More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0701 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007799  ECH_0701  porphobilinogen deaminase  100 
 
 		 298 aa  608  1e-173  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.141584  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0354  porphobilinogen deaminase  82.31 
 
 		 298 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0542  porphobilinogen deaminase  55.86 
 
 		 292 aa  318  9e-86  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0630058  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0737  hydroxymethylbilane synthase  42.47 
 
 		 314 aa  242  5e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3202  porphobilinogen deaminase  42.47 
 
 		 309 aa  239  2.9999999999999997e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3285  porphobilinogen deaminase  42.47 
 
 		 318 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00150  porphobilinogen deaminase  39.12 
 
 		 312 aa  233  3e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.413704  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1287  porphobilinogen deaminase  40.48 
 
 		 310 aa  233  3e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3063  porphobilinogen deaminase  41.92 
 
 		 315 aa  231  1e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3234  porphobilinogen deaminase  42.86 
 
 		 318 aa  231  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00122468  normal  0.150053 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1124  porphobilinogen deaminase  42.76 
 
 		 311 aa  230  2e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.417261 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0690  porphobilinogen deaminase  43.92 
 
 		 310 aa  230  3e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0584  porphobilinogen deaminase  43.63 
 
 		 317 aa  229  4e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.415079 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2563  porphobilinogen deaminase  40.69 
 
 		 311 aa  229  6e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0487  porphobilinogen deaminase  41.36 
 
 		 313 aa  228  8e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1427  porphobilinogen deaminase  40.68 
 
 		 313 aa  228  9e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0893  porphobilinogen deaminase  41.02 
 
 		 313 aa  226  3e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2839  porphobilinogen deaminase  44.02 
 
 		 307 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3642  porphobilinogen deaminase  38.36 
 
 		 310 aa  226  5.0000000000000005e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0688  porphobilinogen deaminase  41.5 
 
 		 311 aa  225  8e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.256859 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1732  porphobilinogen deaminase  41.44 
 
 		 318 aa  224  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0335479  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0342  porphobilinogen deaminase  39.59 
 
 		 309 aa  224  1e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0502  porphobilinogen deaminase  37.8 
 
 		 310 aa  223  2e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0359  porphobilinogen deaminase  40.41 
 
 		 318 aa  223  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0685  hydroxymethylbilane synthase  40.88 
 
 		 306 aa  224  2e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.161676  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1539  porphobilinogen deaminase  41.02 
 
 		 312 aa  223  3e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0899347  hitchhiker  0.00290857 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4171  porphobilinogen deaminase  40.21 
 
 		 313 aa  222  7e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00534991  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4621  porphobilinogen deaminase  40.33 
 
 		 320 aa  222  7e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1273  porphobilinogen deaminase  43.73 
 
 		 315 aa  221  8e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3980  porphobilinogen deaminase  39.52 
 
 		 313 aa  221  9.999999999999999e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000129404  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0950  porphobilinogen deaminase  40.14 
 
 		 313 aa  221  9.999999999999999e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0408  porphobilinogen deaminase  40.14 
 
 		 318 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0408  porphobilinogen deaminase  40.14 
 
 		 318 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1887  porphobilinogen deaminase  43.13 
 
 		 314 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2621  porphobilinogen deaminase  37.33 
 
 		 316 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.995581  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1237  porphobilinogen deaminase  41.92 
 
 		 285 aa  220  1.9999999999999999e-56  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1259  porphobilinogen deaminase  42.71 
 
 		 308 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.925729  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1815  porphobilinogen deaminase  43.3 
 
 		 304 aa  220  1.9999999999999999e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.187102  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1796  porphobilinogen deaminase  39.66 
 
 		 313 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.160972  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0975  porphobilinogen deaminase  43.89 
 
 		 314 aa  219  3e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2263  porphobilinogen deaminase  37.54 
 
 		 339 aa  219  3e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3254  porphobilinogen deaminase  38.78 
 
 		 326 aa  220  3e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.290134 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1750  porphobilinogen deaminase  38.06 
 
 		 303 aa  219  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444396 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4848  porphobilinogen deaminase  43.85 
 
 		 309 aa  219  5e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0029  Hydroxymethylbilane synthase  38.1 
 
 		 316 aa  219  5e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.943678  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0502  porphobilinogen deaminase  42.81 
 
 		 312 aa  219  6e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000513467  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0406  porphobilinogen deaminase  41.44 
 
 		 311 aa  218  7e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.121842  normal  0.321807 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2030  porphobilinogen deaminase  38.64 
 
 		 303 aa  218  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.550332  normal  0.807952 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5316  porphobilinogen deaminase  43.85 
 
 		 309 aa  218  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4968  porphobilinogen deaminase  38.05 
 
