More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_3320 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0958  SNF2-related protein  40.22 
 
 		 975 aa  681    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.106346  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3320  SNF2 family helicase  100 
 
 		 951 aa  1952    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4171  helicase domain-containing protein  44.95 
 
 		 947 aa  746    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0592  helicase domain-containing protein  42.21 
 
 		 955 aa  709    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0933  DEAD/DEAH box helicase  45.07 
 
 		 932 aa  756    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.599756  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3658  SNF2 family helicase  43.51 
 
 		 960 aa  724    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.041395  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0513  helicase domain-containing protein  45.74 
 
 		 942 aa  825    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52390  helicase, Snf2 family  45.15 
 
 		 929 aa  751    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2069  SNF2-related protein  43.25 
 
 		 964 aa  719    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4903  type III restriction enzyme, res subunit  39.81 
 
 		 963 aa  679    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.891445  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1538  helicase domain-containing protein  41.06 
 
 		 963 aa  705    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1945  helicase domain protein  43.94 
 
 		 949 aa  772    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1953  helicase domain-containing protein  43.16 
 
 		 967 aa  751    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3804  SNF2-related protein  44.3 
 
 		 961 aa  751    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.502587  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1983  SNF2-related protein  42.86 
 
 		 966 aa  753    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.094528  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05330  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  38.48 
 
 		 961 aa  606  9.999999999999999e-173  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  45.74 
 
 		 665 aa  566  1e-160  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1341  helicase domain-containing protein  44.05 
 
 		 921 aa  499  1e-140  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.134377 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2524  SNF2-related helicase-like  44.07 
 
 		 915 aa  501  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.180515  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1426  helicase domain protein  43.77 
 
 		 915 aa  494  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1328  helicase domain protein  43.77 
 
 		 916 aa  494  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0900  putative helicase  30 
 
 		 560 aa  226  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4306  helicase, putative  30.66 
 
 		 560 aa  226  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4083  non-specific serine/threonine protein kinase  30 
 
 		 560 aa  227  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4340  putative helicase  30 
 
 		 560 aa  226  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.486196  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4359  putative helicase  30 
 
 		 560 aa  225  3e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  30.53 
 
 		 584 aa  225  3e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2916  SNF2-related protein  31.01 
 
 		 560 aa  225  3e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4132  helicase  30 
 
 		 560 aa  224  4e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3972  SNF2 family helicase  30 
 
 		 560 aa  224  4e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3982  SNF2 family helicase  30 
 
 		 560 aa  224  4e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4450  helicase  30 
 
 		 560 aa  224  4e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982586  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4248  putative helicase  30 
 
 		 560 aa  225  4e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2756  helicase domain protein  30.23 
 
 		 584 aa  222  1.9999999999999999e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2362  SNF2-related protein  30.57 
 
 		 555 aa  218  5e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  28.67 
 
 		 572 aa  215  2.9999999999999995e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08850  helicase domain protein  29.89 
 
 		 467 aa  209  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000230967  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0213  SNF2-related protein  29.63 
 
 		 554 aa  207  9e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  28.76 
 
 		 835 aa  202  3e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  28.76 
 
 		 1144 aa  201  3.9999999999999996e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  30.53 
 
 		 933 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  29.96 
 
 		 969 aa  196  2e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  26.6 
 
 		 988 aa  195  4e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  28.2 
 
 		 941 aa  192  4e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  28.2 
 
 		 941 aa  192  4e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  28.24 
 
 		 966 aa  191  7e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1303  helicase domain-containing protein  28.57 
 
 		 669 aa  190  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2682  prophage LambdaMc01, SNF2 family helicase  29.16 
 
 		 925 aa  185  3e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0259  helicase domain-containing protein  27.91 
 
 		 578 aa  184  7e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  28.55 
 
 		 1145 aa  179  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  27.76 
 
 		 962 aa  178  4e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  26.48 
 
 		 1138 aa  177  9e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  29.17 
 
 		 801 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  28.55 
 
 		 1116 aa  175  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  28.35 
 
 		 1129 aa  172  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  29.87 
 
 		 972 aa  171  6e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  27.78 
 
 		 937 aa  170  9e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  26.23 
 
 		 969 aa  169  2e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1301  helicase domain protein  27.68 
 
 		 1062 aa  169  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.483393  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  27.96 
 
 		 805 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  28.44 
 
 		 1147 aa  166  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  27.82 
 
 		 1170 aa  165  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  28.78 
 
 		 1169 aa  166  3e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  27.86 
 
 		 877 aa  164  7e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  28.66 
 
 		 1169 aa  164  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  25.49 
 
 		 971 aa  162  2e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  26.67 
 
 		 1160 aa  163  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0251  helicase  27.64 
 
 		 541 aa  162  3e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.432976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  27.2 
 
 		 1172 aa  159  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  26.83 
 
 		 1160 aa  158  4e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  25.83 
 
 		 1167 aa  158  6e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0811  helicase-like protein  23.75 
 
 		 1201 aa  158  6e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  26.89 
 
 		 1170 aa  158  6e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0827  helicase domain-containing protein  23.75 
 
 		 1201 aa  158  6e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  28.22 
 
 		 1170 aa  157  7e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2726  helicase domain protein  28.42 
 
 		 1057 aa  156  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  25.94 
 
 		 1167 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  26.23 
 
 		 1167 aa  155  5e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2729  helicase-like  27.73 
 
 		 1165 aa  154  8e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.36993  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  27.57 
 
 		 1170 aa  147  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0826  helicase domain-containing protein  26.76 
 
 		 1136 aa  147  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  26.05 
 
 		 964 aa  146  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  27.59 
 
 		 1168 aa  145  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  27.24 
 
 		 1212 aa  144  7e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  26.74 
 
 		 1172 aa  143  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  26.48 
 
 		 1194 aa  143  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2324  helicase domain protein  26.02 
 
 		 1095 aa  140  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03240  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  24.41 
 
 		 1028 aa  139  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  25.71 
 
 		 900 aa  139  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3885  helicase domain-containing protein  24.91 
 
 		 952 aa  137  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.929535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  27.09 
 
 		 894 aa  137  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2545  helicase domain protein  27.13 
 
 		 1038 aa  135  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0721063  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0036  hypothetical protein  28.53 
 
 		 363 aa  134  6.999999999999999e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.922282  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  25.91 
 
 		 952 aa  134  6.999999999999999e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5808  helicase family protein  24.56 
 
 		 952 aa  133  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4828  helicase family protein  24.56 
 
 		 952 aa  133  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  26.13 
 
 		 1137 aa  132  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4894  helicase family protein  24.38 
 
 		 952 aa  132  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  25.21 
 
 		 1013 aa  130  9.000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1355  helicase domain-containing protein  26.09 
 
 		 954 aa  130  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>