85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1611 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_1611  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 307 aa  635    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.413154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0419  radical SAM domain-containing protein  27.96 
 
 		 337 aa  97.4  3e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1175  radical SAM domain-containing protein  26.77 
 
 		 348 aa  87.8  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.913807  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3357  radical SAM family protein  27.57 
 
 		 384 aa  85.9  7e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.158709  normal  0.0575022 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0924  Radical SAM domain protein  25.37 
 
 		 340 aa  80.1  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3720  radical SAM domain-containing protein  28.25 
 
 		 344 aa  77  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.0048621  normal  0.524582 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2162  radical SAM domain-containing protein  30.5 
 
 		 356 aa  66.2  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.211612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2384  Radical SAM domain protein  29.5 
 
 		 364 aa  65.9  0.0000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0858  Radical SAM domain protein  31.06 
 
 		 349 aa  65.1  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0891  hypothetical protein  23.31 
 
 		 344 aa  62.4  0.000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.416371  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0390  Radical SAM domain protein  22.57 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000824452  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1410  Radical SAM domain protein  25.24 
 
 		 370 aa  57.4  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.11712  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2181  hypothetical protein  36.78 
 
 		 355 aa  55.8  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0928383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2394  radical SAM domain-containing protein  25.33 
 
 		 333 aa  55.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3375  radical SAM family protein  28.47 
 
 		 640 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  33.73 
 
 		 380 aa  53.9  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0011  Radical SAM domain protein  41.03 
 
 		 338 aa  54.3  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0899  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 345 aa  53.5  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.467857  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0913  Radical SAM domain protein  28.21 
 
 		 361 aa  51.6  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.525618  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0911  radical SAM domain-containing protein  31.87 
 
 		 497 aa  51.2  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  36.25 
 
 		 389 aa  48.9  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  32.94 
 
 		 323 aa  48.5  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  32.94 
 
 		 323 aa  48.5  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1542  Radical SAM domain protein  31.46 
 
 		 372 aa  47.8  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0085806  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4391  Radical SAM domain protein  33.64 
 
 		 327 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1985  Methyltransferase type 11  31.4 
 
 		 1000 aa  48.1  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  32.5 
 
 		 496 aa  47.4  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  35.37 
 
 		 422 aa  47.4  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1302  radical SAM domain-containing protein  34.86 
 
 		 321 aa  47  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  25.37 
 
 		 404 aa  47  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0729  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  38.55 
 
 		 380 aa  47  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701014  normal  0.10573 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0516  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 343 aa  47  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0438  radical SAM domain-containing protein  34.52 
 
 		 390 aa  46.6  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.777378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4009  radical SAM domain-containing protein  35.37 
 
 		 362 aa  46.2  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1210  Radical SAM domain protein  33.02 
 
 		 529 aa  45.8  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5161  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  35.63 
 
 		 379 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164353 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0044  Radical SAM domain protein  26.53 
 
 		 343 aa  45.4  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.671161  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1163  radical SAM domain-containing protein  25.77 
 
 		 482 aa  45.4  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00933286  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1674  Radical SAM domain protein  29.35 
 
 		 326 aa  45.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2836  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  35.23 
 
 		 381 aa  45.4  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0169  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.68 
 
 		 375 aa  45.4  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.280654  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  33.75 
 
 		 406 aa  45.4  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3555  Radical SAM domain protein  37.8 
 
 		 337 aa  45.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  33.75 
 
 		 406 aa  45.4  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1322  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  29.31 
 
 		 317 aa  45.4  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.331504  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  34.12 
 
 		 394 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3033  radical SAM domain-containing protein  29.36 
 
 		 322 aa  44.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.706026 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1988  radical SAM family protein  26.03 
 
 		 328 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.252976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0703  radical SAM domain-containing protein  37.08 
 
 		 609 aa  44.7  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1978  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  33.33 
 
 		 372 aa  44.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.633092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3047  radical SAM family protein  37.97 
 
 		 153 aa  45.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1555  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.11 
 
 		 348 aa  44.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0700995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0325  Radical SAM domain protein  30 
 
 		 333 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0444  Radical SAM domain protein  32.29 
 
 		 401 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.121875 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1335  hypothetical protein  22.5 
 
 		 363 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.861062 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3222  radical SAM domain-containing protein  24.39 
 
 		 459 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.026994  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5373  Radical SAM domain protein  35.9 
 
 		 327 aa  43.9  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  32.94 
 
 		 393 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  32.05 
 
 		 333 aa  43.9  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0919  radical SAM domain-containing protein  37.93 
 
 		 338 aa  43.5  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8971  Radical SAM domain protein  30.85 
 
 		 370 aa  43.9  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.126131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0937  radical SAM superfamily protein  29.82 
 
 		 365 aa  43.5  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.6279  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7439  Fe-S oxidoreductase-like protein  34.52 
 
 		 360 aa  43.5  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1899  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  30.59 
 
 		 234 aa  43.1  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000119044  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1034  radical SAM domain-containing protein  27.85 
 
 		 337 aa  43.5  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  32.1 
 
 		 427 aa  43.5  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2854  radical SAM domain-containing protein  26.97 
 
 		 337 aa  43.5  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2395  Radical SAM domain protein  34.09 
 
 		 394 aa  43.1  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1337  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.58 
 
 		 308 aa  43.1  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0490637  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2660  Fe-S oxidoreductase, putative coenzyme synthesis protein  28.4 
 
 		 344 aa  43.1  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1375  Fe-S oxidoreductase-like  26.96 
 
 		 377 aa  43.1  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.771753  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2175  coenzyme PQQ biosynthesis protein E  37.93 
 
 		 350 aa  42.7  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.842186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4674  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  34.48 
 
 		 389 aa  42.7  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  30.12 
 
 		 380 aa  42.7  0.008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  29.17 
 
 		 462 aa  42.7  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0763  radical SAM family protein  28.57 
 
 		 354 aa  42.7  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.959991  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2404  radical SAM family Fe-S protein  24.68 
 
 		 353 aa  42.7  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2559  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.93 
 
 		 342 aa  42.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  32.53 
 
 		 428 aa  42.4  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2456  Radical SAM domain protein  27.45 
 
 		 337 aa  42.4  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2189  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.93 
 
 		 342 aa  42.4  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28518  hitchhiker  0.000000328904 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4113  Radical SAM domain protein  27.87 
 
 		 329 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00130178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1148  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.42 
 
 		 298 aa  42.4  0.009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4074  Radical SAM domain protein  27.87 
 
 		 329 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2498  Radical SAM domain protein  27.59 
 
 		 402 aa  42.4  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.608052  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>