85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2811 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2811  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  338  2e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.222867 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4374  hypothetical protein  60.67 
 
 		 168 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.468166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4963  protein of unknown function DUF336  58.28 
 
 		 165 aa  153  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.704612  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4258  hypothetical protein  58.24 
 
 		 168 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.403324 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0990  protein of unknown function DUF336  54.05 
 
 		 167 aa  148  4e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3668  hypothetical protein  51.03 
 
 		 178 aa  144  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2430  hypothetical protein  53.95 
 
 		 168 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2495  hypothetical protein  45.18 
 
 		 171 aa  122  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.160531 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0840  hypothetical protein  46.11 
 
 		 166 aa  110  8.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.121554  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0138  hypothetical protein  46.21 
 
 		 171 aa  106  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.480574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1731  hypothetical protein  36.14 
 
 		 165 aa  99.4  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1142  protein of unknown function DUF336  37.8 
 
 		 169 aa  95.9  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.081676  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2753  hypothetical protein  38.41 
 
 		 165 aa  94  8e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1741  protein of unknown function DUF336  37.68 
 
 		 168 aa  87  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.457669 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0212  hypothetical protein  35.17 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3127  protein of unknown function DUF336  35.76 
 
 		 165 aa  82.4  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0522  hypothetical protein  37.24 
 
 		 180 aa  79.7  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2147  hypothetical protein  45.52 
 
 		 179 aa  74.7  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2446  hypothetical protein  38.64 
 
 		 163 aa  73.6  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4732  protein of unknown function DUF336  32.16 
 
 		 181 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.718897  normal  0.662354 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1122  hypothetical protein  38.64 
 
 		 167 aa  71.6  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1027  hypothetical protein  32.64 
 
 		 167 aa  68.6  0.00000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.737574  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2120  hypothetical protein  34.48 
 
 		 174 aa  68.6  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0280  hypothetical protein  34.81 
 
 		 163 aa  68.2  0.00000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000675862  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4125  hypothetical protein  39.85 
 
 		 160 aa  67  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.817005  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0150  hypothetical protein  38.17 
 
 		 172 aa  67.4  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4102  hypothetical protein  34.33 
 
 		 163 aa  65.5  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3813  hypothetical protein  41.43 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574474 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1340  hypothetical protein  37.4 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1203  hypothetical protein  37.5 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0295  protein of unknown function DUF336  26.43 
 
 		 157 aa  57  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000114767  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0487  hypothetical protein  39.25 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296207  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3788  hypothetical protein  37.84 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000219123  hitchhiker  0.00248282 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1323  hypothetical protein  35.21 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0926  hypothetical protein  39.42 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1763  protein of unknown function DUF336  31.03 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.879783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0644  protein of unknown function DUF336  41.24 
 
 		 189 aa  54.3  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4893  putative glcG protein  39.66 
 
 		 143 aa  53.5  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1418  hypothetical protein  33 
 
 		 146 aa  53.5  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.377769 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1678  ATP:cob(I)alamin adenosyltransferase  40.43 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2446  hypothetical protein  32.82 
 
 		 174 aa  53.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.299929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4527  protein of unknown function DUF336  38.05 
 
 		 144 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4158  hypothetical protein  38.05 
 
 		 144 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.693386 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0087  protein of unknown function DUF336  33.96 
 
 		 125 aa  52.4  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1201  hypothetical protein  32.52 
 
 		 180 aa  52  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.251814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4670  protein of unknown function DUF336  35.07 
 
 		 144 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3193  hypothetical protein  32.14 
 
 		 152 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.971686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1553  hypothetical protein  33.33 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3355  hypothetical protein  38.6 
 
 		 151 aa  50.1  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2792  protein of unknown function DUF336  36.52 
 
 		 167 aa  49.3  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.157155  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6928  protein of unknown function DUF336  35.16 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0574265  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4502  hypothetical protein  45.65 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3867  hypothetical protein  45.65 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0962828  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1348  hypothetical protein  40.95 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.334231 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5801  hypothetical protein  45.65 
 
 		 147 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4296  hypothetical protein  30.71 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.490359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1573  hypothetical protein  30.71 
 
 		 146 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0241263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4717  hypothetical protein  33.62 
 
 		 121 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.235141 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1162  protein of unknown function DUF336  33.96 
 
 		 166 aa  45.1  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3621  hypothetical protein  33.94 
 
 		 146 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.926955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1276  hypothetical protein  30.39 
 
 		 135 aa  44.3  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.764768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6273  hypothetical protein  36.04 
 
 		 144 aa  43.9  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0693842  normal  0.24396 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2095  hypothetical protein  31.3 
 
 		 142 aa  43.9  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08750  hypothetical protein  32.58 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1208  hypothetical protein  31.75 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.315194  normal  0.520878 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0542  hypothetical protein  33.82 
 
 		 170 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1149  hypothetical protein  40.21 
 
 		 149 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.764239  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2125  PduO protein  40.21 
 
 		 149 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.288342  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4600  protein of unknown function DUF336  29.55 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1589  hypothetical protein  40.21 
 
 		 149 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0249  hypothetical protein  40.21 
 
 		 149 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.258632  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1963  hypothetical protein  40.21 
 
 		 149 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.621473  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1982  hypothetical protein  40.21 
 
 		 149 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0687578  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0911  hypothetical protein  40.21 
 
 		 149 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.439103  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3107  protein of unknown function DUF336  38.79 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000176566  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6971  hypothetical protein  35.38 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3861  hypothetical protein  32.43 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.636119 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1777  protein of unknown function DUF336  35.85 
 
 		 144 aa  42.4  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4389  hypothetical protein  35.14 
 
 		 144 aa  42.7  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00597448  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2356  protein of unknown function DUF336  32.56 
 
 		 132 aa  42.7  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1129  hypothetical protein  32.71 
 
 		 143 aa  42  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47070  hypothetical protein  39.78 
 
 		 143 aa  42  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2388  hypothetical protein  39.8 
 
 		 149 aa  41.6  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214166  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3357  hypothetical protein  31.82 
 
 		 133 aa  41.2  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1722  hypothetical protein  31.53 
 
 		 181 aa  41.2  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0258189 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>