More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1371 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0639  acetyl-CoA acetyltransferase  76.98 
 
 
405 aa  650    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.507963 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8569  Acetyl-CoA C-acyltransferase  77.04 
 
 
406 aa  651    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1371  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
404 aa  823    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0816349  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3121  acetyl-CoA acetyltransferase  76.3 
 
 
406 aa  632  1e-180  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000096812 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31900  acetyl-CoA acetyltransferase  74.81 
 
 
406 aa  622  1e-177  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.213543  normal  0.245472 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0699  acetyl-CoA acetyltransferase  75.31 
 
 
406 aa  623  1e-177  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1472  acetyl-CoA acetyltransferase  73.58 
 
 
406 aa  617  1e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0328581  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0929  acetyl-CoA acetyltransferase  73.09 
 
 
406 aa  610  1e-173  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.561764  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0436  acetyl-CoA acetyltransferase  76.11 
 
 
407 aa  609  1e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0081  acetyl-CoA acetyltransferase  73.15 
 
 
406 aa  605  9.999999999999999e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4677  acetyl-CoA acetyltransferase  71.53 
 
 
405 aa  605  9.999999999999999e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.979867 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4383  acetyl-CoA acetyltransferase  71.29 
 
 
405 aa  595  1e-169  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2040  acetyl-CoA acetyltransferase  70.3 
 
 
405 aa  593  1e-168  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.239863  normal  0.333816 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4152  acetyl-CoA acetyltransferase  71.04 
 
 
405 aa  592  1e-168  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4227  acetyl-CoA acetyltransferase  71.04 
 
 
405 aa  592  1e-168  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117712  normal  0.70435 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11092  acetyl-CoA acetyltransferase  70.79 
 
 
405 aa  590  1e-167  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.641884 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0908  acetyl-CoA acetyltransferase  69.42 
 
 
420 aa  588  1e-167  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1828  acetyl-CoA acetyltransferase  70.62 
 
 
406 aa  590  1e-167  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.901012  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0957  acetyl-CoA acetyltransferase  69.57 
 
 
414 aa  582  1.0000000000000001e-165  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.711113  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0851  acetyl-CoA acetyltransferase  67.96 
 
 
420 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.194541 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1045  acetyl-CoA acetyltransferase  72.59 
 
 
406 aa  559  1e-158  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07120  acetyl-CoA acetyltransferase  65.02 
 
 
407 aa  538  9.999999999999999e-153  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.69838  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4616  acetyl-CoA acetyltransferase  68.69 
 
 
412 aa  541  9.999999999999999e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4451  acetyl-CoA acetyltransferase  65.19 
 
 
406 aa  535  1e-151  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1615  acetyl-CoA acetyltransferase  65.27 
 
 
415 aa  525  1e-148  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.690139  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30280  acetyl-CoA acetyltransferase  65.02 
 
 
405 aa  521  1e-146  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1160  acetyl-CoA acetyltransferase  63.26 
 
 
412 aa  502  1e-141  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2347  acetyl-CoA acetyltransferase  60.2 
 
 
404 aa  471  1e-132  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000971024  normal  0.0766535 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0261  acetyl-CoA acetyltransferase  52.48 
 
 
390 aa  395  1e-109  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.239081  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4698  acetyl-CoA acetyltransferase  50.36 
 
 
396 aa  378  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  44.07 
 
 
398 aa  316  6e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  44.07 
 
 
398 aa  316  6e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1886  acetyl-CoA acetyltransferase  43.67 
 
 
391 aa  313  2.9999999999999996e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00936644 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2969  acetyl-CoA acetyltransferase  43.03 
 
 
391 aa  312  5.999999999999999e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1706  acetyl-CoA acetyltransferase  42.04 
 
 
395 aa  311  1e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  43.88 
 
 
392 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.867472  hitchhiker  0.0000022311 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0618  Acetyl-CoA C-acyltransferase  42.03 
 
 
400 aa  308  1.0000000000000001e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.206368  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3455  acetyl-CoA acetyltransferase  42.18 
 
 
377 aa  306  4.0000000000000004e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2058  thiolase  42.75 
 
 
399 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.35513  normal  0.039203 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2470  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.83 
 
 
391 aa  305  1.0000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.559901  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0816  acetyl-CoA acetyltransferase  41.55 
 
 
398 aa  300  2e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0625  acetyl-CoA acetyltransferase  43.92 
 
 
378 aa  299  7e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4393  acetyl-CoA acetyltransferase  40.94 
 
 
392 aa  296  3e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5088  acetyl-CoA acetyltransferase  42.43 
 
 
385 aa  294  2e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225671  normal  0.910861 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3268  acetyl-CoA acetyltransferases  40.9 
 
 
409 aa  294  2e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1310  Acetyl-CoA C-acyltransferase  42.33 
 
 
380 aa  293  5e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1756  acetyl-CoA acetyltransferase  42.18 
 
