More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2860 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2860  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
403 aa  816    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2013  acetyl-CoA acetyltransferase  86.97 
 
 
401 aa  728    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.536911  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  63.48 
 
 
398 aa  502  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  62.97 
 
 
398 aa  499  1e-140  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2058  thiolase  62.31 
 
 
399 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.35513  normal  0.039203 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2698  beta-ketoadipyl CoA thiolase  63.66 
 
 
404 aa  486  1e-136  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.398036  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2321  acetyl-CoA acetyltransferase  61.15 
 
 
402 aa  483  1e-135  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0492  acetyl-CoA acetyltransferase  60.51 
 
 
402 aa  481  1e-135  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2616  beta-ketoadipyl CoA thiolase  61.56 
 
 
406 aa  478  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.232956 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0659  beta-ketoadipyl CoA thiolase  58.73 
 
 
401 aa  479  1e-134  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.993676  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0816  acetyl-CoA acetyltransferase  61.75 
 
 
398 aa  478  1e-133  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1323  acetyl-CoA acetyltransferase  59.6 
 
 
402 aa  474  1e-132  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.158351 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2825  beta-ketoadipyl CoA thiolase  60.91 
 
 
401 aa  468  9.999999999999999e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4811  beta-ketoadipyl CoA thiolase  60.6 
 
 
401 aa  465  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.346578 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2248  beta-ketoadipyl CoA thiolase  59.4 
 
 
401 aa  464  1e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0780819  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1484  beta-ketoadipyl CoA thiolase  59.4 
 
 
401 aa  464  1e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1582  beta-ketoadipyl CoA thiolase  59.4 
 
 
401 aa  463  1e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1260  beta-ketoadipyl CoA thiolase  58.73 
 
 
412 aa  462  1e-129  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1305  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  59.28 
 
 
414 aa  464  1e-129  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2258  beta-ketoadipyl CoA thiolase  59.4 
 
 
401 aa  464  1e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.127272  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1122  beta-ketoadipyl CoA thiolase  61.56 
 
 
401 aa  461  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5094  beta-ketoadipyl CoA thiolase  59.9 
 
 
400 aa  462  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05285  acetyl-CoA acetyltransferase  56.44 
 
 
404 aa  459  9.999999999999999e-129  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2629  beta-ketoadipyl CoA thiolase  61.56 
 
 
406 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.577515  normal  0.0691319 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3707  beta-ketoadipyl CoA thiolase  60.3 
 
 
405 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.394558  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1205  acetyl-CoA acetyltransferase  57.97 
 
 
400 aa  459  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000642816 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1696  beta-ketoadipyl CoA thiolase  63.32 
 
 
400 aa  461  9.999999999999999e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.142195 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4887  beta-ketoadipyl CoA thiolase  60.3 
 
 
401 aa  461  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0589853 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5022  beta-ketoadipyl CoA thiolase  59.45 
 
 
399 aa  461  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.751086  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3280  beta-ketoadipyl CoA thiolase  61.06 
 
 
406 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.939828  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2479  beta-ketoadipyl CoA thiolase  61.06 
 
 
406 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.612376  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2156  acetyl-CoA acetyltransferase  61 
 
 
404 aa  456  1e-127  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.744792  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3097  beta-ketoadipyl CoA thiolase  57.75 
 
 
404 aa  455  1e-127  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99011  hitchhiker  0.000409619 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3669  beta-ketoadipyl CoA thiolase  59.3 
 
 
400 aa  457  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2457  beta-ketoadipyl CoA thiolase  59.3 
 
 
400 aa  457  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0514  beta-ketoadipyl CoA thiolase  59.15 
 
 
402 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.201521  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3048  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.5 
 
 
403 aa  454  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.214699  normal  0.389192 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3594  beta-ketoadipyl CoA thiolase  57.92 
 
 
409 aa  452  1.0000000000000001e-126  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0636  beta-ketoadipyl CoA thiolase  60 
 
 
400 aa  452  1.0000000000000001e-126  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2690  beta-ketoadipyl CoA thiolase  59.3 
 
 
400 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0340832  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0320  beta-ketoadipyl CoA thiolase  59.4 
 
 
402 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6183  beta-ketoadipyl CoA thiolase  59.5 
 
 
401 aa  452  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3487  beta-ketoadipyl CoA thiolase  59.05 
 
 
400 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00319846  hitchhiker  0.000297737 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02790  beta-ketoadipyl CoA thiolase  59.06 
 
 
401 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0219063 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2064  beta-ketoadipyl CoA thiolase  58.79 
 
 
400 aa  451  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.664786 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4433  beta-ketoadipyl CoA thiolase  58.85 
 
 
401 aa  449  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3547  beta-ketoadipyl CoA thiolase  59.05 
 
 
405 aa  448  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.008459  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0482  beta-ketoadipyl CoA thiolase  59.05 
 
 
400 aa  448  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.807592  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2252  beta-ketoadipyl CoA thiolase  59.55 
 
