124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1476 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1476  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
506 aa  1052    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3240  acetyl-CoA acetyltransferase  41.36 
 
 
517 aa  357  2.9999999999999997e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.485995 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3068  acetyl-CoA acetyltransferase  38.61 
 
 
491 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.947288 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2819  acetyl-CoA acetyltransferase  38.53 
 
 
492 aa  281  3e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0575944  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2792  acetyl-CoA acetyltransferase  38.32 
 
 
492 aa  279  8e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2836  acetyl-CoA acetyltransferase  38.32 
 
 
492 aa  279  8e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.856874  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3340  acetyl-CoA acetyltransferase  38.33 
 
 
491 aa  277  3e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0178545 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11895  acetyl-CoA acetyltransferase  38.09 
 
 
494 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.220519 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3224  acetyl-CoA acetyltransferase  34.66 
 
 
474 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.54038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3286  acetyl-CoA acetyltransferase  34.66 
 
 
474 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3235  acetyl-CoA acetyltransferase  34.66 
 
 
474 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.650899  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4325  acetyl-CoA acetyltransferase  35.73 
 
 
509 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4411  acetyl-CoA acetyltransferase  35.73 
 
 
509 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.122648  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3311  acetyl-CoA acetyltransferase  35.25 
 
 
494 aa  226  7e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.219902  normal  0.746127 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4866  acetyl-CoA acetyltransferase  33.78 
 
 
509 aa  226  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48661  normal  0.332966 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4705  acetyl-CoA acetyltransferase  35.56 
 
 
509 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0749128  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1869  acetyl-CoA acetyltransferase  34.49 
 
 
509 aa  225  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.02103 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8290  acetyl-coenzyme A synthetase  35.6 
 
 
486 aa  219  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.502294  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2912  acetyl-CoA acetyltransferase  34.24 
 
 
504 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.469352 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2502  acetyl-CoA acetyltransferase  35.37 
 
 
510 aa  213  4.9999999999999996e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.237196  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1809  acetyl-CoA acetyltransferase  31.79 
 
 
498 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.88404  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1858  acetyl-CoA acetyltransferase  33.33 
 
 
503 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4625  acetyl-CoA acetyltransferase  34.22 
 
 
439 aa  208  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20230  acetyl-CoA acetyltransferase  33.54 
 
 
515 aa  204  4e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00768675  normal  0.711797 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1956  acetyl-CoA acetyltransferase  32.35 
 
 
504 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.797319  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3607  acetyl-CoA acetyltransferase  31.46 
 
 
503 aa  186  7e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.103572  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05853  conserved hypothetical protein  27.29 
 
 
477 aa  167  4e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00153276 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3355  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.6 
 
 
797 aa  165  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0866397  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  22.96 
 
 
389 aa  75.5  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  25.31 
 
 
388 aa  65.1  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3874  hypothetical protein  24.16 
 
 
393 aa  60.5  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.573117 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  26.38 
 
 
383 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  24.61 
 
 
380 aa  59.7  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1879  putative lipid transfer protein  24.76 
 
 
379 aa  58.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0403443 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1978  hypothetical protein  25.47 
 
 
379 aa  58.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960116  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0855  acetyl-CoA C-acetyltransferase (acetoacetyl-CoA thiolase) (AcaB-10)  23.84 
 
 
385 aa  57.8  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0722065  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3588  thiolase  24.76 
 
 
379 aa  57.4  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2101  acetyl-CoA acetyltransferase  26.67 
 
 
389 aa  56.6  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0474037  hitchhiker  0.00217907 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  24.21 
 
 
379 aa  56.2  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  26.8 
 
 
390 aa  54.3  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3956  acetyl-CoA acetyltransferase  25.64 
 
 
389 aa  53.9  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358639  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1309  acetyl-CoA acetyltransferase  23.65 
 
 
387 aa  53.5  0.000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0879061 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  23.05 
 
 
382 aa  52.8  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  23.27 
 
 
388 aa  53.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2810  Thiolase  26.41 
 
 
388 aa  52.8  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0349733  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2105  thiolase  23.54 
 
 
404 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0715913  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3318  acetyl-CoA acetyltransferase  26.25 
 
 
389 aa  52.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2477  3-ketoacyl-CoA thiolase  25.71 
 
 
388 aa  52.4  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1527  acetyl-CoA acetyltransferase  32.12 
 
 
398 aa  52.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340504  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6777  acetyl-CoA acetyltransferase  26.36 
 
 
404 aa  52.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.492052 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1469  acetyl-CoA acetyltransferase  31.39 
 
 
398 aa  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.336544  hitchhiker  0.000179953 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0896  Thiolase  24.29 
 
