77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1801 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1801  Tetratricopeptide repeat protein  100 
 
 		 186 aa  377  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0987  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.25 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00201205  hitchhiker  0.000380468 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3127  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.4 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.255476 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1473  TPR repeat-containing protein  30.11 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00324934  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2503  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 		 195 aa  64.3  0.0000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1288  TPR repeat-containing protein  31.51 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1948  tetratricopeptide domain-containing protein  30.13 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.746225  normal  0.913783 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2363  hypothetical protein  29.66 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  31.43 
 
 		 505 aa  53.5  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0668  TPR repeat-containing protein  26.35 
 
 		 209 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.541497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0070  TPR repeat-containing protein  26.38 
 
 		 201 aa  51.6  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000134059  normal  0.0131239 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  31.13 
 
 		 927 aa  50.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2615  TPR domain-containing protein  25 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  29.08 
 
 		 733 aa  49.3  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1051  TPR repeat-containing protein  26.13 
 
 		 215 aa  49.3  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  31.73 
 
 		 1737 aa  48.5  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 		 968 aa  48.1  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  30.56 
 
 		 1676 aa  47.8  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  30.23 
 
 		 653 aa  47.4  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 		 653 aa  47.4  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0827  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.26 
 
 		 190 aa  46.6  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0241049 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0954  TPR repeat-containing protein  22.22 
 
 		 350 aa  46.2  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00136407  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2936  TPR repeat-containing protein  25.86 
 
 		 200 aa  45.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.196962 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  28.7 
 
 		 594 aa  45.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.2 
 
 		 557 aa  45.1  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0927  TPR repeat-containing protein  26.81 
 
 		 291 aa  45.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 448 aa  45.4  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1384  TPR repeat-containing protein  26.12 
 
 		 870 aa  45.1  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000149301  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2201  TPR repeat-containing protein  30.91 
 
 		 556 aa  45.1  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.805282  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1463  response regulator receiver protein  27.15 
 
 		 454 aa  45.1  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.292556 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  29.17 
 
 		 1694 aa  44.7  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  30.71 
 
 		 1979 aa  44.7  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1628  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  35.29 
 
 		 924 aa  44.3  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57702  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  28.8 
 
 		 573 aa  44.3  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  24 
 
 		 344 aa  43.9  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2761  TPR repeat-containing protein  23.86 
 
 		 468 aa  43.5  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.594013  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0934  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  19.05 
 
 		 189 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  33.59 
 
 		 545 aa  43.5  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5820  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.12 
 
 		 277 aa  43.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  25.2 
 
 		 643 aa  43.5  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  26.72 
 
 		 764 aa  43.5  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  25.68 
 
 		 3301 aa  42.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  28.87 
 
 		 573 aa  42.7  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  33.02 
 
 		 566 aa  42.7  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1165  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 574 aa  42.7  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  30.49 
 
 		 573 aa  42.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  25.69 
 
 		 512 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0267  tetratricopeptide repeat domain protein  19.21 
 
 		 460 aa  42.7  0.003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0328071  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  26.09 
 
 		 1486 aa  43.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0720  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.81 
 
 		 570 aa  43.1  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2192  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 319 aa  42.7  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000199858  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  27.07 
 
 		 1005 aa  42.4  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4434  Tetratricopeptide domain protein  26.44 
 
 		 282 aa  42.4  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0712  tetratricopeptide TPR_2  33.73 
 
 		 677 aa  42.4  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3073  TPR repeat-containing protein  32.08 
 
 		 886 aa  42  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0995  tetratricopeptide TPR_2  32.76 
 
 		 614 aa  42  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129848  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4396  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.85 
 
 		 822 aa  42  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2243  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 		 311 aa  42  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.6122  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1955  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 		 311 aa  42  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0490064  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4767  sulfotransferase  23.45 
 
 		 682 aa  42  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.287127 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2204  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 		 191 aa  41.6  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0332088  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  33.63 
 
 		 3035 aa  42  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1943  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.03 
 
 		 917 aa  42  0.006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0509436 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  28.81 
 
 		 750 aa  41.6  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1796  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 216 aa  41.6  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  37.84 
 
 		 603 aa  41.6  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1364  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.23 
 
 		 264 aa  41.2  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000696413  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  26.96 
 
 		 739 aa  41.2  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  28.85 
 
 		 587 aa  41.6  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1273  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 879 aa  41.2  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3217  tetratricopeptide TPR_2  27.2 
 
 		 593 aa  41.2  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.7268  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0451  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.24 
 
 		 251 aa  41.2  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000076324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3006  response regulator receiver domain-containing protein  28.07 
 
 		 451 aa  41.2  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.883991  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3958  TPR repeat-containing protein  35.56 
 
 		 811 aa  40.8  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0310982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  26.76 
 
 		 288 aa  40.8  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  29.17 
 
 		 865 aa  40.8  0.01  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  28.93 
 
 		 3172 aa  41.2  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>