185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1925 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1925  putative ATPase  100 
 
 		 749 aa  1446    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.118483  hitchhiker  0.0000000000629978 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3387  Type II secretory pathway  32.34 
 
 		 284 aa  126  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4238  ATPase  29.92 
 
 		 354 aa  122  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.614005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2362  AAA ATPase  30.58 
 
 		 390 aa  121  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2396  Type II secretory pathway component ExeA (predicted ATPase)-like protein  34.85 
 
 		 427 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1982  general secretion pathway protein-related protein  31.92 
 
 		 393 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2122  AAA ATPase  31.85 
 
 		 266 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3594  putative general secretion pathway protein A  28.75 
 
 		 357 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2472  AAA ATPase  29.39 
 
 		 392 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2026  ATPase  30.38 
 
 		 385 aa  112  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.328759 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2582  AAA ATPase  34.2 
 
 		 381 aa  109  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2879  AAA ATPase  27.82 
 
 		 422 aa  109  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1621  ATPase  28.21 
 
 		 644 aa  106  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0662  ATPase  28.73 
 
 		 368 aa  106  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0528095  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1014  hypothetical protein  29.96 
 
 		 281 aa  104  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0741  AAA ATPase  32.6 
 
 		 266 aa  104  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3190  AAA ATPase  27.64 
 
 		 388 aa  104  7e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0756  AAA ATPase  32.23 
 
 		 266 aa  104  7e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00453451 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2221  general secretion pathway protein-related protein  33.95 
 
 		 267 aa  103  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0285  ATPase  31 
 
 		 341 aa  103  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4212  putative general secretion pathway protein A  27.27 
 
 		 563 aa  103  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3749  ATPase  29.1 
 
 		 271 aa  103  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1483  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.96 
 
 		 536 aa  103  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1071  AAA ATPase  26.09 
 
 		 388 aa  102  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.618974  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0833  ATPase  31.73 
 
 		 387 aa  101  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2499  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.88 
 
 		 562 aa  100  8e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000546942 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1587  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.77 
 
 		 562 aa  100  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0587648  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3145  AAA ATPase  30.04 
 
 		 266 aa  100  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2401  ATPas  28.68 
 
 		 358 aa  99.8  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.471861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2509  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  30.04 
 
 		 353 aa  99.4  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.87412 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0471  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.06 
 
 		 580 aa  99.8  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3505  secretion ATPase  31.42 
 
 		 831 aa  98.6  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000001058 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1924  hypothetical protein  28.68 
 
 		 414 aa  98.6  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.42704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0177  general secretion pathway ATPase protein  27.24 
 
 		 584 aa  98.6  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0462  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.94 
 
 		 577 aa  98.2  5e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.388723  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0328  AAA ATPase  30.74 
 
 		 291 aa  98.2  5e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.799716  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1766  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.37 
 
 		 564 aa  97.4  8e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1537  general secretion pathway protein-related protein  31.8 
 
 		 540 aa  96.7  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.259719  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0686  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  29.2 
 
 		 395 aa  97.1  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.539568 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2475  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  28.57 
 
 		 372 aa  97.1  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2978  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.14 
 
 		 562 aa  95.9  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111666  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3075  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.14 
 
 		 562 aa  96.3  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0150062  hitchhiker  0.0000100576 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2981  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.27 
 
 		 589 aa  96.3  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0901758 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4035  AAA ATPase  29.49 
 
 		 532 aa  95.9  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.267259  normal  0.70324 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2466  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.53 
 
 		 562 aa  95.5  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2219  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  28.88 
 
 		 395 aa  95.9  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0964042  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2896  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.14 
 
 		 562 aa  95.5  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.495254  hitchhiker  0.000377738 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0788  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.35 
 
 		 568 aa  95.5  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2310  ATPase  31.5 
 
 		 267 aa  95.1  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1772  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  28.21 
 
 		 372 aa  95.1  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1148  general secretion pathway protein A  27.92 
 
 		 563 aa  95.5  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.873243 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1031  AAA ATPase  27.96 
 
