More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1884 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1884  DNA mismatch repair protein  100 
 
 		 640 aa  1313    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2128  DNA mismatch repair protein  43.05 
 
 		 639 aa  484  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000120986  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1696  DNA mismatch repair protein MutL  36.93 
 
 		 665 aa  438  1e-121  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.930861  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1114  DNA mismatch repair protein MutL  39.54 
 
 		 620 aa  417  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000422632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  38.01 
 
 		 603 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11660  DNA mismatch repair protein MutL  35.51 
 
 		 644 aa  417  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1203  DNA mismatch repair protein  40.12 
 
 		 619 aa  410  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.288753  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2999  DNA mismatch repair protein MutL  36.01 
 
 		 631 aa  405  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1382  DNA mismatch repair protein  34.65 
 
 		 669 aa  404  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0932721  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  37.71 
 
 		 612 aa  402  9.999999999999999e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1612  DNA mismatch repair protein  37.69 
 
 		 614 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.235254  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0526  DNA mismatch repair protein  37.14 
 
 		 668 aa  396  1e-109  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0072  DNA mismatch repair protein  36.1 
 
 		 647 aa  398  1e-109  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3802  DNA mismatch repair protein  35.42 
 
 		 647 aa  394  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.618994  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2098  DNA mismatch repair protein  36.43 
 
 		 659 aa  394  1e-108  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3539  DNA mismatch repair protein  35.01 
 
 		 644 aa  389  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0864  DNA mismatch repair protein  35.04 
 
 		 645 aa  390  1e-107  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23826  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2096  DNA mismatch repair protein  38.45 
 
 		 630 aa  392  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  38.96 
 
 		 628 aa  389  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2420  DNA mismatch repair protein  35.44 
 
 		 649 aa  389  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323655  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3780  DNA mismatch repair protein  35.42 
 
 		 647 aa  388  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0217989 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4548  DNA mismatch repair protein MutL  36.81 
 
 		 605 aa  387  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1432  DNA mismatch repair protein  35.7 
 
 		 647 aa  389  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.980701 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3867  DNA mismatch repair protein  35.42 
 
 		 647 aa  386  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3815  DNA mismatch repair protein  36.07 
 
 		 647 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  37.27 
 
 		 605 aa  388  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2517  DNA mismatch repair protein  35.57 
 
 		 656 aa  389  1e-106  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1497  DNA mismatch repair protein MutL  34.49 
 
 		 680 aa  382  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.997649  hitchhiker  0.00000153643 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0978  DNA mismatch repair protein  37.18 
 
 		 647 aa  382  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100042  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3617  DNA mismatch repair protein  36.38 
 
 		 626 aa  385  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.552847  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3509  DNA mismatch repair protein  35.33 
 
 		 647 aa  382  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3527  DNA mismatch repair protein  35.27 
 
 		 647 aa  384  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3904  DNA mismatch repair protein  36.38 
 
 		 626 aa  385  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.595251  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1172  DNA mismatch repair protein  34.79 
 
 		 674 aa  383  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3282  DNA mismatch repair protein  36.3 
 
 		 650 aa  376  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1359  DNA mismatch repair protein  34.98 
 
 		 674 aa  379  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.52416  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1924  DNA mismatch repair protein MutL  38.08 
 
 		 560 aa  374  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  35 
 
 		 647 aa  370  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1575  DNA mismatch repair protein MutL  34.58 
 
 		 648 aa  368  1e-100  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  36.09 
 
 		 606 aa  363  4e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1487  DNA mismatch repair protein MutL  35.92 
 
 		 622 aa  363  4e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.101291  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1715  DNA mismatch repair protein  36.14 
 
 		 608 aa  360  3e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233899  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2380  DNA mismatch repair protein MutL  32.54 
 
 		 695 aa  359  7e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  35.23 
 
 		 602 aa  359  9e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  34.95 
 
 		 607 aa  357  3.9999999999999996e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  35.77 
 
 		 601 aa  356  8.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0800  DNA mismatch repair protein MutL  34.38 
 
 		 586 aa  353  5e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0963  DNA mismatch repair protein MutL  36.5 
 
 		 608 aa  352  1e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2701  DNA mismatch repair protein MutL  34.92 
 