 
378 aa  292  6e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.404662  normal  0.415846 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3795  acetyl-CoA acetyltransferase  42.43 
 
 
378 aa  292  9e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.143554 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0387  acetyl-CoA acetyltransferase  40.72 
 
 
390 aa  291  2e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2013  acetyl-CoA acetyltransferase  40.63 
 
 
401 aa  291  2e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.536911  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3087  acetyl-CoA acetyltransferase  38.7 
 
 
390 aa  290  3e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2125  acetyl-CoA acetyltransferase  41.53 
 
 
396 aa  290  3e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.533302 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3553  acetyl-CoA acetyltransferase  41.06 
 
 
392 aa  290  4e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0573177  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3063  acetyl-CoA acetyltransferase  40.68 
 
 
408 aa  289  8e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0301  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  41.77 
 
 
401 aa  289  8e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179307  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3596  acetyl-CoA acetyltransferase  38.37 
 
 
390 aa  288  1e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0389  acetyl-CoA acetyltransferase  40 
 
 
390 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.578535  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  42.2 
 
 
392 aa  288  1e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0098  acetyl-CoA acetyltransferase  40.14 
 
 
400 aa  288  2e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.223566  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2460  acetyl-CoA acetyltransferase  42.44 
 
 
392 aa  287  2e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3064  acetyl-CoA acetyltransferase  39.25 
 
 
392 aa  288  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1595  acetyl-CoA acetyltransferase  40.77 
 
 
394 aa  286  2.9999999999999996e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2936  acetyl-CoA acetyltransferase  38.89 
 
 
390 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  38.41 
 
 
392 aa  286  4e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000894654  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5155  acetyl-CoA acetyltransferase  38.85 
 
 
390 aa  286  5e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5143  acetyl-CoA acetyltransferase  38.85 
 
 
390 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4755  acetyl-CoA acetyltransferase  38.85 
 
 
393 aa  286  5.999999999999999e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.167553  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1205  acetyl-CoA acetyltransferase  40.63 
 
 
400 aa  285  7e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000642816 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1305  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  41.65 
 
 
414 aa  285  8e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1743  acetyl-CoA acetyltransferase  41.44 
 
 
378 aa  285  8e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26010  acyl-CoA thiolase  41.35 
 
 
379 aa  285  8e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.653949  normal  0.286691 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3723  acetyl-CoA acetyltransferase  38.85 
 
 
392 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2860  acetyl-CoA acetyltransferase  41.32 
 
 
403 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0359  3-ketoacyl-CoA thiolase  40 
 
 
390 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2248  beta-ketoadipyl CoA thiolase  41.45 
 
 
401 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0780819  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4834  acetyl-CoA acetyltransferase  38.13 
 
 
390 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4876  acetyl-CoA acetyltransferase  38.61 
 
 
390 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4718  acetyl-CoA acetyltransferase  38.61 
 
 
390 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5117  acetyl-CoA acetyltransferase  38.61 
 
 
390 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5248  acetyl-CoA acetyltransferase  38.61 
 
 
390 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5149  acetyl-CoA acetyltransferase  38.61 
 
 
390 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4733  acetyl-CoA acetyltransferase  38.61 
 
 
390 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2258  beta-ketoadipyl CoA thiolase  41.45 
 
 
401 aa  283  6.000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.127272  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1484  beta-ketoadipyl CoA thiolase  41.45 
 
 
401 aa  283  6.000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4531  acetyl-CoA acetyltransferase  38.88 
 
 
384 aa  282  7.000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1582  beta-ketoadipyl CoA thiolase  41.45 
 
 
401 aa  282  8.000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0095  acetyl-CoA acetyltransferase  38.37 
 
 
390 aa  281  1e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2457  beta-ketoadipyl CoA thiolase  41.2 
 
 
400 aa  281  1e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7110  acetyl-CoA acetyltransferase  38.94 
 
 
391 aa  281  1e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20220  beta-ketoadipyl CoA thiolase  40.88 
 
 
405 aa  281  1e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2064  beta-ketoadipyl CoA thiolase  41.2 
 
 
400 aa  281  2e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.664786 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5109  acetyl-CoA acetyltransferase  39.76 
 
 
392 aa  280  3e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2056  3-ketoacyl-CoA thiolase  39.6 
 
 
392 aa  280  3e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.150034  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2156  acetyl-CoA acetyltransferase  42.09 
 
 
404 aa  279  5e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.744792  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1260  beta-ketoadipyl CoA thiolase  39.56 
 
 
412 aa  279  6e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1606  3-ketoacyl-CoA thiolase  40.15 
 
 
391 aa  278  8e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00425712  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0215  acetyl-CoA acetyltransferase  39.47 
 
 
394 aa  278  1e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0221  acetyl-CoA acetyltransferase  39.47 
 
 
394 aa  278  1e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0504  acetyl-CoA acetyltransferase  42.16 
 
 
392 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0234538 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3108  acetyl-CoA acetyltransferase  44.36 
 
 
392 aa  278  2e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>