 		 318 aa  95.1  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550576  hitchhiker  0.00913297 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0883  AAA ATPase  28.46 
 
 		 320 aa  94.7  6e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1297  general secretion pathway protein a  27.76 
 
 		 554 aa  94  8e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3750  MSHA biogenesis protein MshM  33.85 
 
 		 314 aa  94.4  8e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.995764  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4111  MSHA biogenesis protein MshM  33.06 
 
 		 310 aa  93.2  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3404  ATPas  30.3 
 
 		 459 aa  93.6  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3157  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  28.14 
 
 		 557 aa  93.2  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.526164  normal  0.754225 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1200  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.14 
 
 		 557 aa  92.8  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2983  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.94 
 
 		 557 aa  92.8  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1233  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.14 
 
 		 557 aa  93.2  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.64745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1156  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.14 
 
 		 557 aa  93.2  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0061  general secretion pathway protein A  31 
 
 		 549 aa  92.4  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3068  AAA ATPase  30.16 
 
 		 439 aa  92.4  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.224747  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4575  MSHA biogenesis protein MshM  30.86 
 
 		 300 aa  92  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2525  ATPase  27.04 
 
 		 334 aa  92  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0430753  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0561  MSHA biogenesis protein MshM  29.79 
 
 		 308 aa  92  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.69 
 
 		 572 aa  91.3  5e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000460224  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1217  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  27.94 
 
 		 536 aa  91.3  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0686  general secretion pathway protein-related protein  31.38 
 
 		 306 aa  91.3  7e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.731417  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1009  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.38 
 
 		 587 aa  90.9  7e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00166085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2967  AAA ATPase  30.46 
 
 		 308 aa  90.9  7e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0687  general secretion pathway protein-related protein  31.38 
 
 		 306 aa  90.9  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3115  ATPase  27.99 
 
 		 341 aa  90.5  9e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.787469  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0977  AAA ATPase  25.28 
 
 		 498 aa  90.9  9e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0423306  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5029  putative general secretion pathway protein A  26.98 
 
 		 346 aa  90.1  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372214  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3485  MSHA biogenesis protein MshM  29.18 
 
 		 310 aa  90.5  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.607813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0144  AAA ATPase  26.23 
 
 		 349 aa  90.5  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1116  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.38 
 
 		 559 aa  90.1  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2735  general secretion pathway protein-related protein  36.55 
 
 		 274 aa  89.4  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.052626  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0972  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.38 
 
 		 558 aa  89.7  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176108  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1030  general secretion pathway protein A  28.73 
 
 		 320 aa  89.7  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00881191 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3056  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  27.57 
 
 		 536 aa  89.4  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0894  general secretion pathway protein, ATPase  29.28 
 
 		 275 aa  89  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0467  MSHA biogenesis protein MshM  28.07 
 
 		 309 aa  89  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02603  putative general secretion pathway protein A  28.89 
 
 		 389 aa  89  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0636367  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0390  MSHA biogenesis protein MshM  30.14 
 
 		 301 aa  89.4  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1167  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.52 
 
 		 538 aa  88.6  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00110256  hitchhiker  0.000320239 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1031  general secretion pathway protein A  30.43 
 
 		 563 aa  88.6  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0884  AAA ATPase  28.3 
 
 		 318 aa  88.2  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00859  Type II secretory pathway, component ExeA  26.53 
 
 		 541 aa  87.8  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1085  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.14 
 
 		 541 aa  87.8  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0538082  normal  0.0243335 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1638  AAA ATPase  27.97 
 
 		 291 aa  87.8  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00905579  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2332  ATPase  29.43 
 
 		 422 aa  87.4  8e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.53645  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2300  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  27.8 
 
 		 532 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3662  MSHA biogenesis protein MshM  27.72 
 
 		 309 aa  87  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0754  AAA ATPase  28.4 
 
 		 279 aa  87  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1518  AAA ATPase  26.59 
 
 		 371 aa  86.7  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0414498  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2821  MSHA biogenesis protein MshM  31.13 
 
 		 281 aa  87  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3278  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  26.87 
 
 		 364 aa  85.9  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862999  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>