More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0076 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0076  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 302 aa  611  9.999999999999999e-175  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2150  LysR family substrate binding transcriptional regulator  39.39 
 
 		 320 aa  211  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.651941  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2259  LysR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 314 aa  211  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2124  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  39.39 
 
 		 320 aa  209  3e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.797631  normal  0.149196 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5799  LysR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 306 aa  203  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192087 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1231  transcriptional regulator, LysR family  35.59 
 
 		 298 aa  185  9e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.214878  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1695  LysR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 299 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0814  LysR family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 295 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.35587  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2039  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 295 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.479863  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0718  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 295 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.921816  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1564  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 295 aa  176  3e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0603  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 295 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2198  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 295 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.158475  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0788  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 334 aa  177  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2111  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 295 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.308302  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3933  transcriptional regulator, LysR family  32.76 
 
 		 306 aa  176  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3079  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 300 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.149584  normal  0.0381152 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0204  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 339 aa  167  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0888  transcriptional regulator, LysR family  32.88 
 
 		 300 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2901  LysR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 325 aa  162  9e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0129461 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5799  transcriptional regulator, LysR family  35.25 
 
 		 332 aa  159  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5969  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 305 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0037011 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6469  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 305 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.113472  normal  0.0944873 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5605  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 305 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6251  LysR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 327 aa  142  8e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.3738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4763  LysR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 307 aa  142  9e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1667  LysR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 321 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1729  LysR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 291 aa  124  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0978912  normal  0.139934 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1892  LysR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 304 aa  123  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0154443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2882  LysR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 320 aa  122  8e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130369 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2124  LysR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 297 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.01237  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3622  LysR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 316 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3045  LysR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.458337  normal  0.369645 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1845  LysR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.136314  normal  0.795683 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4468  LysR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 315 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1096  transcriptional regulator, LysR family  30.3 
 
 		 297 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000448558  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2122  LysR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 297 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.303428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3400  LysR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 296 aa  116  5e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0974424  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6072  transcriptional regulator, LysR family  27.72 
 
 		 311 aa  115  8.999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5498  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.232176 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0007  LysR family transcriptional regulator  29 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0404  LysR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.480543  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4170  LysR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 349 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4692  LysR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 347 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4785  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 342 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0237769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3582  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 342 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.283353  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0569  LysR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 290 aa  112  5e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2004  LysR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 292 aa  112  7.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.079664 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1946  transcriptional regulator, LysR family  27.34 
 
 		 316 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0927  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 348 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05450  transcriptional regulator, LysR family  25.9 
 
 		 296 aa  112  8.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0434511  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1775  LysR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0671659 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3815  LysR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 361 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000407942 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1443  LysR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 311 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748078 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3349  LysR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 297 aa  109  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.89818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2263  transcriptional regulator, LysR family  28.67 
 
 		 299 aa  109  7.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3879  LysR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1507  LysR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46170  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 290 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0324298 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0960  LysR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 295 aa  106  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.234863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0007  LysR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 324 aa  106  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4100  LysR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 303 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3275  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0812122 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3926  putative transcriptional regulator  29.33 
 
 		 290 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.366969  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2257  transcriptional regulator, LysR family  35 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.304398 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4579  LysR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 303 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.263741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3810  LysR family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430923 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1310  LysR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 303 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000494191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2253  transcriptional regulator, LysR family  28.28 
 
 		 303 aa  103  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.105468  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2571  LysR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 292 aa  103  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.159237  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2419  putative DNA-binding transcriptional regulator  30.68 
 
 		 292 aa  102  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0214  transcription regulator protein  29.68 
 
 		 288 aa  101  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37220  LysR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 317 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.923921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2703  LysR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 289 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.664835 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2550  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.08 
 
 		 287 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111574 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2395  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.98 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0377245  normal  0.580313 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2348  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.08 
 
 		 287 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000261353  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2436  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.08 
 
 		 287 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0199714 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2392  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.08 
 
 		 287 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.26292  hitchhiker  0.00212314 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2440  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.08 
 
 		 287 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.924518 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02045  hypothetical protein  28.99 
 
 		 293 aa  100  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.074382  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02086  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.99 
 
 		 293 aa  100  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0640427  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2893  LysR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 288 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0897253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2758  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.92 
 
 		 288 aa  100  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0809  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.99 
 
 		 293 aa  100  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2293  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.99 
 
 		 293 aa  100  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3293  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.99 
 
 		 293 aa  100  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.020887  normal  0.438576 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2361  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 318 aa  100  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.683125  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2304  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.99 
 
 		 293 aa  100  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00791446 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2454  putative DNA-binding transcriptional regulator  28.99 
 
 		 293 aa  100  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3152  LysR family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 288 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2562  LysR family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 288 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0033  LysR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 302 aa  99.8  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000417374  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1027  LysR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 314 aa  99.4  6e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3195  putative transcriptional regulator  29.35 
 
 		 363 aa  99  9e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1403  LysR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 303 aa  99  9e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.311386  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2661  transcriptional regulator, LysR family  31.42 
 
 		 292 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.826395  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0071  putative transcriptional regulator LysR-type  29.6 
 
 		 292 aa  98.2  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000120497  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5155  LysR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 303 aa  97.8  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2132  LysR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 293 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.54811  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>