More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2457 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_3574  beta-ketoadipyl CoA thiolase  81 
 
 
405 aa  669    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.887338  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0798  beta-ketoadipyl CoA thiolase  81 
 
 
400 aa  670    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2064  beta-ketoadipyl CoA thiolase  98 
 
 
400 aa  795    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.664786 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5925  beta-ketoadipyl CoA thiolase  81.75 
 
 
400 aa  674    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2252  beta-ketoadipyl CoA thiolase  93.75 
 
 
400 aa  742    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00123839  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0635  beta-ketoadipyl CoA thiolase  81 
 
 
405 aa  669    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211029  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2690  beta-ketoadipyl CoA thiolase  79.5 
 
 
400 aa  665    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0340832  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3767  beta-ketoadipyl CoA thiolase  83.5 
 
 
400 aa  672    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3944  beta-ketoadipyl CoA thiolase  78.2 
 
 
402 aa  647    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0822503  normal  0.102852 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0867  beta-ketoadipyl CoA thiolase  79 
 
 
402 aa  645    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.865704  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0542  beta-ketoadipyl CoA thiolase  81 
 
 
400 aa  670    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0885765  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1490  beta-ketoadipyl CoA thiolase  81 
 
 
400 aa  670    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.159653  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3665  beta-ketoadipyl CoA thiolase  78.25 
 
 
400 aa  642    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1902  beta-ketoadipyl CoA thiolase  81 
 
 
405 aa  669    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.19346  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5587  beta-ketoadipyl CoA thiolase  85.75 
 
 
400 aa  706    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0932  beta-ketoadipyl CoA thiolase  81 
 
 
405 aa  669    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00352947  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3565  beta-ketoadipyl CoA thiolase  81 
 
 
400 aa  670    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00704584  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1812  beta-ketoadipyl CoA thiolase  81 
 
 
400 aa  670    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3629  beta-ketoadipyl CoA thiolase  80.75 
 
 
400 aa  647    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000820943  normal  0.547092 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2115  beta-ketoadipyl CoA thiolase  81 
 
 
400 aa  670    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.749553  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3547  beta-ketoadipyl CoA thiolase  81 
 
 
405 aa  669    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.008459  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0263  beta-ketoadipyl CoA thiolase  82.75 
 
 
400 aa  686    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4902  beta-ketoadipyl CoA thiolase  83.25 
 
 
400 aa  665    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.151617  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2126  beta-ketoadipyl CoA thiolase  80.75 
 
 
400 aa  667    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2901  beta-ketoadipyl CoA thiolase  80.5 
 
 
400 aa  666    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00482281  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0384  beta-ketoadipyl CoA thiolase  81 
 
 
400 aa  670    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.816364  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4433  beta-ketoadipyl CoA thiolase  78.2 
 
 
401 aa  648    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1231  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  79.25 
 
 
400 aa  654    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000042843  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2136  beta-ketoadipyl CoA thiolase  79.25 
 
 
401 aa  648    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.324266  hitchhiker  0.00675242 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0469  beta-ketoadipyl CoA thiolase  79.25 
 
 
400 aa  655    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5246  beta-ketoadipyl CoA thiolase  82.75 
 
 
400 aa  663    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2167  beta-ketoadipyl CoA thiolase  81.5 
 
 
400 aa  675    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.34173 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3669  beta-ketoadipyl CoA thiolase  87.25 
 
 
400 aa  714    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0472  beta-ketoadipyl CoA thiolase  81.75 
 
 
400 aa  641    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0423781  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2563  beta-ketoadipyl CoA thiolase  81.75 
 
 
400 aa  654    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2998  beta-ketoadipyl CoA thiolase  83.25 
 
 
400 aa  665    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2852  beta-ketoadipyl CoA thiolase  81.75 
 
 
400 aa  654    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0252423  normal  0.507023 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0514  beta-ketoadipyl CoA thiolase  81.5 
 
 
400 aa  652    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107177  normal  0.646425 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0482  beta-ketoadipyl CoA thiolase  81.25 
 
 
400 aa  672    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.807592  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0844  beta-ketoadipyl CoA thiolase  78.25 
 
 
400 aa  642    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0447  beta-ketoadipyl CoA thiolase  82 
 
 
400 aa  640    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4717  beta-ketoadipyl CoA thiolase  82.75 
 
 
406 aa  664    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2457  beta-ketoadipyl CoA thiolase  100 
 
 
400 aa  807    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0542  beta-ketoadipyl CoA thiolase  81.75 
 
 
400 aa  654    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00256596  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5368  beta-ketoadipyl CoA thiolase  83.25 
 
 
400 aa  665    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.360889  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3361  beta-ketoadipyl CoA thiolase  84.25 
 
 
400 aa  693    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.100968 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0831  beta-ketoadipyl CoA thiolase  77.75 
 
 
400 aa  638    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3487  beta-ketoadipyl CoA thiolase  79.5 
 
 
400 aa  657    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00319846  hitchhiker  0.000297737 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0226  beta-ketoadipyl CoA thiolase  78.5 
 
 
400 aa  624  1e-178  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.206359  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1034  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  74.75 
 
 
400 aa  626  1e-178  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0157191  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6117  beta-ketoadipyl CoA thiolase  75.75 
 
 
401 aa  624  1e-178  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0302  beta-ketoadipyl CoA thiolase  75.44 
 
