130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0837 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_0837  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 342 aa  675    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2976  outer membrane efflux protein  33.63 
 
 		 352 aa  146  6e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1063  outer membrane efflux protein  31.19 
 
 		 348 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2118  hypothetical protein  31.86 
 
 		 345 aa  96.3  7e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.470052  normal  0.883427 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1524  hypothetical protein  25.54 
 
 		 347 aa  93.2  5e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.24819  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1496  outer membrane efflux protein  27.48 
 
 		 333 aa  89.4  8e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.358949  hitchhiker  0.00806092 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  25.17 
 
 		 496 aa  77  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  23.58 
 
 		 467 aa  76.3  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0580  outer membrane protein-like protein  24.36 
 
 		 328 aa  72.4  0.000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  24.61 
 
 		 463 aa  69.7  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0800  outer membrane efflux protein  25.6 
 
 		 336 aa  69.7  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2245  outer membrane efflux protein  25.82 
 
 		 333 aa  67.4  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.593421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4152  Outer membrane protein-like protein  26.15 
 
 		 366 aa  66.6  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000101728  hitchhiker  0.00000035562 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  22.98 
 
 		 462 aa  66.2  0.0000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1453  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.01 
 
 		 480 aa  64.7  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1690  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.01 
 
 		 478 aa  64.7  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3231  TolC family type I secretion outer membrane protein  30.18 
 
 		 483 aa  64.3  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  22.6 
 
 		 483 aa  64.3  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5432  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.99 
 
 		 553 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.199925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3004  putative outer TolC membrane protein  23.91 
 
 		 469 aa  61.2  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.833992 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1725  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.55 
 
 		 489 aa  61.2  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.736299  normal  0.0102072 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4008  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.66 
 
 		 562 aa  60.5  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5239  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.29 
 
 		 488 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5506  outer membrane efflux protein  23.42 
 
 		 451 aa  59.7  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0565  Outer membrane protein-like protein  23.75 
 
 		 328 aa  60.1  0.00000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5878  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.42 
 
 		 463 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.539647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4696  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.29 
 
 		 497 aa  59.3  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5161  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.29 
 
 		 488 aa  59.3  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.451764  normal  0.264948 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4235  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.61 
 
 		 463 aa  57.4  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  0.529157 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  21.94 
 
 		 463 aa  57  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  23.08 
 
 		 627 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1064  outer membrane efflux protein  28.57 
 
 		 443 aa  55.1  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.54 
 
 		 452 aa  53.1  0.000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0722  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.47 
 
 		 449 aa  53.1  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.278359  normal  0.698539 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  20.28 
 
 		 419 aa  52.8  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4505  outer membrane efflux protein  20.79 
 
 		 972 aa  52.8  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.300614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1907  Type I secretion outer membrane protein, TolC  21.95 
 
 		 472 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  21.47 
 
 		 471 aa  52.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0849  outer membrane efflux protein  24.4 
 
 		 417 aa  52.4  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000450472  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  29.52 
 
 		 470 aa  51.2  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4162  outer membrane efflux protein  22.49 
 
 		 443 aa  51.6  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000533026  normal  0.288124 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  21.5 
 
 		 453 aa  52  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2686  Outer membrane secretion protein  24.78 
 
 		 472 aa  52  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.553025  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1149  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.28 
 
 		 456 aa  51.6  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.435165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1475  outer membrane efflux protein  23 
 
 		 449 aa  50.8  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.236212  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0134  hypothetical protein  22.03 
 
 		 394 aa  50.8  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000263159  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1384  outer membrane efflux protein  18.15 
 
 		 435 aa  50.4  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.642492  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  19.81 
 
 		 419 aa  50.8  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2439  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.12 
 
 		 443 aa  50.4  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.690734 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2243  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.56 
 
 		 455 aa  50.1  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6495  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.67 
 
 		 518 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2697  type I secretion outer membrane protein, TolC  23.87 
 
