More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0908 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0908  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 		 420 aa  848    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0957  acetyl-CoA acetyltransferase  78.16 
 
 		 414 aa  651    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.711113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0851  acetyl-CoA acetyltransferase  92.86 
 
 		 420 aa  793    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.194541 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0929  acetyl-CoA acetyltransferase  73.61 
 
 		 406 aa  617  1e-175  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.561764  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8569  Acetyl-CoA C-acyltransferase  73.37 
 
 		 406 aa  617  1e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0639  acetyl-CoA acetyltransferase  71.91 
 
 		 405 aa  616  1e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.507963 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31900  acetyl-CoA acetyltransferase  72.4 
 
 		 406 aa  611  9.999999999999999e-175  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.213543  normal  0.245472 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1828  acetyl-CoA acetyltransferase  73.37 
 
 		 406 aa  612  9.999999999999999e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.901012  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3121  acetyl-CoA acetyltransferase  71.43 
 
 		 406 aa  609  1e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000096812 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1472  acetyl-CoA acetyltransferase  70.94 
 
 		 406 aa  608  1e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0328581  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0699  acetyl-CoA acetyltransferase  73.12 
 
 		 406 aa  608  1e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1371  acetyl-CoA acetyltransferase  69.42 
 
 		 404 aa  588  1e-167  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0816349  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0081  acetyl-CoA acetyltransferase  69.57 
 
 		 406 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0436  acetyl-CoA acetyltransferase  70.29 
 
 		 407 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4616  acetyl-CoA acetyltransferase  71.19 
 
 		 412 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11092  acetyl-CoA acetyltransferase  69.42 
 
 		 405 aa  569  1e-161  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.641884 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4383  acetyl-CoA acetyltransferase  66.83 
 
 		 405 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4152  acetyl-CoA acetyltransferase  66.34 
 
 		 405 aa  559  1e-158  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4227  acetyl-CoA acetyltransferase  66.34 
 
 		 405 aa  559  1e-158  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117712  normal  0.70435 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2040  acetyl-CoA acetyltransferase  66.59 
 
 		 405 aa  557  1e-157  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.239863  normal  0.333816 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4451  acetyl-CoA acetyltransferase  67.31 
 
 		 406 aa  555  1e-157  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4677  acetyl-CoA acetyltransferase  66.1 
 
 		 405 aa  552  1e-156  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.979867 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1045  acetyl-CoA acetyltransferase  66.34 
 
 		 406 aa  541  1e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07120  acetyl-CoA acetyltransferase  65.38 
 
 		 407 aa  536  1e-151  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.69838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1160  acetyl-CoA acetyltransferase  64.35 
 
 		 412 aa  506  9.999999999999999e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1615  acetyl-CoA acetyltransferase  60.14 
 
 		 415 aa  503  1e-141  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.690139  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30280  acetyl-CoA acetyltransferase  61.84 
 
 		 405 aa  504  1e-141  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2347  acetyl-CoA acetyltransferase  63.37 
 
 		 404 aa  490  1e-137  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000971024  normal  0.0766535 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0261  acetyl-CoA acetyltransferase  51.91 
 
 		 390 aa  409  1e-113  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.239081  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4698  acetyl-CoA acetyltransferase  51.28 
 
 		 396 aa  401  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1886  acetyl-CoA acetyltransferase  42.48 
 
 		 391 aa  313  2.9999999999999996e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00936644 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2969  acetyl-CoA acetyltransferase  42.34 
 
 		 391 aa  313  3.9999999999999997e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2470  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.71 
 
 		 391 aa  312  5.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.559901  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1706  acetyl-CoA acetyltransferase  42.48 
 
 		 395 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  41.27 
 
 		 398 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1606  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.47 
 
 		 391 aa  304  2.0000000000000002e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00425712  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  40.57 
 
 		 398 aa  302  6.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2860  acetyl-CoA acetyltransferase  41.27 
 
 		 403 aa  298  9e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  41.31 
 
 		 392 aa  298  1e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.867472  hitchhiker  0.0000022311 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3087  acetyl-CoA acetyltransferase  39.06 
 
 		 390 aa  298  2e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0618  Acetyl-CoA C-acyltransferase  39.95 
 
 		 400 aa  297  2e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.206368  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2936  acetyl-CoA acetyltransferase  39.95 
 
 		 390 aa  296  3e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3723  acetyl-CoA acetyltransferase  39.58 
 
 		 392 aa  296  5e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0389  acetyl-CoA acetyltransferase  41.47 
 
 		 390 aa  294  2e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.578535  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2125  acetyl-CoA acetyltransferase  41.84 
 
 		 396 aa  294  2e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.533302 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4393  acetyl-CoA acetyltransferase  38.93 
 
