More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1615 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2040  acetyl-CoA acetyltransferase  78.38 
 
 
405 aa  650    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.239863  normal  0.333816 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1615  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
415 aa  841    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.690139  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4677  acetyl-CoA acetyltransferase  77.89 
 
 
405 aa  649    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.979867 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4383  acetyl-CoA acetyltransferase  74.94 
 
 
405 aa  623  1e-177  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4152  acetyl-CoA acetyltransferase  74.69 
 
 
405 aa  622  1e-177  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4227  acetyl-CoA acetyltransferase  74.69 
 
 
405 aa  622  1e-177  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117712  normal  0.70435 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11092  acetyl-CoA acetyltransferase  75.43 
 
 
405 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.641884 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1472  acetyl-CoA acetyltransferase  72.24 
 
 
406 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0328581  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1828  acetyl-CoA acetyltransferase  70.52 
 
 
406 aa  585  1e-166  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.901012  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0081  acetyl-CoA acetyltransferase  70.34 
 
 
406 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8569  Acetyl-CoA C-acyltransferase  68.06 
 
 
406 aa  579  1e-164  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0929  acetyl-CoA acetyltransferase  68.8 
 
 
406 aa  574  1.0000000000000001e-163  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.561764  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0436  acetyl-CoA acetyltransferase  70.1 
 
 
407 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31900  acetyl-CoA acetyltransferase  68.55 
 
 
406 aa  573  1.0000000000000001e-162  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.213543  normal  0.245472 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3121  acetyl-CoA acetyltransferase  68.8 
 
 
406 aa  566  1e-160  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000096812 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0639  acetyl-CoA acetyltransferase  66.83 
 
 
405 aa  563  1.0000000000000001e-159  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.507963 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0699  acetyl-CoA acetyltransferase  69.53 
 
 
406 aa  561  1.0000000000000001e-159  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07120  acetyl-CoA acetyltransferase  67.89 
 
 
407 aa  559  1e-158  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.69838  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1371  acetyl-CoA acetyltransferase  65.27 
 
 
404 aa  541  1e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0816349  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1045  acetyl-CoA acetyltransferase  68.55 
 
 
406 aa  541  1e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4616  acetyl-CoA acetyltransferase  66.99 
 
 
412 aa  537  1e-151  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0908  acetyl-CoA acetyltransferase  60.14 
 
 
420 aa  518  1e-146  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0957  acetyl-CoA acetyltransferase  62.41 
 
 
414 aa  519  1e-146  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.711113  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0851  acetyl-CoA acetyltransferase  61.11 
 
 
420 aa  512  1e-144  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.194541 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4451  acetyl-CoA acetyltransferase  61.18 
 
 
406 aa  505  9.999999999999999e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30280  acetyl-CoA acetyltransferase  62.01 
 
 
405 aa  501  1e-141  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1160  acetyl-CoA acetyltransferase  60.77 
 
 
412 aa  499  1e-140  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2347  acetyl-CoA acetyltransferase  61.48 
 
 
404 aa  472  1e-132  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000971024  normal  0.0766535 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4698  acetyl-CoA acetyltransferase  51.42 
 
 
396 aa  406  1.0000000000000001e-112  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0261  acetyl-CoA acetyltransferase  52.46 
 
 
390 aa  402  1e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.239081  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1706  acetyl-CoA acetyltransferase  45.27 
 
 
395 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  44.29 
 
 
392 aa  317  2e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.867472  hitchhiker  0.0000022311 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4393  acetyl-CoA acetyltransferase  44.2 
 
 
392 aa  316  5e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2470  3-ketoacyl-CoA thiolase  42.58 
 
 
391 aa  316  5e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.559901  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  43.45 
 
 
398 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1886  acetyl-CoA acetyltransferase  42.47 
 
 
391 aa  312  5.999999999999999e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00936644 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0618  Acetyl-CoA C-acyltransferase  42.31 
 
 
400 aa  311  1e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.206368  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7110  acetyl-CoA acetyltransferase  41.15 
 
 
391 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  42.96 
 
 
398 aa  310  4e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1595  acetyl-CoA acetyltransferase  43.88 
 
 
394 aa  308  1.0000000000000001e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2936  acetyl-CoA acetyltransferase  42.55 
 
 
390 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2969  acetyl-CoA acetyltransferase  42.57 
 
 
391 aa  307  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3087  acetyl-CoA acetyltransferase  42.82 
 
 
390 aa  305  7e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4755  acetyl-CoA acetyltransferase  41.53 
 
 
393 aa  305  8.000000000000001e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.167553  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  40.87 
 
 
392 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000894654  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3723  acetyl-CoA acetyltransferase  40.81 
 
 
392 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0816  acetyl-CoA acetyltransferase  42.2 
 
 
398 aa  302  6.000000000000001e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3064  acetyl-CoA acetyltransferase  42.04 
 