 		 322 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1891  porphobilinogen deaminase  42.75 
 
 		 312 aa  218  1e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0551  porphobilinogen deaminase  47.08 
 
 		 322 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3591  porphobilinogen deaminase  39.52 
 
 		 326 aa  218  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1515  porphobilinogen deaminase  39.66 
 
 		 313 aa  217  2e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0525  porphobilinogen deaminase  44.27 
 
 		 311 aa  217  2e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0208  porphobilinogen deaminase  40 
 
 		 320 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.492293 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3568  porphobilinogen deaminase  42.23 
 
 		 321 aa  217  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.133183  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5394  porphobilinogen deaminase  43.85 
 
 		 309 aa  217  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.396186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0764  porphobilinogen deaminase  40.23 
 
 		 322 aa  217  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000120999 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002106  porphobilinogen deaminase  37.67 
 
 		 312 aa  216  2.9999999999999998e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.632133  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3667  hydroxymethylbilane synthase  36.99 
 
 		 308 aa  216  2.9999999999999998e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.135779  normal  0.514748 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0483  porphobilinogen deaminase  38.49 
 
 		 309 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00314  porphobilinogen deaminase  38.36 
 
 		 312 aa  216  5e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0044  porphobilinogen deaminase  37.83 
 
 		 321 aa  215  7e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2334  porphobilinogen deaminase  47.77 
 
 		 322 aa  215  7e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.69155  normal  0.249742 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1249  porphobilinogen deaminase  39.59 
 
 		 313 aa  214  9.999999999999999e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.280442 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3109  hydroxymethylbilane synthase  36.72 
 
 		 311 aa  214  9.999999999999999e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.324742  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0373  porphobilinogen deaminase  38.14 
 
 		 310 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3060  porphobilinogen deaminase  37.07 
 
 		 351 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0318  porphobilinogen deaminase  37.8 
 
 		 317 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5131  porphobilinogen deaminase  40.27 
 
 		 322 aa  213  2.9999999999999995e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0933  porphobilinogen deaminase  37.97 
 
 		 313 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3202  porphobilinogen deaminase  45.21 
 
 		 309 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0179  porphobilinogen deaminase  37.67 
 
 		 322 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00121296  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4170  porphobilinogen deaminase  37.46 
 
 		 318 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.473943 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03680  porphobilinogen deaminase  37.46 
 
 		 313 aa  212  5.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184348  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03629  hypothetical protein  37.46 
 
 		 313 aa  212  5.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.193331  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0471  porphobilinogen deaminase  44.4 
 
 		 316 aa  212  5.999999999999999e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.834743 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3375  porphobilinogen deaminase  37.71 
 
 		 310 aa  212  5.999999999999999e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4174  porphobilinogen deaminase  37.46 
 
 		 320 aa  212  7e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.31528  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4202  porphobilinogen deaminase  37.46 
 
 		 320 aa  212  7e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0530592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4025  porphobilinogen deaminase  37.46 
 
 		 320 aa  212  7e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.105851  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0679  porphobilinogen deaminase  47.37 
 
 		 314 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4264  porphobilinogen deaminase  37.46 
 
 		 320 aa  211  7.999999999999999e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5243  porphobilinogen deaminase  37.46 
 
 		 318 aa  211  9e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4208  porphobilinogen deaminase  40.61 
 
 		 309 aa  211  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4774  porphobilinogen deaminase  38 
 
 		 336 aa  211  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0280  porphobilinogen deaminase  38.7 
 
 		 312 aa  211  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1347  porphobilinogen deaminase  43.15 
 
 		 309 aa  211  1e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0388  porphobilinogen deaminase  38.01 
 
 		 310 aa  211  1e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.571998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3638  porphobilinogen deaminase  38.01 
 
 		 310 aa  211  1e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0440  porphobilinogen deaminase  37.41 
 
 		 309 aa  211  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0386  porphobilinogen deaminase  38.01 
 
 		 310 aa  211  1e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00551577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3530  porphobilinogen deaminase  38.23 
 
 		 303 aa  210  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4197  porphobilinogen deaminase  40.27 
 
 		 309 aa  211  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0220b  porphobilinogen deaminase  38.31 
 
 		 311 aa  211  2e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.824174  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04137  porphobilinogen deaminase  37.41 
 
 		 304 aa  210  2e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.870517  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2163  porphobilinogen deaminase  39.86 
 
 		 309 aa  210  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.138876  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1999  porphobilinogen deaminase  39.25 
 
 		 318 aa  210  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61051  decreased coverage  0.0000671123 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4313  porphobilinogen deaminase  37.67 
 
 		 310 aa  210  3e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>