More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1828 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1472  acetyl-CoA acetyltransferase  81.03 
 
 		 406 aa  669    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0328581  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31900  acetyl-CoA acetyltransferase  77.09 
 
 		 406 aa  640    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.213543  normal  0.245472 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8569  Acetyl-CoA C-acyltransferase  77.09 
 
 		 406 aa  639    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1828  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 		 406 aa  817    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.901012  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0699  acetyl-CoA acetyltransferase  76.85 
 
 		 406 aa  632  1e-180  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0639  acetyl-CoA acetyltransferase  75.37 
 
 		 405 aa  631  1e-180  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.507963 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3121  acetyl-CoA acetyltransferase  74.88 
 
 		 406 aa  628  1e-179  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000096812 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0436  acetyl-CoA acetyltransferase  77.4 
 
 		 407 aa  622  1e-177  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0081  acetyl-CoA acetyltransferase  75.68 
 
 		 406 aa  615  1e-175  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4383  acetyl-CoA acetyltransferase  73.89 
 
 		 405 aa  615  1e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0908  acetyl-CoA acetyltransferase  73.37 
 
 		 420 aa  612  9.999999999999999e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0929  acetyl-CoA acetyltransferase  73.89 
 
 		 406 aa  611  9.999999999999999e-175  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.561764  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4152  acetyl-CoA acetyltransferase  73.4 
 
 		 405 aa  611  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4227  acetyl-CoA acetyltransferase  73.4 
 
 		 405 aa  611  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117712  normal  0.70435 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4677  acetyl-CoA acetyltransferase  73.15 
 
 		 405 aa  613  9.999999999999999e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.979867 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0851  acetyl-CoA acetyltransferase  73.61 
 
 		 420 aa  610  1e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.194541 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2040  acetyl-CoA acetyltransferase  71.67 
 
 		 405 aa  598  1e-170  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.239863  normal  0.333816 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0957  acetyl-CoA acetyltransferase  71.74 
 
 		 414 aa  594  1e-169  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.711113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11092  acetyl-CoA acetyltransferase  72.66 
 
 		 405 aa  597  1e-169  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.641884 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1371  acetyl-CoA acetyltransferase  70.62 
 
 		 404 aa  590  1e-167  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0816349  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4616  acetyl-CoA acetyltransferase  72.71 
 
 		 412 aa  571  1e-161  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1615  acetyl-CoA acetyltransferase  70.52 
 
 		 415 aa  568  1e-161  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.690139  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1045  acetyl-CoA acetyltransferase  71.43 
 
 		 406 aa  568  1e-161  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4451  acetyl-CoA acetyltransferase  68.97 
 
 		 406 aa  562  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07120  acetyl-CoA acetyltransferase  68.87 
 
 		 407 aa  559  1e-158  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.69838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1160  acetyl-CoA acetyltransferase  66.1 
 
 		 412 aa  526  1e-148  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30280  acetyl-CoA acetyltransferase  64.37 
 
 		 405 aa  516  1.0000000000000001e-145  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2347  acetyl-CoA acetyltransferase  65.1 
 
 		 404 aa  506  9.999999999999999e-143  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000971024  normal  0.0766535 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0261  acetyl-CoA acetyltransferase  55.31 
 
 		 390 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.239081  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4698  acetyl-CoA acetyltransferase  52.26 
 
 		 396 aa  410  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1706  acetyl-CoA acetyltransferase  45.39 
 
 		 395 aa  335  9e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  46.38 
 
 		 398 aa  333  2e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  47.1 
 
 		 398 aa  333  3e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4393  acetyl-CoA acetyltransferase  43.81 
 
 		 392 aa  329  6e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1886  acetyl-CoA acetyltransferase  44.55 
 
 		 391 aa  328  8e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00936644 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2058  thiolase  45.5 
 
 		 399 aa  328  9e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.35513  normal  0.039203 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2969  acetyl-CoA acetyltransferase  44.42 
 
 		 391 aa  326  4.0000000000000003e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  43.68 
 
 		 392 aa  322  5e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.867472  hitchhiker  0.0000022311 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3064  acetyl-CoA acetyltransferase  43.89 
 
 		 392 aa  322  9.000000000000001e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3087  acetyl-CoA acetyltransferase  42.45 
 
 		 390 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0301  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  44.2 
 
 		 401 aa  318  7.999999999999999e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179307  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2936  acetyl-CoA acetyltransferase  42.89 
 
 		 390 aa  317  2e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2470  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.73 
 
 		 391 aa  316  4e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.559901  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1205  acetyl-CoA acetyltransferase  42.55 
 
 		 400 aa  316  6e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000642816 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0618  Acetyl-CoA C-acyltransferase  43.37 
 
 		 400 aa  315  9.999999999999999e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.206368  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0389  acetyl-CoA acetyltransferase  43.27 
 
 		 390 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.578535  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3455  acetyl-CoA acetyltransferase  43.81 
 