 
392 aa  302  8.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3516  acetyl-CoA acetyltransferase  42.79 
 
 
398 aa  301  1e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4531  acetyl-CoA acetyltransferase  42.34 
 
 
384 aa  301  1e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0387  acetyl-CoA acetyltransferase  43.41 
 
 
390 aa  301  2e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2058  thiolase  42.62 
 
 
399 aa  300  4e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.35513  normal  0.039203 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0389  acetyl-CoA acetyltransferase  42.93 
 
 
390 aa  299  6e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.578535  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1305  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  43.33 
 
 
414 aa  299  6e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2860  acetyl-CoA acetyltransferase  42.82 
 
 
403 aa  298  8e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5143  acetyl-CoA acetyltransferase  42.14 
 
 
390 aa  298  1e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5155  acetyl-CoA acetyltransferase  42.14 
 
 
390 aa  298  1e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3596  acetyl-CoA acetyltransferase  41.67 
 
 
390 aa  297  2e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4085  acetyl-CoA acetyltransferase  42.69 
 
 
399 aa  297  2e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.802435  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3748  3-ketoacyl-CoA thiolase  43.61 
 
 
387 aa  297  3e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0359  3-ketoacyl-CoA thiolase  42.69 
 
 
390 aa  296  6e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5149  acetyl-CoA acetyltransferase  42.38 
 
 
390 aa  296  6e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4876  acetyl-CoA acetyltransferase  42.52 
 
 
390 aa  295  1e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4718  acetyl-CoA acetyltransferase  42.52 
 
 
390 aa  295  1e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5248  acetyl-CoA acetyltransferase  42.52 
 
 
390 aa  295  1e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5117  acetyl-CoA acetyltransferase  42.52 
 
 
390 aa  295  1e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3268  acetyl-CoA acetyltransferases  43.76 
 
 
409 aa  295  1e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4834  acetyl-CoA acetyltransferase  42.52 
 
 
390 aa  295  1e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4733  acetyl-CoA acetyltransferase  41.9 
 
 
390 aa  294  2e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2266  acetyl-CoA acetyltransferase  42.11 
 
 
390 aa  294  2e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00024775 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2013  acetyl-CoA acetyltransferase  42.13 
 
 
401 aa  294  2e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.536911  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2125  acetyl-CoA acetyltransferase  40.62 
 
 
396 aa  294  2e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.533302 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3063  acetyl-CoA acetyltransferase  42.79 
 
 
408 aa  293  3e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3953  acetyl-CoA acetyltransferase  42.35 
 
 
398 aa  294  3e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0618375  normal  0.754512 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1260  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.38 
 
 
412 aa  293  3e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2058  acetyl-CoA acetyltransferase  43.96 
 
 
395 aa  293  4e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0221  acetyl-CoA acetyltransferase  42.18 
 
 
394 aa  293  4e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0215  acetyl-CoA acetyltransferase  42.18 
 
 
394 aa  293  4e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3902  3-ketoacyl-CoA thiolase  42.89 
 
 
387 aa  293  5e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0917762  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0095  acetyl-CoA acetyltransferase  42.28 
 
 
390 aa  293  5e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5109  acetyl-CoA acetyltransferase  40.19 
 
 
392 aa  292  8e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0098  acetyl-CoA acetyltransferase  40.33 
 
 
400 aa  291  1e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.223566  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0595  acetyl-CoA acetyltransferase  42.35 
 
 
398 aa  291  1e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.837144 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2460  acetyl-CoA acetyltransferase  42.62 
 
 
392 aa  291  1e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1803  acetyl-CoA acetyltransferase  42.34 
 
 
390 aa  290  2e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3474  acetyl-CoA acetyltransferase  42.22 
 
 
399 aa  291  2e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.158133  normal  0.651546 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4308  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.83 
 
 
387 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0260  3-ketoacyl-CoA thiolase  42.31 
 
 
387 aa  290  3e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.126316 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4261  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.83 
 
 
387 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.680475  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0574  acetyl-CoA acetyltransferase  42.12 
 
 
398 aa  290  3e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1340  acetyl-CoA acetyltransferase  41.88 
 
 
398 aa  289  8e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4212  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.59 
 
 
387 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0970  acetyl-CoA acetyltransferase  42.75 
 
 
393 aa  288  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4368  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.59 
 
 
387 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4189  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.59 
 
 
387 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0350  acetyl-CoA acetyltransferase  40.52 
 
 
399 aa  287  2e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6698  acetyl-CoA acetyltransferase  40.92 
 
 
388 aa  287  2.9999999999999996e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1205  acetyl-CoA acetyltransferase  40.58 
 
 
400 aa  287  2.9999999999999996e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000642816 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  41.89 
 
 
392 aa  287  2.9999999999999996e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0387  acetyl-CoA acetyltransferase  41.98 
 
 
399 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.441681 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>