More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2664 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_2664  type II secretion system protein  100 
 
 
414 aa  824    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0873  type II secretory pathway, PilC-like  36.1 
 
 
403 aa  256  6e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  35.37 
 
 
401 aa  256  7e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  34.87 
 
 
406 aa  242  9e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1506  type II secretion system protein  32.69 
 
 
403 aa  232  1e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000781072  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1882  type II secretion system protein  30.92 
 
 
403 aa  231  2e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000492404  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  35.32 
 
 
402 aa  228  2e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  32.02 
 
 
408 aa  223  4e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1745  type II secretion system protein  31.76 
 
 
406 aa  218  1e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0875  type II secretion system protein  33.08 
 
 
409 aa  218  2e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  31.77 
 
 
409 aa  218  2e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  32.83 
 
 
401 aa  215  9e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2412  type II secretion system protein  30.31 
 
 
405 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  30.85 
 
 
406 aa  213  3.9999999999999995e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  30.1 
 
 
406 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1824  Type II secretion system F domain protein  32.75 
 
 
409 aa  213  5.999999999999999e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.608306  normal  0.597079 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  30.47 
 
 
410 aa  209  5e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  30.77 
 
 
405 aa  209  6e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0728  general secretion pathway protein F  30.9 
 
 
409 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164597  normal  0.206561 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2560  type II secretion system protein  31.64 
 
 
403 aa  207  4e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  30.52 
 
 
405 aa  206  5e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2593  type II secretion system protein  29.85 
 
 
407 aa  204  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4499  putative general secretory pathway protein F  32.35 
 
 
405 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4697  type II secretion system protein  33.33 
 
 
406 aa  202  7e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0374  type II secretion system protein  32.51 
 
 
407 aa  202  7e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.777573  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3938  general secretion pathway protein F  31.85 
 
 
405 aa  202  8e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_002936  DET1352  pilin biogenesis protein, putative  31.57 
 
 
401 aa  202  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.291747  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0407  type II secretion system protein  31.8 
 
 
419 aa  202  9.999999999999999e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1584  type II secretion system protein  31.63 
 
 
422 aa  202  9.999999999999999e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.738971  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  28.64 
 
 
405 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1105  type II secretion system protein  31.5 
 
 
404 aa  199  5e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0187302  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1164  type II secretion system protein  30.34 
 
 
401 aa  199  9e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1759  type II secretion system protein  31.82 
 
 
401 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2069  fimbrial assembly protein PilC-like  32.21 
 
 
410 aa  197  2.0000000000000003e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0890  Type II secretion system F domain protein  28.5 
 
 
403 aa  196  8.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17760  type II secretory pathway, component PulF  28.99 
 
 
416 aa  195  1e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.874552 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1134  type II secretion system protein  30.12 
 
 
401 aa  194  2e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3072  general secretion pathway protein F  31.99 
 
 
405 aa  194  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000734436 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  29.1 
 
 
405 aa  192  7e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  28.61 
 
 
405 aa  192  8e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1164  type II secretion system protein  33.16 
 
 
403 aa  192  8e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  28.47 
 
 
404 aa  192  8e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1968  Type II secretion system F domain-containing protein  30.77 
 
 
407 aa  192  8e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0079  type II secretion system protein  29.59 
 
 
401 aa  192  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1127  type II secretion system protein  28.33 
 
 
411 aa  191  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.580874  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0227  general secretion pathway protein F  30.88 
 
 
404 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0302  Type II secretion system F domain protein  30.46 
 
 
412 aa  191  2.9999999999999997e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.923196  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1638  type II secretion system protein  30.67 
 
 
404 aa  190  5e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1612  type II secretion system protein  30.67 
 
 
404 aa  190  5e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2271  type II secretion system protein F  28.47 
 
 
401 aa  190  5e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0009  general secretion pathway protein F  30.63 
 
