 
 		 706 aa  68.6  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  27.96 
 
 		 433 aa  68.2  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  31.52 
 
 		 174 aa  67.8  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  28.19 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  29.67 
 
 		 521 aa  67.4  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  29.56 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  30.46 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  28.16 
 
 		 401 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3960  pentapeptide repeat-containing protein  25.99 
 
 		 229 aa  66.6  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  30.12 
 
 		 412 aa  67  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  29.12 
 
 		 215 aa  67  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  28.16 
 
 		 401 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  26.18 
 
 		 320 aa  66.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0577  hypothetical protein  34.74 
 
 		 961 aa  66.2  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2990  pentapeptide repeat protein  30.06 
 
 		 356 aa  66.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  30.94 
 
 		 447 aa  66.2  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3130  pentapeptide repeat protein  30.06 
 
 		 356 aa  66.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  25.88 
 
 		 277 aa  66.2  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.49 
 
 		 525 aa  65.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3781  pentapeptide repeat protein  24.88 
 
 		 349 aa  65.5  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  27.23 
 
 		 309 aa  65.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  25.64 
 
 		 295 aa  65.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  30.77 
 
 		 448 aa  65.1  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  23.96 
 
 		 727 aa  65.1  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1950  pentapeptide repeat-containing protein  26.8 
 
 		 232 aa  65.1  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  30.68 
 
 		 340 aa  64.7  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>