 
401 aa  623  1e-177  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.480832  normal  0.217803 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0879  Acetyl-CoA C-acyltransferase  75.38 
 
 
401 aa  619  1e-176  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2698  beta-ketoadipyl CoA thiolase  76.19 
 
 
404 aa  615  1e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.398036  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3097  beta-ketoadipyl CoA thiolase  74.44 
 
 
404 aa  613  9.999999999999999e-175  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99011  hitchhiker  0.000409619 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1508  beta-ketoadipyl CoA thiolase  76.56 
 
 
401 aa  608  1e-173  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0554104  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5094  beta-ketoadipyl CoA thiolase  74 
 
 
400 aa  605  9.999999999999999e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5563  beta-ketoadipyl CoA thiolase  76.44 
 
 
403 aa  607  9.999999999999999e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0636  beta-ketoadipyl CoA thiolase  74.69 
 
 
400 aa  602  1.0000000000000001e-171  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6797  beta-ketoadipyl CoA thiolase  75.06 
 
 
401 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1198  beta-ketoadipyl CoA thiolase  76.63 
 
 
401 aa  601  1.0000000000000001e-171  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3718  beta-ketoadipyl CoA thiolase  74 
 
 
400 aa  599  1e-170  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.33538  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0598  beta-ketoadipyl CoA thiolase  74.44 
 
 
400 aa  600  1e-170  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.319983  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1696  beta-ketoadipyl CoA thiolase  74.75 
 
 
400 aa  595  1e-169  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.142195 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4811  beta-ketoadipyl CoA thiolase  72.07 
 
 
401 aa  596  1e-169  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.346578 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5883  beta-ketoadipyl CoA thiolase  74.06 
 
 
401 aa  594  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2825  beta-ketoadipyl CoA thiolase  71.57 
 
 
401 aa  592  1e-168  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4020  beta-ketoadipyl CoA thiolase  72.32 
 
 
401 aa  593  1e-168  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0676172  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0375  thiolase  74.56 
 
 
401 aa  589  1e-167  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000288796  hitchhiker  0.0000265962 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2629  beta-ketoadipyl CoA thiolase  72.82 
 
 
406 aa  587  1e-166  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.577515  normal  0.0691319 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3548  beta-ketoadipyl CoA thiolase  77.39 
 
 
403 aa  586  1e-166  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.608439  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2871  beta-ketoadipyl CoA thiolase  77.39 
 
 
403 aa  586  1e-166  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5022  beta-ketoadipyl CoA thiolase  72.75 
 
 
399 aa  587  1e-166  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.751086  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0752  beta-ketoadipyl CoA thiolase  72 
 
 
399 aa  581  1.0000000000000001e-165  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.842768  normal  0.454095 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4011  beta-ketoadipyl CoA thiolase  71.25 
 
 
399 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0170191 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2616  beta-ketoadipyl CoA thiolase  71.32 
 
 
406 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.232956 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4307  3-oxoadipyl-CoA thiolase  70.75 
 
 
399 aa  577  1e-164  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3536  beta-ketoadipyl CoA thiolase  71.75 
 
 
399 aa  580  1e-164  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0314  beta-ketoadipyl CoA thiolase  71.93 
 
 
401 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3179  beta-ketoadipyl CoA thiolase  71.5 
 
 
399 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.694628  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02790  beta-ketoadipyl CoA thiolase  71.68 
 
 
401 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0219063 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3280  beta-ketoadipyl CoA thiolase  72.68 
 
 
406 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.939828  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2479  beta-ketoadipyl CoA thiolase  72.43 
 
 
406 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.612376  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2833  beta-ketoadipyl CoA thiolase  71 
 
 
399 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.164293 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0650  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  72.82 
 
 
401 aa  573  1.0000000000000001e-162  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0320  beta-ketoadipyl CoA thiolase  68.08 
 
 
402 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3039  beta-ketoadipyl CoA thiolase  68 
 
 
400 aa  571  1.0000000000000001e-162  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2248  beta-ketoadipyl CoA thiolase  69.33 
 
 
401 aa  568  1e-161  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0780819  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1017  beta-ketoadipyl CoA thiolase  70.82 
 
 
400 aa  568  1e-161  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.473484  hitchhiker  0.0000869499 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1269  beta-ketoadipyl CoA thiolase  70.82 
 
 
401 aa  570  1e-161  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.690521  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0525  beta-ketoadipyl CoA thiolase  67.58 
 
 
402 aa  570  1e-161  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.859351  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0301  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  68.33 
 
 
401 aa  570  1e-161  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179307  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0514  beta-ketoadipyl CoA thiolase  67.83 
 
 
402 aa  570  1e-161  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.201521  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4887  beta-ketoadipyl CoA thiolase  69.33 
 
 
401 aa  568  1e-161  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0589853 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1484  beta-ketoadipyl CoA thiolase  69.08 
 
 
401 aa  566  1e-160  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7640  beta-ketoadipyl CoA thiolase  67.33 
 
 
402 aa  566  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.202781  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1582  beta-ketoadipyl CoA thiolase  69.08 
 
 
401 aa  565  1e-160  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1260  beta-ketoadipyl CoA thiolase  67.58 
 
 
412 aa  565  1e-160  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2258  beta-ketoadipyl CoA thiolase  69.08 
 
 
401 aa  566  1e-160  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.127272  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1122  beta-ketoadipyl CoA thiolase  72.07 
 
 
401 aa  567  1e-160  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>