More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2092 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2092  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 187 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0540242  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  69.78 
 
 		 221 aa  249  2e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  61.5 
 
 		 215 aa  238  2.9999999999999997e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  61.29 
 
 		 216 aa  229  3e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  56.91 
 
 		 218 aa  223  1e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  56.15 
 
 		 226 aa  218  3.9999999999999997e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  52.94 
 
 		 218 aa  210  1e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  55.08 
 
 		 214 aa  206  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  50.79 
 
 		 217 aa  203  1e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  52.15 
 
 		 215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  50.8 
 
 		 214 aa  194  8.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0747  riboflavin synthase subunit alpha  54.14 
 
 		 216 aa  192  2e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  51.08 
 
 		 214 aa  192  3e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  54.26 
 
 		 217 aa  190  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  48.13 
 
 		 217 aa  189  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  48.13 
 
 		 217 aa  188  4e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4221  riboflavin synthase subunit alpha  49.73 
 
 		 214 aa  187  9e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  49.46 
 
 		 216 aa  186  2e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  58.6 
 
 		 199 aa  186  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1016  riboflavin synthase subunit alpha  49.73 
 
 		 214 aa  186  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  50.54 
 
 		 219 aa  184  8e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  51.34 
 
 		 207 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  51.81 
 
 		 223 aa  182  2.0000000000000003e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0123  riboflavin synthase, alpha subunit  50 
 
 		 239 aa  181  4.0000000000000006e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  52.13 
 
 		 227 aa  181  5.0000000000000004e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  47.85 
 
 		 216 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  47.85 
 
 		 220 aa  181  5.0000000000000004e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 		 215 aa  181  5.0000000000000004e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 		 220 aa  180  9.000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  50.27 
 
 		 221 aa  180  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  50.27 
 
 		 221 aa  180  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2779  riboflavin synthase, alpha subunit  47.85 
 
 		 211 aa  180  1e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  50.27 
 
 		 221 aa  180  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  50.27 
 
 		 221 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  49.46 
 
 		 219 aa  179  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  49.46 
 
 		 219 aa  179  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  49.72 
 
 		 216 aa  178  4e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  45.99 
 
 		 217 aa  177  5.999999999999999e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  49.46 
 
 		 217 aa  177  8e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  48.39 
 
 		 219 aa  177  8e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 		 220 aa  177  9e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4461  riboflavin synthase subunit alpha  49.46 
 
 		 220 aa  176  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  54.94 
 
 		 200 aa  176  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3942  riboflavin synthase subunit alpha  48.66 
 
 		 214 aa  176  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  48.92 
 
 		 220 aa  176  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  48.65 
 
 		 220 aa  175  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  45.95 
 
 		 217 aa  174  5e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4244  riboflavin synthase subunit alpha  48.66 
 
 		 214 aa  174  7e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4180  riboflavin synthase subunit alpha  48.66 
 
 		 214 aa  174  7e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  45.41 
 
 		 217 aa  174  7e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  54.49 
 
 		 202 aa  174  8e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  48.91 
 
 		 215 aa  174  9e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  51.79 
 
 		 221 aa  173  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0691  riboflavin synthase, alpha subunit  48.92 
 
 		 220 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  48.15 
 
 		 221 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  46.45 
 
 		 217 aa  172  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4019  riboflavin synthase subunit alpha  49.2 
 
 		 214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3852  riboflavin synthase subunit alpha  49.2 
 
 		 214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3866  riboflavin synthase subunit alpha  49.2 
 
 		 214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4134  riboflavin synthase subunit alpha  49.2 
 
 		 214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4332  riboflavin synthase subunit alpha  49.2 
 
 		 214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3023  riboflavin synthase subunit alpha  48.4 
 
 		 214 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3707  riboflavin synthase, alpha subunit  53.85 
 
 		 196 aa  171  5e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5219  riboflavin synthase, alpha subunit  50.29 
 
 		 212 aa  171  5.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1624  riboflavin synthase subunit alpha  49.21 
 
 		 219 aa  171  5.999999999999999e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.137296  normal  0.0697591 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2597  riboflavin synthase subunit alpha  50.91 
 
 		 193 aa  171  5.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195355  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  49.16 
 
 		 217 aa  171  5.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08540  riboflavin synthase, alpha subunit  45.79 
 
 		 222 aa  170  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  45.65 
 
 		 220 aa  170  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2189  riboflavin synthase subunit alpha  52.76 
 
 		 201 aa  169  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000572802 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2766  riboflavin synthase, alpha subunit  50.88 
 
 		 201 aa  169  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.210112  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11441  riboflavin synthase subunit alpha  53.42 
 
 		 201 aa  167  7e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.370285 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1227  riboflavin synthase subunit alpha  47.34 
 
 		 214 aa  167  7e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00725897 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1036  riboflavin synthase subunit alpha  45.99 
 
 		 219 aa  167  7e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00015592  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  53.01 
 
 		 223 aa  167  9e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1868  riboflavin synthase, alpha subunit  50.91 
 
 		 216 aa  167  1e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0165858  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  50.6 
 
 		 200 aa  166  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  44.02 
 
 		 218 aa  165  2.9999999999999998e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  47.85 
 
 		 213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1017  riboflavin synthase subunit alpha  47.31 
 
 		 217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.743536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1188  riboflavin synthase subunit alpha  45.21 
 
 		 221 aa  165  4e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0484679  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  53.21 
 
 		 202 aa  165  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  45.21 
 
 		 221 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00070  riboflavin synthase, alpha subunit  50 
 
 		 204 aa  164  6.9999999999999995e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  51.83 
 
 		 205 aa  164  8e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1273  riboflavin synthase subunit alpha  50.93 
 
 		 251 aa  164  8e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.373271  normal  0.402844 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  43.32 
 
 		 220 aa  164  8e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1304  riboflavin synthase, alpha subunit  48.77 
 
 		 216 aa  163  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.851086  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1163  riboflavin synthase subunit alpha  45.21 
 
 		 221 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000497127  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04971  riboflavin synthase subunit alpha  47.12 
 
 		 217 aa  162  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.372947  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01560  riboflavin synthase, alpha subunit  50.58 
 
 		 204 aa  162  2.0000000000000002e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.913253 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2097  riboflavin synthase subunit alpha  54.88 
 
 		 199 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0312217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1097  riboflavin synthase subunit alpha  45.16 
 
 		 218 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107827  normal  0.803042 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1163  riboflavin synthase subunit alpha  45.16 
 
 		 218 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166605  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3468  riboflavin synthase subunit alpha  45.16 
 
 		 218 aa  161  5.0000000000000005e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  44.62 
 
 		 217 aa  161  5.0000000000000005e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1097  riboflavin synthase subunit alpha  45.16 
 
 		 218 aa  161  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146706  normal  0.608902 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2252  riboflavin synthase subunit alpha  49.38 
 
 		 200 aa  160  9e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.743387 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  48.39 
 
 		 220 aa  160  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1189  riboflavin synthase subunit alpha  43.55 
 
 		 205 aa  159  2e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>