 		 437 aa  49.7  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1096  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.13 
 
 		 494 aa  49.7  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01970  outer membrane efflux protein, putative  26.25 
 
 		 456 aa  49.3  0.00009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154405  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1143  outer membrane efflux protein  33.73 
 
 		 455 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0286987  normal  0.128527 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2026  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.47 
 
 		 405 aa  48.5  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.341805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3945  putative outer membrane protein tolC precursor  23.98 
 
 		 461 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.8738  normal  0.222307 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0749  Type I secretion outer membrane protein, TolC  30.17 
 
 		 497 aa  47.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1304  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.8 
 
 		 446 aa  47.8  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000151154  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  23.76 
 
 		 436 aa  47.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  22.19 
 
 		 420 aa  47.8  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3625  outer membrane efflux protein  20.19 
 
 		 525 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.262442  normal  0.276667 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2352  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.3 
 
 		 446 aa  47.4  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1228  agglutination protein  24.12 
 
 		 445 aa  47  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000902456  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0817  outer membrane protein-like protein  23.34 
 
 		 333 aa  47.4  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00431057  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  20.9 
 
 		 635 aa  47.4  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1384  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  28.05 
 
 		 484 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.285433 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0258  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.92 
 
 		 539 aa  46.6  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.17913  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4339  RND efflux system outer membrane lipoprotein  40.85 
 
 		 484 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0952934  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4429  RND efflux system outer membrane lipoprotein  28.05 
 
 		 484 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.305214  normal  0.0579633 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0134  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.35 
 
 		 450 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.675891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3558  Type I secretion outer membrane protein, TolC  20.98 
 
 		 472 aa  46.6  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.445028  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0585  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.4 
 
 		 456 aa  46.6  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.449084  normal  0.127961 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1826  Type I secretion outer membrane protein, TolC  20.6 
 
 		 487 aa  46.2  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2013  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.41 
 
 		 472 aa  46.2  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226354  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  20.89 
 
 		 419 aa  46.2  0.0009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3457  type I secretion outer membrane protein, TolC family  28.46 
 
 		 434 aa  46.2  0.0009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3904  outer membrane channel protein  29.25 
 
 		 435 aa  45.8  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2457  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.68 
 
 		 449 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2262  Type I secretion outer membrane protein, TolC  29.03 
 
 		 497 aa  45.4  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0148702  normal  0.873765 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0366  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 437 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1024  RND efflux system outer membrane lipoprotein  39.44 
 
 		 484 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.484622  normal  0.130102 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0729  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.75 
 
 		 444 aa  45.8  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000668163 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0575  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.75 
 
 		 444 aa  45.8  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2568  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.54 
 
 		 464 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2534  Type I secretion outer membrane protein, TolC  33.33 
 
 		 468 aa  44.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2711  Type I secretion outer membrane protein TolC  30.09 
 
 		 493 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1967  outer membrane efflux protein  20 
 
 		 443 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000399706  normal  0.35271 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1126  TolC family type I secretion outer membrane protein  36.96 
 
 		 450 aa  45.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0573  outer membrane channel protein  21.97 
 
 		 464 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4142  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.35 
 
 		 472 aa  45.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00647616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3563  outer membrane channel protein  30.11 
 
 		 434 aa  45.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000135514  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2120  outer membrane protein-like protein  23.31 
 
 		 374 aa  45.1  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000810254  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0654  outer membrane channel protein  21.97 
 
 		 464 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.945309  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1041  type I secretion outer membrane efflux protein  22.34 
 
 		 451 aa  44.3  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1941  outer membrane efflux protein  23.59 
 
 		 432 aa  44.7  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4322  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.62 
 
 		 501 aa  44.7  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.811491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1835  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.99 
 
 		 447 aa  44.3  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.211257  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0063  outer membrane efflux protein  22.75 
 
 		 408 aa  44.7  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0180654  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1131  outer membrane efflux protein  22.75 
 
 		 364 aa  44.3  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>