 		 392 aa  293  5e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0387  acetyl-CoA acetyltransferase  41.47 
 
 		 390 aa  292  9e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0359  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.47 
 
 		 390 aa  292  1e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0320  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.38 
 
 		 402 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3064  acetyl-CoA acetyltransferase  40.24 
 
 		 392 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2058  thiolase  39.53 
 
 		 399 aa  291  2e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.35513  normal  0.039203 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0816  acetyl-CoA acetyltransferase  39.25 
 
 		 398 aa  290  4e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3878  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.24 
 
 		 391 aa  290  4e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153532  normal  0.682097 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5088  acetyl-CoA acetyltransferase  41.46 
 
 		 385 aa  289  5.0000000000000004e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225671  normal  0.910861 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4755  acetyl-CoA acetyltransferase  37.7 
 
 		 393 aa  289  6e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.167553  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1581  3-ketoacyl-CoA thiolase  40 
 
 		 391 aa  289  7e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.353282 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2013  acetyl-CoA acetyltransferase  39.39 
 
 		 401 aa  288  1e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.536911  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3455  acetyl-CoA acetyltransferase  40.78 
 
 		 377 aa  288  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2146  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.43 
 
 		 391 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3795  acetyl-CoA acetyltransferase  41.06 
 
 		 378 aa  288  1e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.143554 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3516  acetyl-CoA acetyltransferase  38.28 
 
 		 398 aa  288  1e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1756  acetyl-CoA acetyltransferase  41.61 
 
 		 378 aa  288  1e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.404662  normal  0.415846 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25090  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.43 
 
 		 391 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3516  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.81 
 
 		 391 aa  288  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.245239  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0525  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.14 
 
 		 402 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.859351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7640  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.52 
 
 		 402 aa  287  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.202781  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0260  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.52 
 
 		 387 aa  287  2e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.126316 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1145  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.71 
 
 		 391 aa  288  2e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112887  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14450  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.09 
 
 		 391 aa  286  2.9999999999999996e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3596  acetyl-CoA acetyltransferase  38.73 
 
 		 390 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1677  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.19 
 
 		 391 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213939 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2485  acetyl-CoA acetyltransferase  42.39 
 
 		 411 aa  286  4e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.397708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5155  acetyl-CoA acetyltransferase  39.67 
 
 		 390 aa  286  4e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3289  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.34 
 
 		 391 aa  286  5e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.411396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2973  3-ketoacyl-CoA thiolase  38.95 
 
 		 387 aa  286  5e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1579  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.62 
 
 		 391 aa  286  5.999999999999999e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.30524  normal  0.199847 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3953  acetyl-CoA acetyltransferase  39.31 
 
 		 398 aa  286  5.999999999999999e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0618375  normal  0.754512 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3553  acetyl-CoA acetyltransferase  38.73 
 
 		 392 aa  286  5.999999999999999e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0573177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.86 
 
 		 387 aa  285  7e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000295013 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5143  acetyl-CoA acetyltransferase  39.67 
 
 		 390 aa  285  9e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3605  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.95 
 
 		 391 aa  285  9e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.210112  normal  0.327028 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1653  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.95 
 
 		 391 aa  285  9e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4085  acetyl-CoA acetyltransferase  39.25 
 
 		 399 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.802435  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2137  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.76 
 
 		 391 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.049086  normal  0.0941424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5109  acetyl-CoA acetyltransferase  38.5 
 
 		 392 aa  284  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3474  acetyl-CoA acetyltransferase  39.53 
 
 		 399 aa  284  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.158133  normal  0.651546 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0018  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.62 
 
 		 387 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.969653 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5149  acetyl-CoA acetyltransferase  39.67 
 
 		 390 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4876  acetyl-CoA acetyltransferase  39.44 
 
 		 390 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4718  acetyl-CoA acetyltransferase  39.44 
 
 		 390 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5248  acetyl-CoA acetyltransferase  39.44 
 
 		 390 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5117  acetyl-CoA acetyltransferase  39.44 
 
 		 390 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1743  acetyl-CoA acetyltransferase  40.88 
 
 		 378 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4834  acetyl-CoA acetyltransferase  38.97 
 
 		 390 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02790  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.61 
 
 		 401 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0219063 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26010  acyl-CoA thiolase  39.36 
 
 		 379 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.653949  normal  0.286691 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0022  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.9 
 
 		 387 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000376188 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4443  acetyl-CoA acetyltransferase  39.81 
 
 		 382 aa  283  5.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0110645 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0514  beta-ketoadipyl CoA thiolase  39.44 
 
 		 402 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.201521  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0095  acetyl-CoA acetyltransferase  39.44 
 
 		 390 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>