More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1028 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1028  YceI family protein  100 
 
 		 191 aa  389  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3505  YceI family protein  82.14 
 
 		 191 aa  297  5e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.781833 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3578  YceI family protein  74.35 
 
 		 192 aa  280  9e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0457  YceI family protein  63.87 
 
 		 189 aa  265  4e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2226  YceI family protein  67.71 
 
 		 192 aa  264  5e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000678562  decreased coverage  0.00447323 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3508  periplasmic protein  65.12 
 
 		 196 aa  240  1e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.234261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0469  YceI family protein  47.54 
 
 		 211 aa  203  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.730302  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3992  YceI family protein  48.69 
 
 		 188 aa  186  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2669  YceI family protein  53.49 
 
 		 193 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.115653  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2382  YceI-like family protein  51.45 
 
 		 187 aa  181  6e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.946039  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3377  YceI-like family protein  51.45 
 
 		 187 aa  181  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1273  YceI-like family protein  52.02 
 
 		 187 aa  181  6e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1160  YceI-like family protein  51.45 
 
 		 192 aa  181  7e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2568  hypothetical protein  51.45 
 
 		 192 aa  181  7e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3333  YceI  51.45 
 
 		 192 aa  181  7e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3367  hypothetical protein  51.45 
 
 		 192 aa  181  7e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0298  hypothetical protein  51.45 
 
 		 192 aa  181  7e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0683  YceI family protein  52.91 
 
 		 193 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0232  YceI  52.91 
 
 		 193 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.145864  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0716  YceI family protein  52.91 
 
 		 193 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.943663  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3804  hypothetical protein  51.16 
 
 		 211 aa  178  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7381  YceI  51.46 
 
 		 187 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.398085  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0631  YceI family protein  52.33 
 
 		 193 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0607  YceI family protein  52.33 
 
 		 195 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4183  YceI family protein  46.81 
 
 		 192 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2961  YceI family protein  47.62 
 
 		 198 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2551  YceI family protein  47.62 
 
 		 198 aa  166  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.277477  normal  0.298445 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2530  YceI family protein  46.2 
 
 		 189 aa  166  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3995  hypothetical protein  45.11 
 
 		 189 aa  166  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0645736  normal  0.347265 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2217  YceI family protein  44.81 
 
 		 199 aa  166  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0275332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0704  YceI family protein  42.11 
 
 		 193 aa  164  9e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203879  normal  0.494453 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2717  signal peptide protein  44.12 
 
 		 198 aa  162  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.999831  normal  0.128957 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5860  YceI family protein  47.62 
 
 		 192 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2953  hypothetical protein  44.05 
 
 		 196 aa  160  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.386991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1536  YceI family protein  43.75 
 
 		 191 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2066  hypothetical protein  46.43 
 
 		 192 aa  159  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0648985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1738  YceI family protein  43.75 
 
 		 188 aa  158  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1721  YceI family protein  43.75 
 
 		 188 aa  157  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.292781 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2816  YceI  41.71 
 
 		 196 aa  155  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3509  hypothetical protein  41.82 
 
 		 198 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.137598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1735  hypothetical protein  45.4 
 
 		 188 aa  153  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1799  hypothetical protein  45.78 
 
 		 188 aa  152  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1031  hypothetical protein  41.85 
 
 		 196 aa  144  6e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.608738  normal  0.0254223 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1859  YceI family protein  44.64 
 
 		 192 aa  144  6e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2796  YceI  44.38 
 
 		 189 aa  144  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.552984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1519  YceI family protein  40.1 
 
 		 191 aa  139  3e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1782  YceI  37.36 
 
 		 204 aa  135  5e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0100028 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1150  periplasmic protein  38.83 
 
 		 206 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.138125  normal  0.79265 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0815  hypothetical protein  43.15 
 
 		 197 aa  132  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.090251 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0830  YceI  43.24 
 
 		 199 aa  130  9e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0387934  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0806  YceI family protein  42.94 
 
 		 187 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3154  YceI  39.63 
 
 		 192 aa  128  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0257242  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0736  YceI family protein  45.33 
 
 		 187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.193865  normal  0.716983 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3736  YceI  35.12 
 
 		 218 aa  118  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.192641 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0790  signal peptide protein  38.24 
 
 		 189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.534784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  40.96 
 
 		 201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1126  hypothetical protein  39.18 
 
 		 237 aa  110  9e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0634937  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0912  YceI  36.11 
 
 		 188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.580537  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  38.2 
 
 		 237 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  40.94 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  37.77 
 
 		 205 aa  105  5e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1463  putative signal peptide protein  37.33 
 
 		 151 aa  105  6e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.036668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  33.82 
 
 		 213 aa  103  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03910  YceI like family  41.72 
 
 		 254 aa  104  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  33.82 
 
 		 213 aa  103  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0359  YceI family protein  43.45 
 
 		 235 aa  101  7e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1917  hypothetical protein  33.12 
 
 		 207 aa  97.1  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000543514  hitchhiker  0.00086053 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  35.5 
 
 		 214 aa  97.1  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0110  YceI family protein  32.95 
 
 		 210 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  32.8 
 
 		 179 aa  97.1  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0081  YceI  37.97 
 
 		 188 aa  97.1  2e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  36.36 
 
 		 199 aa  95.9  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2208  YceI  33.12 
 
 		 207 aa  95.9  3e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.690389  normal  0.024147 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  34.29 
 
 		 195 aa  95.9  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1199  YceI family protein  36.05 
 
 		 183 aa  93.6  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144393  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4763  YceI family protein  36.65 
 
 		 213 aa  92  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1224  hypothetical protein  34.85 
 
 		 191 aa  91.3  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.984654  normal  0.418516 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  40.68 
 
 		 201 aa  91.3  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1268  hypothetical protein  34.85 
 
 		 191 aa  91.3  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2216  hypothetical protein  34.85 
 
 		 191 aa  91.3  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933696  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2032  hypothetical protein  35.03 
 
 		 191 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0955  YceI family protein  31.75 
 
 		 186 aa  90.1  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7002  YceI family protein  30.91 
 
 		 216 aa  89  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  35.08 
 
 		 182 aa  89  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3019  putative YceI like family protein  29.38 
 
 		 216 aa  89.4  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1680  YceI family protein  32.4 
 
 		 200 aa  89.4  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1314  hypothetical protein  32.47 
 
 		 198 aa  89  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0185349  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3389  YceI family protein  33.52 
 
 		 193 aa  88.6  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.013479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1253  hypothetical protein  34.34 
 
 		 191 aa  88.6  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.845086 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1405  YceI family protein  30.73 
 
 		 201 aa  88.6  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247492 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  34.64 
 
 		 201 aa  88.2  7e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4531  YceI family protein  34.86 
 
 		 181 aa  88.2  7e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  35.15 
 
 		 205 aa  87.8  8e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1613  hypothetical protein  30.89 
 
 		 197 aa  87.8  8e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  35.63 
 
 		 183 aa  87  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1618  hypothetical protein  30.89 
 
 		 197 aa  87.4  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  32.95 
 
 		 196 aa  87.4  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2032  YceI  35 
 
 		 192 aa  87  1e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.267829  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3940  YceI family protein  35.26 
 
 		 200 aa  87.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1041  hypothetical protein  31.82 
 
 		 189 aa  87  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.570231  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>