 
388 aa  51.6  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3314  thiolase  24.04 
 
 
404 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3272  acetyl-CoA acetyltransferase  24.86 
 
 
386 aa  51.2  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1484  hypothetical protein  23.94 
 
 
389 aa  50.8  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185234  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4311  hypothetical protein  22.25 
 
 
389 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0837  acetyl-CoA acetyltransferase  26.34 
 
 
390 aa  50.4  0.00008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6481  thiolase  23.56 
 
 
388 aa  50.1  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2160  acetyl-CoA acetyltransferase  24.48 
 
 
389 aa  50.1  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0457  acetyl-CoA acetyltransferase  25.85 
 
 
391 aa  49.7  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0435  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  23.89 
 
 
387 aa  49.3  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1330  Acetyl-CoA C-acyltransferase  38.46 
 
 
402 aa  49.3  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175377  normal  0.933214 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1160  acetyl-CoA acetyltransferase  31.25 
 
 
412 aa  49.3  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2379  acetyl-CoA acetyltransferase  31.16 
 
 
396 aa  48.9  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000259099 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  28.31 
 
 
390 aa  49.3  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18950  acetyl-CoA acetyltransferase  24.06 
 
 
395 aa  48.9  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0500553  normal  0.490702 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1544  acetyl-CoA acetyltransferase  32.12 
 
 
406 aa  48.9  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4421  Thiolase  23.17 
 
 
394 aa  48.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0806685  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3558  acetyl-CoA acetyltransferase  22.6 
 
 
389 aa  48.5  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2462  acetyl-CoA acetyltransferase  23.13 
 
 
388 aa  48.5  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1828  acetyl-CoA acetyltransferase  30.71 
 
 
406 aa  47.4  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.901012  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4451  acetyl-CoA acetyltransferase  31.94 
 
 
406 aa  47.4  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1437  acetyl-CoA acetyltransferase  25.37 
 
 
392 aa  47.4  0.0006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0544817  normal  0.0152215 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1725  acetyl-CoA acetyltransferase  28.57 
 
 
413 aa  47.4  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0375657 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3361  beta-ketoadipyl CoA thiolase  33.11 
 
 
400 aa  47.4  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.100968 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2969  acetyl-CoA acetyltransferase  31.16 
 
 
391 aa  47  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3502  acetyl-CoA acetyltransferase  31.39 
 
 
403 aa  47  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0689  acetyl-CoA acetyltransferase  22.55 
 
 
431 aa  47.4  0.0007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6744  acetyl-CoA acetyltransferase  24.39 
 
 
388 aa  47  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.207207  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3100  acetyl-CoA acetyltransferase  23.79 
 
 
388 aa  47  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.514057  normal  0.0765503 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31900  acetyl-CoA acetyltransferase  30.56 
 
 
406 aa  47  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.213543  normal  0.245472 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1886  acetyl-CoA acetyltransferase  29.2 
 
 
407 aa  46.2  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0263  beta-ketoadipyl CoA thiolase  33.11 
 
 
400 aa  46.6  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1045  acetyl-CoA acetyltransferase  31.16 
 
 
406 aa  46.6  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1910  acetyl-CoA acetyltransferase  26.06 
 
 
393 aa  46.6  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.126312 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2853  acetyl-CoA acetyltransferases  29.66 
 
 
441 aa  46.6  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1301  acetyl-CoA acetyltransferase  27.46 
 
 
393 aa  46.6  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.135299  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2040  acetyl-CoA acetyltransferase  31.62 
 
 
405 aa  46.2  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.239863  normal  0.333816 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8194  lipid-transfer protein  27.93 
 
 
390 aa  46.6  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11853  probable acetyl-CoA acetyltransferase  26.24 
 
 
392 aa  46.2  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.359273  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1488  acetyl-CoA acetyltransferase  22.55 
 
 
431 aa  46.6  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1001  acetyl-CoA acetyltransferase  27.78 
 
 
400 aa  46.6  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.917064 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2370  acetyl-CoA acetyltransferase  26.47 
 
 
392 aa  46.2  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0597  Thiolase  23.04 
 
 
387 aa  46.6  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1529  thiolase  21.61 
 
 
390 aa  45.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.380974 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0859  thiolase  22.73 
 
 
389 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.823302  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1074  thiolase  23.88 
 
 
384 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4677  acetyl-CoA acetyltransferase  31.62 
 
 
405 aa  45.8  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.979867 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1384  acetyl-CoA acetyltransferase  22.94 
 
 
395 aa  45.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.657708  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3017  acetyl-CoA acetyltransferase  36.26 
 
 
400 aa  46.2  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.712178  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>