69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_1409 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_1409  putative recombinase  100 
 
 		 506 aa  1046    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00494  predicted recombinase  30.54 
 
 		 508 aa  182  2e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.148642  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3227  recombinase family protein  30.54 
 
 		 508 aa  182  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.171762  hitchhiker  0.00185611 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1118  recombinase-related protein  29.65 
 
 		 563 aa  148  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.236338  unclonable  0.000000608507 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0143  recombinase  30.46 
 
 		 565 aa  140  4.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22270  recombinase  27.91 
 
 		 525 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000000532619  unclonable  9.12817e-22 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2727  Recombinase  28.6 
 
 		 590 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1905  recombinase  24.91 
 
 		 585 aa  133  7.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0302964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3675  Recombinase  31.9 
 
 		 545 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2774  hypothetical protein  31.74 
 
 		 644 aa  131  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3480  recombinase  27.42 
 
 		 532 aa  130  8.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000373145  decreased coverage  0.0098808 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1544  resolvase domain-containing protein  26.39 
 
 		 503 aa  123  7e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.197317  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2317  hypothetical protein  29.43 
 
 		 534 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0306066  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0107  recombinase  28.54 
 
 		 544 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3143  resolvase-like:recombinase  27.16 
 
 		 622 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2612  recombinase  30.51 
 
 		 601 aa  118  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0128  Resolvase domain  25.89 
 
 		 526 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000180819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3310  recombinase  24.43 
 
 		 589 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0003  putative site-specific recombinase  28.64 
 
 		 509 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385186  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3889  recombinase  27.91 
 
 		 560 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0513638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1644  recombinase  27.57 
 
 		 550 aa  102  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2440  recombinase  25.26 
 
 		 540 aa  98.6  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0490  putative site-specific recombinase  25.76 
 
 		 681 aa  96.3  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402032  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4018  hypothetical protein  25.23 
 
 		 539 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3468  recombinase  27.22 
 
 		 571 aa  86.7  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723341  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3026  phage recombinase, putative  26.22 
 
 		 541 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0613972 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0835  resolvase domain-containing protein  26.1 
 
 		 548 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0768  hypothetical protein  25.82 
 
 		 552 aa  74.7  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.914496  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1857  Site-specific recombinase DNA invertase Pin  27.14 
 
 		 488 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.830217  decreased coverage  0.0036727 
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  22.64 
 
 		 510 aa  61.6  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  21.7 
 
 		 522 aa  61.6  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  26.87 
 
 		 563 aa  61.2  0.00000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1274  resolvase domain-containing protein  24.29 
 
 		 523 aa  60.8  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135333  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0427  Resolvase domain protein  26.69 
 
 		 534 aa  60.8  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  22.94 
 
 		 522 aa  59.3  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1233  Recombinase  23.02 
 
 		 469 aa  58.9  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1612  resolvase domain-containing protein  23.43 
 
 		 523 aa  58.2  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  23.08 
 
 		 506 aa  57.8  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1448  recombinase  27.98 
 
 		 467 aa  56.6  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  22.87 
 
 		 521 aa  56.2  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0430  resolvase domain-containing protein  23.73 
 
 		 522 aa  55.8  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0901787  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  26.15 
 
 		 548 aa  55.1  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  22.81 
 
 		 519 aa  54.7  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  22.1 
 
 		 475 aa  53.9  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  22.55 
 
 		 520 aa  53.9  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  24.23 
 
 		 551 aa  53.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2814  Resolvase domain protein  21.96 
 
 		 523 aa  51.6  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.652656  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0419  DNA recombinase, putative  21.29 
 
 		 523 aa  50.8  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1491  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  23.56 
 
 		 506 aa  50.4  0.00007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1090  recombinase  25.85 
 
 		 465 aa  50.4  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  23.36 
 
 		 554 aa  50.4  0.00008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  23.47 
 
 		 542 aa  50.1  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1067  phage integrase family site specific recombinase  23.53 
 
 		 518 aa  48.5  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.194572  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2729  Resolvase domain protein  23.94 
 
 		 535 aa  48.5  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1671  recombinase  23.4 
 
 		 522 aa  48.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  25.4 
 
 		 547 aa  48.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1776  resolvase domain protein  22.67 
 
 		 606 aa  47.4  0.0006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0693  resolvase domain protein  22.67 
 
 		 606 aa  47.4  0.0006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.298225  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  25.27 
 
 		 525 aa  47.4  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  21.71 
 
 		 525 aa  46.6  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2851  resolvase domain-containing protein  22.75 
 
 		 565 aa  45.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.437901 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  25.25 
 
 		 525 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  24.32 
 
 		 496 aa  45.8  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  19.66 
 
 		 553 aa  45.1  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  22.32 
 
 		 540 aa  44.7  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3384  resolvase domain-containing protein  23.3 
 
 		 590 aa  44.3  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2949  site-specific recombinase  25.68 
 
 		 479 aa  43.9  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000000764647  unclonable  0.00000628307 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26050  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  26.19 
 
 		 511 aa  43.5  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.799262  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  22.28 
 
 		 521 aa  43.9  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>