69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_1284 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E0873  side tail fiber protein  89.52 
 
 
441 aa  679    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2274  Prophage tail fibre domain protein  93.34 
 
 
1120 aa  1665    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.817873  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1284  phage tail domain-containing protein  100 
 
 
1137 aa  2281    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2111  prophage tail fibre domain-containing protein  87.81 
 
 
1007 aa  503  1e-141  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0810598  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1478  phage protein  79.21 
 
 
536 aa  456  1.0000000000000001e-126  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2098  Tail Collar domain protein  74.52 
 
 
320 aa  352  3e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0113464  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0833  phage tail collar domain-containing protein  74.14 
 
 
281 aa  347  7e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1643  prophage tail fibre domain protein  65.68 
 
 
516 aa  340  8e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10056  Tail fiber protein  79.83 
 
 
401 aa  327  9e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00752  hypothetical protein  79.83 
 
 
401 aa  327  9e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1637  L-shaped tail fiber protein  80 
 
 
1258 aa  306  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1096  side tail fiber protein  66.4 
 
 
411 aa  291  5.0000000000000004e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0096  putative phage tail protein  58.7 
 
 
962 aa  291  7e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  2.12465e-28 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1427  side tail fiber protein  55.51 
 
 
805 aa  272  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.214924 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2794  side tail fiber protein  55.51 
 
 
790 aa  271  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1090  side tail fiber protein  56.27 
 
 
463 aa  271  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.422026  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1123  side tail fiber protein  56.27 
 
 
569 aa  270  8.999999999999999e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1160  side tail fiber protein  54.92 
 
 
791 aa  263  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0463923  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2230  tail fiber protein  63.16 
 
 
407 aa  260  1e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000293165 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2165  tail fiber protein  62.75 
 
 
437 aa  258  4e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1203  tail fiber protein  62.75 
 
 
451 aa  258  4e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2871  tail fiber protein  62.35 
 
 
437 aa  256  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0235495 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  62.25 
 
 
437 aa  254  5.000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0915  tail fiber protein  62.2 
 
 
438 aa  254  5.000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1206  putative prophage side tail fiber protein  65.52 
 
 
845 aa  252  2e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.116414 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  62.35 
 
 
439 aa  252  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1804  tail fiber protein  61.54 
 
 
434 aa  251  5e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  hitchhiker  0.00650595 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4381  gp19  54.62 
 
 
580 aa  244  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427744  hitchhiker  0.000225609 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00513  conserved hypothetical protein  90 
 
 
198 aa  220  1e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0710  side tail fiber protein  69.32 
 
 
892 aa  213  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116846  normal  0.0178865 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2015  side tail fiber protein  68.85 
 
 
442 aa  174  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.478107 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1577  Tail Collar domain protein  39.02 
 
 
682 aa  119  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1941  gpH  46.9 
 
 
570 aa  112  5e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1039  hypothetical protein  44.83 
 
 
304 aa  84  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1042  putative phage tail fiber protein  43.44 
 
 
469 aa  83.2  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4025  Tail Collar domain protein  45.88 
 
 
371 aa  82.4  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4031  Tail Collar domain protein  45.24 
 
 
485 aa  82.4  0.00000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3818  Tail Collar domain protein  45.26 
 
 
557 aa  82.4  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2731  tail collar domain-containing protein  48 
 
 
259 aa  80.9  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.594625  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3474  phage tail fiber repeat  62.86 
 
 
670 aa  80.9  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0858569  hitchhiker  0.000000311784 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2783  phage tail fiber repeat-containing protein  62.86 
 
 
670 aa  80.9  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.572485  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2427  side tail fiber protein  76.36 
 
 
280 aa  80.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.220934 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3484  phage tail collar domain-containing protein  46.91 
 
 
340 aa  79.7  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  0.0437256 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3816  Tail Collar domain protein  50 
 
 
498 aa  79  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1476  tail collar domain-containing protein  47.3 
 
 
259 aa  78.2  0.0000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.736982 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00848  bacteriophage tail fiber protein  46.15 
 
 
179 aa  77.4  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00854  hypothetical protein  46.15 
 
 
180 aa  77.4  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1819  Tail Collar domain protein  38.68 
 
 
166 aa  76.6  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.597378  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4027  Tail Collar domain protein  45.21 
 
 
646 aa  76.3  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2736  Tail Collar domain protein  36.36 
 
 
689 aa  76.3  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1823  Tail Collar domain protein  58.82 
 
 
401 aa  75.9  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112044  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2594  hypothetical protein  37.4 
 
 
468 aa  74.7  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2758  tail collar domain-containing protein  37.89 
 
 
177 aa  71.2  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2492  Tail Collar domain protein  40 
 
 
262 aa  70.9  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136013  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3032  tail Collar domain protein  36.84 
 
 
176 aa  70.1  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000835332 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2198  tail collar domain-containing protein  35.54 
 
 
402 aa  67.8  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.23854  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4341  putative phage tail fiber protein  46.97 
 
 
673 aa  67  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0213021 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1014  putative prophage tail fiber protein  41.38 
 
 
352 aa  66.2  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1537  Tail Collar domain protein  38.04 
 
 
621 aa  66.6  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  27.42 
 
 
645 aa  63.2  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0875  phage tail fiber repeat protein  51.39 
 
 
172 aa  62  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.872815  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1058  large adhesin  32.76 
 
 
2906 aa  59.7  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2207  tail fiber family protein  35.45 
 
 
336 aa  58.9  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.837708  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1372  phage-related tail fiber protein  32.14 
 
 
762 aa  57.8  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0940  tail fiber domain-containing protein  83.33 
 
 
583 aa  53.1  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01518  hypothetical protein  44 
 
 
642 aa  52  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.43941  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01348  hypothetical protein  26.86 
 
 
501 aa  49.7  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106689  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4537  gp19  61.9 
 
 
493 aa  49.7  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1045  tail fiber protein  34.59 
 
 
690 aa  46.2  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>