More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3268 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3063  acetyl-CoA acetyltransferase  89.93 
 
 		 408 aa  734    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3268  acetyl-CoA acetyltransferases  100 
 
 		 409 aa  809    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20220  beta-ketoadipyl CoA thiolase  75.87 
 
 		 405 aa  609  1e-173  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2485  acetyl-CoA acetyltransferase  63.73 
 
 		 411 aa  511  1e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.397708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0320  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.83 
 
 		 402 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0816  acetyl-CoA acetyltransferase  55.75 
 
 		 398 aa  421  1e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1696  beta-ketoadipyl CoA thiolase  58.77 
 
 		 400 aa  421  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.142195 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2248  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.81 
 
 		 401 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0780819  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0875  beta-ketoadipyl CoA thiolase  56.76 
 
 		 404 aa  418  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2258  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.06 
 
 		 401 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.127272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1484  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.06 
 
 		 401 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1582  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.81 
 
 		 401 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1370  acetyl-CoA acetyltransferase  55.83 
 
 		 399 aa  412  1e-114  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.59343  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6183  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.58 
 
 		 401 aa  412  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0514  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.59 
 
 		 402 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.201521  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0525  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.84 
 
 		 402 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.859351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6117  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.17 
 
 		 401 aa  409  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4811  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.7 
 
 		 401 aa  409  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.346578 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0905  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.42 
 
 		 402 aa  409  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1260  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.6 
 
 		 412 aa  406  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2698  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.19 
 
 		 404 aa  405  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.398036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5022  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.17 
 
 		 399 aa  405  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.751086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0659  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.96 
 
 		 401 aa  406  1.0000000000000001e-112  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.993676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2156  acetyl-CoA acetyltransferase  55.61 
 
 		 404 aa  403  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.744792  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7640  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.09 
 
 		 402 aa  402  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.202781  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4307  3-oxoadipyl-CoA thiolase  53.71 
 
 		 399 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2136  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.68 
 
 		 401 aa  402  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.324266  hitchhiker  0.00675242 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0301  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.96 
 
 		 401 aa  402  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179307  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1305  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  53.12 
 
 		 414 aa  402  1e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1582  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  52.28 
 
 		 424 aa  402  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38200  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.73 
 
 		 401 aa  401  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02790  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.96 
 
 		 401 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0219063 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0867  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.68 
 
 		 402 aa  402  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.865704  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0636  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.96 
 
 		 400 aa  399  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4011  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.35 
 
 		 399 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0170191 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5587  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.33 
 
 		 400 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0314  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.71 
 
 		 401 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1359  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.2 
 
 		 401 aa  399  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1508  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.07 
 
 		 401 aa  400  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0554104  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3669  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.33 
 
 		 400 aa  399  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2825  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.83 
 
 		 401 aa  401  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2321  acetyl-CoA acetyltransferase  53.09 
 
 		 402 aa  399  9.999999999999999e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2013  acetyl-CoA acetyltransferase  52.99 
 
 		 401 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.536911  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4336  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.91 
 
 		 402 aa  401  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.834663 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5883  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.94 
 
 		 401 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3718  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.07 
 
 		 400 aa  397  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.33538  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6797  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.69 
 
 		 401 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0482  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.83 
 
 		 400 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.807592  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2860  acetyl-CoA acetyltransferase  52.97 
 
 		 403 aa  395  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2126  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.94 
 
 		 400 aa  397  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0598  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.71 
 
 		 400 aa  397  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.319983  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2901  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.94 
 
 		 400 aa  397  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00482281  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2457  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.2 
 
 		 400 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1231  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.69 
 
 		 400 aa  397  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000042843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3547  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.83 
 
 		 405 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.008459  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2616  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.57 
 
 		 406 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.232956 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0542  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.58 
 
 		 400 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0885765  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1490  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.58 
 
 		 400 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.159653  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1902  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.58 
 
 		 405 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.19346  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3574  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.58 
 
 		 405 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.887338  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3565  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.58 
 
 		 400 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00704584  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1812  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.58 
 
 		 400 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1269  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.48 
 
 		 401 aa  392  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.690521  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  50.5 
 
 		 398 aa  395  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3361  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.93 
 
 		 402 aa  393  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408018  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2058  thiolase  50.12 
 
 		 399 aa  392  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.35513  normal  0.039203 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0635  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.58 
 
 		 405 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211029  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0798  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.58 
 
 		 400 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0932  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.58 
 
 		 405 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00352947  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0384  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.58 
 
 		 400 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.816364  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2115  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.58 
 
 		 400 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.749553  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1323  acetyl-CoA acetyltransferase  52.1 
 
 		 402 aa  393  1e-108  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.158351 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  51 
 
 		 398 aa  395  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3081  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.32 
 
 		 401 aa  392  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.426252 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3280  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.26 
 
 		 406 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.939828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0375  thiolase  53.33 
 
 		 401 aa  389  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000288796  hitchhiker  0.0000265962 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1017  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.48 
 
 		 400 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.473484  hitchhiker  0.0000869499 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3536  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.83 
 
 		 399 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2064  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.71 
 
 		 400 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.664786 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2629  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.42 
 
 		 406 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.577515  normal  0.0691319 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2252  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.84 
 
 		 400 aa  386  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00123839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0263  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.48 
 
 		 400 aa  385  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1532  beta-ketoadipyl CoA thiolase  50.86 
 
 		 401 aa  386  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117462 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1034  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.71 
 
 		 400 aa  388  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0157191  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3097  beta-ketoadipyl CoA thiolase  50.74 
 
 		 404 aa  386  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99011  hitchhiker  0.000409619 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3361  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.48 
 
 		 400 aa  388  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.100968 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2167  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.47 
 
 		 400 aa  385  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.34173 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3492  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.45 
 
 		 397 aa  387  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.141414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2479  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.01 
 
 		 406 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.612376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2196  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.48 
 
 		 400 aa  386  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0752  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.96 
 
 		 399 aa  387  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.842768  normal  0.454095 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3944  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.84 
 
 		 402 aa  386  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0822503  normal  0.102852 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1122  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.97 
 
 		 401 aa  382  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3179  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.33 
 
 		 399 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.694628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4887  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.85 
 
 		 401 aa  384  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589853 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0302  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.85 
 
 		 401 aa  385  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.480832  normal  0.217803 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4433  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.22 
 
 		 401 aa  383  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5925  beta-ketoadipyl CoA thiolase  50.98 
 
 		 400 aa  383  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5094  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.83 
 
 		 400 aa  383  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3048  beta-ketoadipyl CoA thiolase  49.25 
 
 		 403 aa  382  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.214699  normal  0.389192 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>