66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1838 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  65.86 
 
 		 754 aa  1001    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1838  O-antigen polymerase  100 
 
 		 785 aa  1600    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2403  O-antigen polymerase  25.68 
 
 		 509 aa  133  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.166063  normal  0.151725 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1173  hypothetical protein  31.12 
 
 		 457 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00922176  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1691  O-antigen polymerase  30 
 
 		 512 aa  113  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.121195  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1541  TPR repeat-containing protein  22.85 
 
 		 769 aa  109  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1077  O-antigen polymerase  26.73 
 
 		 433 aa  108  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.9264  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1503  binding-protein-dependent transport system protein  29.76 
 
 		 501 aa  99.4  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.200132  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3039  putative binding-protein-dependent transport system protein  29.58 
 
 		 341 aa  82.8  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.148382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02473  O-antigen polymerase  25.58 
 
 		 470 aa  82.4  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4110  O-antigen polymerase  24.19 
 
 		 930 aa  81.6  0.00000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3326  O-antigen polymerase  27.58 
 
 		 502 aa  71.2  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1388  O-antigen polymerase  26.32 
 
 		 452 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0456  hypothetical protein  23.33 
 
 		 438 aa  68.6  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2516  O-antigen polymerase  23.75 
 
 		 686 aa  64.7  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.549504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2896  O-antigen polymerase family protein  23.75 
 
 		 686 aa  64.7  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6500  O-antigen polymerase  26.89 
 
 		 794 aa  61.6  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4815  O-antigen polymerase  30.28 
 
 		 466 aa  61.6  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.629862  normal  0.577158 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1908  O-antigen polymerase  25.24 
 
 		 472 aa  61.2  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  24.12 
 
 		 773 aa  60.1  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1584  O-antigen polymerase  26.21 
 
 		 463 aa  58.5  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.791545  normal  0.565949 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4116  O-antigen polymerase  29.65 
 
 		 540 aa  58.2  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0014553  hitchhiker  0.00000561153 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0234  O-antigen polymerase  26.18 
 
 		 402 aa  56.6  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0051  O-antigen polymerase  20.13 
 
 		 735 aa  53.5  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000539528  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2212  O-antigen polymerase  25.95 
 
 		 415 aa  53.5  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0880149  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1088  O-antigen polymerase  21.84 
 
 		 737 aa  52.8  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1029  putative O-antigen polymerase, putative membrane protein  25.49 
 
 		 455 aa  52  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.384191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2975  O-antigen polymerase  26.96 
 
 		 549 aa  51.2  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.024758  decreased coverage  0.00000748304 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2384  O-antigen polymerase  23.32 
 
 		 436 aa  51.2  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.486663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02223  hypothetical protein  27.31 
 
 		 461 aa  51.2  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3579  O-antigen polymerase  26.57 
 
 		 501 aa  51.2  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0127  hypothetical protein  23.29 
 
 		 845 aa  51.2  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1703  O-antigen polymerase  26.37 
 
 		 492 aa  50.4  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  22.46 
 
 		 733 aa  50.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.95 
 
 		 810 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2985  endo-1,4-beta-xylanase protein (exopolysaccharide export)  31.5 
 
 		 474 aa  49.3  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.161318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1639  hypothetical protein  28.92 
 
 		 447 aa  49.3  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  31.2 
 
 		 824 aa  48.9  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18850  O-antigen polymerase  29.76 
 
 		 393 aa  48.1  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.72 
 
 		 878 aa  48.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2712  O-antigen polymerase  25.57 
 
 		 413 aa  47  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0646679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  20.71 
 
 		 762 aa  46.6  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3781  O-antigen polymerase  33.33 
 
 		 477 aa  46.6  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  23.17 
 
 		 1737 aa  46.6  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  29.77 
 
 		 626 aa  46.6  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0446  O-antigen polymerase  22.86 
 
 		 1070 aa  46.2  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  29.01 
 
 		 626 aa  45.8  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  29.01 
 
 		 626 aa  45.8  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  29.01 
 
 		 614 aa  45.8  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2501  O-antigen polymerase  33.04 
 
 		 784 aa  46.2  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  29.01 
 
 		 614 aa  45.8  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  29.01 
 
 		 614 aa  46.2  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  29.01 
 
 		 614 aa  45.8  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  29.01 
 
 		 614 aa  45.8  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0714  O-antigen polymerase  26.57 
 
 		 781 aa  45.4  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  23.55 
 
 		 968 aa  45.4  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  29.77 
 
 		 639 aa  45.4  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0198  O-antigen polymerase  22.5 
 
 		 874 aa  45.1  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2224  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  25.34 
 
 		 884 aa  45.1  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 		 637 aa  44.7  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0122  O-antigen polymerase  21.92 
 
 		 1065 aa  44.3  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  23.79 
 
 		 573 aa  44.3  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4268  O-antigen polymerase  28.32 
 
 		 503 aa  44.7  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1253  O-antigen polymerase  23.58 
 
 		 832 aa  44.3  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0517425 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.72 
 
 		 632 aa  44.3  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  27.11 
 
 		 615 aa  44.3  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>