 		 377 aa  314  1.9999999999999998e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0359  3-ketoacyl-CoA thiolase  43.75 
 
 		 390 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2860  acetyl-CoA acetyltransferase  45.23 
 
 		 403 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2064  beta-ketoadipyl CoA thiolase  44.34 
 
 		 400 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.664786 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5088  acetyl-CoA acetyltransferase  45.54 
 
 		 385 aa  312  4.999999999999999e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225671  normal  0.910861 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0387  acetyl-CoA acetyltransferase  43.27 
 
 		 390 aa  313  4.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4443  acetyl-CoA acetyltransferase  44.39 
 
 		 382 aa  313  4.999999999999999e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0110645 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2457  beta-ketoadipyl CoA thiolase  44.1 
 
 		 400 aa  312  7.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3723  acetyl-CoA acetyltransferase  40.33 
 
 		 392 aa  312  7.999999999999999e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4531  acetyl-CoA acetyltransferase  41.95 
 
 		 384 aa  310  2e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4755  acetyl-CoA acetyltransferase  39.95 
 
 		 393 aa  310  2.9999999999999997e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.167553  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7640  beta-ketoadipyl CoA thiolase  43.96 
 
 		 402 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.202781  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2013  acetyl-CoA acetyltransferase  43.24 
 
 		 401 aa  309  5e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.536911  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0320  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.89 
 
 		 402 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0514  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.65 
 
 		 402 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.201521  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3669  beta-ketoadipyl CoA thiolase  44.2 
 
 		 400 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3596  acetyl-CoA acetyltransferase  41.87 
 
 		 390 aa  307  3e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0816  acetyl-CoA acetyltransferase  42.27 
 
 		 398 aa  306  4.0000000000000004e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0525  beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.65 
 
 		 402 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.859351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1696  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.65 
 
 		 400 aa  306  4.0000000000000004e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.142195 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0023  3-ketoacyl-CoA thiolase  42.27 
 
 		 387 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.188213  hitchhiker  0.0000000293236 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7110  acetyl-CoA acetyltransferase  39.09 
 
 		 391 aa  305  7e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  40.24 
 
 		 392 aa  305  9.000000000000001e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000894654  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1743  acetyl-CoA acetyltransferase  44.83 
 
 		 378 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  42.27 
 
 		 387 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3795  acetyl-CoA acetyltransferase  44.06 
 
 		 378 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.143554 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1595  acetyl-CoA acetyltransferase  43.03 
 
 		 394 aa  304  2.0000000000000002e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5155  acetyl-CoA acetyltransferase  41.87 
 
 		 390 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5143  acetyl-CoA acetyltransferase  41.63 
 
 		 390 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0012  3-ketoacyl-CoA thiolase  42.03 
 
 		 387 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2248  beta-ketoadipyl CoA thiolase  43.48 
 
 		 401 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0780819  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2258  beta-ketoadipyl CoA thiolase  43.48 
 
 		 401 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.127272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1484  beta-ketoadipyl CoA thiolase  43.48 
 
 		 401 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0017  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.79 
 
 		 387 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000928533 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4834  acetyl-CoA acetyltransferase  41.87 
 
 		 390 aa  302  6.000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1305  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  43.85 
 
 		 414 aa  302  6.000000000000001e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0015  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.55 
 
 		 387 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1582  beta-ketoadipyl CoA thiolase  43.48 
 
 		 401 aa  302  7.000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1756  acetyl-CoA acetyltransferase  42.82 
 
 		 378 aa  301  9e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.404662  normal  0.415846 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0018  3-ketoacyl-CoA thiolase  42.13 
 
 		 387 aa  301  1e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.969653 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4876  acetyl-CoA acetyltransferase  41.87 
 
 		 390 aa  301  2e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4718  acetyl-CoA acetyltransferase  41.87 
 
 		 390 aa  301  2e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4733  acetyl-CoA acetyltransferase  41.87 
 
 		 390 aa  300  2e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0022  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.4 
 
 		 387 aa  301  2e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000376188 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3553  acetyl-CoA acetyltransferase  39.9 
 
 		 392 aa  300  2e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0573177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0095  acetyl-CoA acetyltransferase  41.63 
 
 		 390 aa  301  2e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5248  acetyl-CoA acetyltransferase  41.87 
 
 		 390 aa  301  2e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5117  acetyl-CoA acetyltransferase  41.87 
 
 		 390 aa  301  2e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5149  acetyl-CoA acetyltransferase  41.87 
 
 		 390 aa  301  2e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0019  3-ketoacyl-CoA thiolase  42.51 
 
 		 387 aa  300  3e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0120161 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0015  3-ketoacyl-CoA thiolase  42.51 
 
 		 387 aa  300  3e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0012  3-ketoacyl-CoA thiolase  42.51 
 
 		 387 aa  300  3e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0898923  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  42.51 
 
 		 387 aa  300  3e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.237064  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0031  3-ketoacyl-CoA thiolase  42.27 
 
 		 387 aa  300  3e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.871061  normal  0.0355813 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>