 
405 aa  189  8e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1029  type II secretion system protein  30.81 
 
 
405 aa  189  9e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142759 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2569  type II secretion system protein F  28.3 
 
 
401 aa  189  1e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  30.05 
 
 
417 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0009  general secretion pathway protein F  30.38 
 
 
405 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3026  type II secretion system protein  28.11 
 
 
417 aa  187  3e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  29.8 
 
 
417 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1023  type II secretion system protein  28.96 
 
 
401 aa  187  4e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  29.35 
 
 
405 aa  187  4e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0061  general secretion pathway protein F  30.63 
 
 
405 aa  186  5e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2784  general secretion pathway protein F  30.13 
 
 
405 aa  186  5e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3516  general secretion pathway protein F  30.13 
 
 
405 aa  186  5e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632046  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0009  general secretion pathway protein F  30.13 
 
 
405 aa  186  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0222  general secretion pathway protein F  30.13 
 
 
405 aa  186  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1888  general secretion pathway protein F  30.13 
 
 
405 aa  186  5e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.266018  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0624  type II secretion system protein  30.05 
 
 
417 aa  186  5e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2664  general secretion pathway protein F  30.13 
 
 
405 aa  186  5e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2707  type II secretion system protein  29.57 
 
 
401 aa  186  8e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.315565 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4184  type II secretion system protein  29.43 
 
 
404 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.130479 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2849  type II secretion system protein  30.56 
 
 
403 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3554  type II secretion system protein  29.46 
 
 
401 aa  184  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0425  type II secretion system protein  29.57 
 
 
406 aa  184  3e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126236  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03178  general secretory pathway component, cryptic  29.41 
 
 
398 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0386  general secretion pathway protein F  29.41 
 
 
398 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0386  general secretion pathway protein F  29.41 
 
 
398 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03129  hypothetical protein  29.41 
 
 
398 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0174  type II secretion system protein  29.71 
 
 
405 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3521  general secretion pathway protein F  29.41 
 
 
398 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.373913  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0970  type II secretion system protein  31.41 
 
 
417 aa  184  4.0000000000000006e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1997  Type II secretion system F domain protein  30 
 
 
407 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2101  type II secretion system protein  29.16 
 
 
404 aa  183  6e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0719  general secretion pathway protein F  30.83 
 
 
409 aa  182  8.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.975907  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0718  general secretion pathway protein F  30.83 
 
 
409 aa  182  8.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0684  general secretion pathway protein F  29.65 
 
 
409 aa  182  9.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2610  general secretion pathway protein F  29.83 
 
 
412 aa  182  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.555556  normal  0.906322 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1301  general secretion pathway protein F  29.46 
 
 
408 aa  181  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4826  Type II secretion system F domain protein  29.35 
 
 
403 aa  181  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.590317 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1346  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, type I  27.94 
 
 
400 aa  181  2.9999999999999997e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0156  type II secretion system protein  29.06 
 
 
402 aa  180  4e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1723  Type II secretion system F domain protein  33.72 
 
 
409 aa  180  4e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1390  type II secretion system protein  28.86 
 
 
404 aa  179  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387943  normal  0.0225351 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0669  type II secretion system protein  28.33 
 
 
419 aa  178  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0398046  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0533  type II secretion system protein  28.33 
 
 
402 aa  178  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0146  general secretion pathway protein F  28.23 
 
 
407 aa  177  3e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4589  general secretion pathway protein F  29.19 
 
 
413 aa  176  5e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3565  general secretion pathway protein F  28.61 
 
 
407 aa  177  5e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002544  type 4 fimbrial assembly protein PilC  31.56 
 
 
407 aa  176  5e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000177594  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1053  type II secretion system protein  31.52 
 
 
401 aa  176  8e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000304141  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3173  general secretion pathway protein F  29.43 
 
 
403 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.131882  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03470  hypothetical protein  29.9 
 
 
407 aa  175  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>