More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_0292 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_0292  phage integrase family protein  100 
 
 		 440 aa  902    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0395  phage integrase family protein  34.02 
 
 		 396 aa  193  5e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.436905  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  27.43 
 
 		 406 aa  123  5e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  28.46 
 
 		 414 aa  121  3e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1623  integrase or site-specific recombinase  26.5 
 
 		 466 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.262588 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  28.46 
 
 		 414 aa  120  6e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2489  putative integrase protein  28.03 
 
 		 417 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  27.91 
 
 		 414 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1902  integrase family protein  26.26 
 
 		 416 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41933  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2362  integrase family protein  26.52 
 
 		 416 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.965631  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  28.15 
 
 		 413 aa  111  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1631  integrase family protein  26.82 
 
 		 409 aa  111  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2751  integrase family protein  26.01 
 
 		 415 aa  108  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.606598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0308  integrase or site-specific recombinase  27.96 
 
 		 414 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0097  phage integrase family site specific recombinase  27.46 
 
 		 409 aa  106  6e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.89883  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  28.61 
 
 		 400 aa  107  6e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0112  phage integrase family site specific recombinase  27.96 
 
 		 409 aa  106  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246788  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  26.29 
 
 		 413 aa  104  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0444  integrase family protein  26.37 
 
 		 461 aa  103  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.737271 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1053  integrase family protein  27.05 
 
 		 413 aa  102  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2952  phage integrase family protein  28.33 
 
 		 397 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.20289e-17 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1726  phage integrase family protein  27.43 
 
 		 395 aa  102  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3232  phage integrase family site specific recombinase  27.93 
 
 		 409 aa  100  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4147  integrase family protein  25 
 
 		 447 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.737436 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1357  phage family integrase  27.43 
 
 		 411 aa  100  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183355  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1034  phage integrase  24.59 
 
 		 444 aa  100  6e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.288738  normal  0.327892 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2656  phage integrase family site specific recombinase  27.11 
 
 		 395 aa  99.8  8e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000325439  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3455  integrase family protein  28.07 
 
 		 410 aa  99  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1046  integrase family protein  28.05 
 
 		 410 aa  99.8  1e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000192278  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2900  phage integrase family protein  26.85 
 
 		 432 aa  97.8  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2336  Phage integrase  24.88 
 
 		 426 aa  97.8  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2279  Phage integrase  27.95 
 
 		 414 aa  98.2  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0066545  normal  0.0551798 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004339  integrase  26.18 
 
 		 398 aa  97.8  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1859  phage integrase family protein  25.61 
 
 		 427 aa  98.2  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0222826  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0362  phage integrase family site specific recombinase  25.69 
 
 		 402 aa  97.4  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.613827  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3121  phage integrase family protein  26.29 
 
 		 449 aa  97.4  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3996  phage integrase family protein  25.18 
 
 		 389 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.243095  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2546  phage integrase family protein  26.25 
 
 		 400 aa  96.7  7e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.40023  hitchhiker  0.00168033 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  26.28 
 
 		 421 aa  95.5  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  27.72 
 
 		 403 aa  96.3  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  24.04 
 
 		 433 aa  96.3  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3101  phage integrase family protein  26.43 
 
 		 395 aa  95.5  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0064  integrative genetic element Gsu32, integrase  23.67 
 
 		 439 aa  95.1  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0366  integrase family protein  25.93 
 
 		 439 aa  95.5  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.134449 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3082  phage integrase family protein  26.24 
 
 		 437 aa  94.7  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1063  integrase family protein  27.63 
 
 		 398 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0496  phage integrase  27.36 
 
 		 418 aa  94  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3353  phage integrase family protein  26.14 
 
 		 393 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0317  phage integrase  26.27 
 
 		 404 aa  93.6  6e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6722  integrase family protein  27.54 
 
 		 413 aa  93.6  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3232  integrase family protein  25.81 
 
