114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2039 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_2039  Recombinase  100 
 
 
275 aa  562  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  26.1 
 
 
562 aa  74.3  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  26.51 
 
 
494 aa  72.8  0.000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  25.17 
 
 
558 aa  71.2  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2352  resolvase domain-containing protein  24.16 
 
 
564 aa  70.5  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0105  recombinase  25.68 
 
 
549 aa  68.9  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0106317 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0974  Resolvase domain protein  27.84 
 
 
513 aa  63.9  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  23.74 
 
 
462 aa  63.9  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3842  Resolvase domain  25.34 
 
 
626 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445575  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5404  Recombinase  23.85 
 
 
738 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173362  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  23.1 
 
 
506 aa  59.7  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1616  Resolvase domain  23.93 
 
 
565 aa  58.9  0.00000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3123  recombinase  24.58 
 
 
552 aa  57.4  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3843  Resolvase domain  21.29 
 
 
707 aa  57  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  27.75 
 
 
534 aa  56.6  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  27.17 
 
 
534 aa  57  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1294  recombinase  28.57 
 
 
475 aa  57  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3135  recombinase  26 
 
 
551 aa  56.6  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  26.59 
 
 
534 aa  56.6  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  27.17 
 
 
534 aa  57  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0551  site-specific recombinase  28.05 
 
 
516 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000944856 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0627  site-specific recombinase  28.28 
 
 
516 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  26.59 
 
 
534 aa  55.8  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  26.59 
 
 
534 aa  56.2  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  25.58 
 
 
662 aa  55.8  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  27.27 
 
 
665 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  24.65 
 
 
558 aa  55.5  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  24.73 
 
 
515 aa  53.9  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1561  resolvase-like protein  23.86 
 
 
546 aa  54.7  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  26.01 
 
 
537 aa  54.3  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1759  Resolvase domain  25.62 
 
 
251 aa  54.3  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.621745  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  28 
 
 
515 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  26 
 
 
487 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  22.37 
 
 
569 aa  53.1  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  26.74 
 
 
537 aa  53.5  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  24.08 
 
 
534 aa  53.1  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4182  resolvase domain-containing protein  23.39 
 
 
579 aa  52.8  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3165  recombinase  23.58 
 
 
548 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.944901  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3227  recombinase  23.58 
 
 
548 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.371696  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3177  recombinase  23.58 
 
 
548 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.560591  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  24.28 
 
 
415 aa  52.8  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3036  recombinase  24.75 
 
 
548 aa  52  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  23.05 
 
 
540 aa  51.6  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  26.16 
 
 
525 aa  51.6  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4097  Recombinase  29.8 
 
 
575 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.667971  normal  0.110676 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  23.55 
 
 
522 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4107  site-specific recombinase  30.67 
 
 
564 aa  50.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  30.22 
 
 
484 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2604  resolvase family site-specific recombinase  22.88 
 
 
552 aa  50.1  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0107725  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1345  recombinase  30.12 
 
 
515 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.667193 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2841  resolvase  25.79 
 
 
336 aa  49.7  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.8273  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  22.48 
 
 
485 aa  49.7  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2432  resolvase domain-containing protein  23.31 
 
 
281 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0183379  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3623  recombinase  30.12 
 
 
515 aa  49.3  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0336  Resolvase domain  25.41 
 
 
500 aa  49.7  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.484454  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  22.5 
 
 
546 aa  49.3  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4417  recombinase  29.34 
 
 
517 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  23.39 
 
 
489 aa  48.9  0.00009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  29.86 
 
 
484 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4582  site-specific recombinase  33.07 
 
 
488 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  19.22 
 
 
475 aa  48.5  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  24 
 
 
542 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  23.56 
 
 
500 aa  47.8  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  28.31 
 
 
613 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  25.6 
 
 
445 aa  47.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  25.6 
 
 
445 aa  47.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2081  recombinase  25 
 
 
441 aa  48.1  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0665131 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1822  resolvase domain-containing protein  25.68 
 
 
576 aa  48.1  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  23.95 
 
 
542 aa  47.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  23.95 
 
 
542 aa  47.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2122  Resolvase domain protein  26.7 
 
 
547 aa  48.1  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00614032  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2336  resolvase  21.24 
 
 
532 aa  47.4  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.930487 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2945  resolvase  22.69 
 
 
550 aa  47  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  24.53 
 
 
525 aa  47  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0898  resolvase domain-containing protein  25.41 
 
 
586 aa  47.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2909  recombinase  29.45 
 
 
465 aa  47.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0979  Resolvase domain  19.17 
 
 
678 aa  47  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.127172 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  24.53 
 
 
525 aa  47  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  25.91 
 
 
479 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  21.79 
 
 
510 aa  46.2  0.0005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4608  DNA recombinase, putative  22.6 
 
 
511 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.327732  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  28.24 
 
 
553 aa  46.6  0.0005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3904  Resolvase domain protein  22.55 
 
 
460 aa  46.2  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4587  DNA recombinase, putative  22.6 
 
 
486 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2143  Recombinase  28.06 
 
 
504 aa  46.6  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0849  DNA recombinase, putative  23.89 
 
 
494 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  22.61 
 
 
546 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0106  recombinase  22.53 
 
 
597 aa  45.8  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0109495 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0853  DNA recombinase, putative  23.89 
 
 
494 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000111674 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1907  Recombinase  25 
 
 
452 aa  45.8  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195473  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4607  DNA recombinase, putative  22.53 
 
 
526 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17167  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4586  DNA recombinase, putative  22.53 
 
 
532 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7341  Resolvase domain protein  28.07 
 
 
295 aa  45.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  23.01 
 
 
527 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1686  recombinase  28.57 
 
 
231 aa  44.3  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0526693  normal  0.689393 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1145  recombinase  22.58 
 
 
549 aa  44.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  22.55 
 
 
549 aa  44.3  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0850  DNA recombinase, putative  24.76 
 
 
543 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3853  hypothetical protein  22.58 
 
 
546 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.701887 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0854  DNA recombinase, putative  24.76 
 
 
543 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000136603 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>