 		 626 aa  351  2e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00383046  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  35.61 
 
 		 622 aa  351  3e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  34.94 
 
 		 623 aa  351  3e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3225  DNA mismatch repair protein MutL  36.07 
 
 		 599 aa  348  2e-94  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142793  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  35.19 
 
 		 645 aa  347  6e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  34.82 
 
 		 648 aa  345  1e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0977  DNA mismatch repair ATPase  33.96 
 
 		 584 aa  345  2e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0710055  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  36.51 
 
 		 608 aa  343  5.999999999999999e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0267  DNA mismatch repair protein MutL  33.69 
 
 		 622 aa  340  5e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000997696 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  35.52 
 
 		 633 aa  340  5e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  36.07 
 
 		 632 aa  340  7e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  33.79 
 
 		 641 aa  339  7e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0481  DNA mismatch repair protein MutL  34.36 
 
 		 623 aa  338  9.999999999999999e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.324517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  35.21 
 
 		 632 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0014  DNA mismatch repair protein  32.77 
 
 		 610 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  34.46 
 
 		 632 aa  337  3.9999999999999995e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  35 
 
 		 635 aa  337  5.999999999999999e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  34.95 
 
 		 629 aa  335  2e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  34.92 
 
 		 633 aa  335  2e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  34.79 
 
 		 611 aa  333  7.000000000000001e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  33.49 
 
 		 623 aa  332  1e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  33.49 
 
 		 623 aa  332  1e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1168  DNA mismatch repair protein  34.86 
 
 		 588 aa  329  8e-89  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.985109  normal  0.444607 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1174  hypothetical protein  33.44 
 
 		 628 aa  328  2.0000000000000001e-88  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0643431 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0172  DNA mismatch repair protein MutL  33.13 
 
 		 624 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1981  DNA mismatch repair protein  32.87 
 
 		 626 aa  327  4.0000000000000003e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.201794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  34 
 
 		 625 aa  327  4.0000000000000003e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  35.67 
 
 		 644 aa  327  5e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0934  DNA mismatch repair protein  32.67 
 
 		 603 aa  326  6e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  32.82 
 
 		 600 aa  326  7e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3811  DNA mismatch repair protein MutL  32.88 
 
 		 629 aa  325  1e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2713  DNA mismatch repair protein  34.56 
 
 		 606 aa  325  2e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2933  DNA mismatch repair protein  34.2 
 
 		 612 aa  324  3e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0023  DNA mismatch repair protein MutL  31.69 
 
 		 621 aa  324  3e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000493473  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  33.18 
 
 		 600 aa  324  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1201  DNA mismatch repair protein  32.82 
 
 		 611 aa  324  3e-87  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.894444  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0413  DNA mismatch repair protein  33.49 
 
 		 630 aa  324  3e-87  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  35.2 
 
 		 611 aa  323  5e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0776  DNA mismatch repair protein MutL  46.57 
 
 		 755 aa  323  5e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.287224  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1041  DNA mismatch repair protein MutL  33.18 
 
 		 606 aa  323  6e-87  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0428  DNA mismatch repair protein  32.82 
 
 		 605 aa  323  8e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3054  DNA mismatch repair protein  34.01 
 
 		 643 aa  321  1.9999999999999998e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0230443  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4032  DNA mismatch repair protein  34.26 
 
 		 597 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.733731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  32.69 
 
 		 630 aa  319  1e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  32.52 
 
 		 613 aa  317  3e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1275  DNA mismatch repair protein  33.59 
 
 		 644 aa  317  3e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0628  DNA mismatch repair protein MutL  33.59 
 
 		 582 aa  317  3e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100256  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0441  DNA mismatch repair protein  32.83 
 
 		 620 aa  317  3e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  33.54 
 
 		 626 aa  317  3e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4044  DNA mismatch repair protein MutL  35.27 
 
 		 628 aa  317  4e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816003  normal  0.310643 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0494  DNA mismatch repair protein MutL  34.46 
 
 		 626 aa  317  6e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.220055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1011  DNA mismatch repair protein MutL  34.14 
 
 		 637 aa  315  9.999999999999999e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.266056  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>