 		 434 aa  93.6  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.068813  normal  0.462781 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15350  putative integrase  25.25 
 
 		 400 aa  93.6  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000770896  unclonable  1.43377e-21 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1709  putative phage integrase  25 
 
 		 446 aa  93.2  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.558135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2217  integrase family protein  25.75 
 
 		 418 aa  93.2  8e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.664863  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2823  putative phage integrase  25.7 
 
 		 440 aa  92.8  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.339344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2142  phage integrase  27.97 
 
 		 418 aa  92.4  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3223  integrase  27.48 
 
 		 413 aa  92.8  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  26.5 
 
 		 402 aa  92  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2119  integrative genetic element Gsu56, integrase  23.76 
 
 		 453 aa  92.4  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0615  Phage integrase  26 
 
 		 399 aa  92  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.862313  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2892  phage integrase family protein  27.72 
 
 		 423 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0958  integrase family protein  25.94 
 
 		 403 aa  92  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1337  integrase  24.3 
 
 		 418 aa  92  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0723  integrase family protein  26 
 
 		 402 aa  92  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  27.1 
 
 		 401 aa  92  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  24.5 
 
 		 404 aa  90.5  5e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0354  Phage integrase  25.31 
 
 		 402 aa  89.7  8e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2483  integrase family protein  25.69 
 
 		 404 aa  89.7  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2977  integrase family protein  23.97 
 
 		 429 aa  88.6  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0922  Phage integrase  25.38 
 
 		 403 aa  88.6  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12188  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2351  phage integrase  26.73 
 
 		 452 aa  88.6  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0439669  hitchhiker  0.00873644 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0767  prophage integrase  26.18 
 
 		 413 aa  88.2  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.496617  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3334  phage integrase family protein  25.19 
 
 		 398 aa  88.2  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1632  phage integrase  24.52 
 
 		 413 aa  87.8  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.986406  hitchhiker  0.00880856 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1227  integrase family protein  24.94 
 
 		 424 aa  88.2  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149921  normal  0.536296 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2460  integrase family protein  27.09 
 
 		 415 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  25.12 
 
 		 404 aa  87.8  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3617  phage integrase family protein  24.81 
 
 		 390 aa  87.4  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2777  phage integrase family protein  26.25 
 
 		 414 aa  87  5e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.179227 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  26.34 
 
 		 389 aa  87  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3164  integrase family protein  25.05 
 
 		 428 aa  87  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0919  integrase family protein  27.18 
 
 		 448 aa  87  6e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.295922  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2416  integrase family protein  25.39 
 
 		 443 aa  86.7  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0064  Phage integrase  26.4 
 
 		 420 aa  86.7  8e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2021  phage integrase family protein  26.73 
 
 		 418 aa  86.7  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.713949  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02509  Fels-2 prophage protein  26.8 
 
 		 409 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.291445  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0886  phage integrase  25.12 
 
 		 454 aa  85.9  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00972856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1237  integrase family protein  25.9 
 
 		 401 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0063  DNA integration/recombination/inversion protein  22.72 
 
 		 396 aa  86.3  0.000000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1262  integrase family protein  26.05 
 
 		 418 aa  85.9  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528936  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02473  hypothetical protein  26.8 
 
 		 409 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.36664  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2864  phage integrase family protein  23.76 
 
 		 385 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.988255 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3469  integrase family protein  25.18 
 
 		 433 aa  85.1  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0423889 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1675  Phage integrase  25.69 
 
 		 419 aa  85.5  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0217  phage-related integrase  25.93 
 
 		 413 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2905  phage integrase family protein  26.8 
 
 		 436 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1087  prophage CP4-like integrase  26.87 
 
 		 402 aa  85.1  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0686158  normal  0.733302 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1425  integrase  24.43 
 
 		 413 aa  85.5  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.468676  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0372  phage family integrase  24.5 
 
 		 422 aa  85.5  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3385  site-specific recombinase, phage integrase family  25.13 
 
 		 391 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.059991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>