 
400 aa  449  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00123839  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6797  beta-ketoadipyl CoA thiolase  59.4 
 
 
401 aa  449  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4307  3-oxoadipyl-CoA thiolase  59.6 
 
 
399 aa  450  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0844  beta-ketoadipyl CoA thiolase  60.51 
 
 
400 aa  448  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7640  beta-ketoadipyl CoA thiolase  58.46 
 
 
402 aa  450  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.202781  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6117  beta-ketoadipyl CoA thiolase  58.1 
 
 
401 aa  451  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5587  beta-ketoadipyl CoA thiolase  57.29 
 
 
400 aa  450  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1508  beta-ketoadipyl CoA thiolase  59.5 
 
 
401 aa  448  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0554104  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3536  beta-ketoadipyl CoA thiolase  59.29 
 
 
399 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0263  beta-ketoadipyl CoA thiolase  58.79 
 
 
400 aa  448  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0905  beta-ketoadipyl CoA thiolase  59.85 
 
 
402 aa  451  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0875  beta-ketoadipyl CoA thiolase  59.4 
 
 
404 aa  449  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1582  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  58.1 
 
 
424 aa  448  1e-125  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0598  beta-ketoadipyl CoA thiolase  59.75 
 
 
400 aa  451  1e-125  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.319983  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0302  beta-ketoadipyl CoA thiolase  58.6 
 
 
401 aa  448  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.480832  normal  0.217803 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0932  beta-ketoadipyl CoA thiolase  58.79 
 
 
405 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00352947  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0542  beta-ketoadipyl CoA thiolase  58.79 
 
 
400 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0885765  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1490  beta-ketoadipyl CoA thiolase  58.79 
 
 
400 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.159653  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4011  beta-ketoadipyl CoA thiolase  59.35 
 
 
399 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0170191 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0375  thiolase  59 
 
 
401 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000288796  hitchhiker  0.0000265962 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3565  beta-ketoadipyl CoA thiolase  58.79 
 
 
400 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00704584  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1812  beta-ketoadipyl CoA thiolase  58.79 
 
 
400 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0314  beta-ketoadipyl CoA thiolase  58.56 
 
 
401 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0798  beta-ketoadipyl CoA thiolase  58.79 
 
 
400 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2126  beta-ketoadipyl CoA thiolase  58.54 
 
 
400 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0525  beta-ketoadipyl CoA thiolase  58.15 
 
 
402 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.859351  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1902  beta-ketoadipyl CoA thiolase  58.79 
 
 
405 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.19346  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3574  beta-ketoadipyl CoA thiolase  58.79 
 
 
405 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.887338  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0469  beta-ketoadipyl CoA thiolase  59.05 
 
 
400 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3665  beta-ketoadipyl CoA thiolase  60.51 
 
 
400 aa  447  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3361  beta-ketoadipyl CoA thiolase  60.61 
 
 
402 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408018  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2115  beta-ketoadipyl CoA thiolase  58.79 
 
 
400 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.749553  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0635  beta-ketoadipyl CoA thiolase  58.79 
 
 
405 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211029  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0917  acetyl-CoA acetyltransferase  59.95 
 
 
412 aa  447  1.0000000000000001e-124  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0384  beta-ketoadipyl CoA thiolase  58.79 
 
 
400 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.816364  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4020  beta-ketoadipyl CoA thiolase  58.23 
 
 
401 aa  442  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0676172  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2833  beta-ketoadipyl CoA thiolase  56.93 
 
 
399 aa  443  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.164293 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2901  beta-ketoadipyl CoA thiolase  58.29 
 
 
400 aa  443  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00482281  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0879  Acetyl-CoA C-acyltransferase  58.85 
 
 
401 aa  443  1e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3718  beta-ketoadipyl CoA thiolase  59.64 
 
 
400 aa  444  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.33538  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0301  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.53 
 
 
401 aa  441  1e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179307  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0831  beta-ketoadipyl CoA thiolase  59.75 
 
 
400 aa  442  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3179  beta-ketoadipyl CoA thiolase  58.52 
 
 
399 aa  442  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.694628  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3039  beta-ketoadipyl CoA thiolase  56.46 
 
 
400 aa  442  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3361  beta-ketoadipyl CoA thiolase  57.79 
 
 
400 aa  442  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.100968 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3944  beta-ketoadipyl CoA thiolase  59.05 
 
 
402 aa  442  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0822503  normal  0.102852 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0752  beta-ketoadipyl CoA thiolase  59.05 
 
 
399 aa  439  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.842768  normal  0.454095 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5925  beta-ketoadipyl CoA thiolase  57.29 
 
 
400 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1034  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  58.54 
 
 
400 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0157191  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1231  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  57.04 
 
 
400 aa  438  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000042843  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2167  beta-ketoadipyl CoA thiolase  57.79 
 
 
400 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.34173 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0542  beta-ketoadipyl CoA thiolase  59.3 
 
 
400 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00256596  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>