More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2485 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2485  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
411 aa  797    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.397708  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20220  beta-ketoadipyl CoA thiolase  64.79 
 
 
405 aa  508  1e-143  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3268  acetyl-CoA acetyltransferases  63.73 
 
 
409 aa  511  1e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3063  acetyl-CoA acetyltransferase  62.99 
 
 
408 aa  503  1e-141  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1323  acetyl-CoA acetyltransferase  56.55 
 
 
402 aa  428  1e-119  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.158351 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2321  acetyl-CoA acetyltransferase  56.07 
 
 
402 aa  431  1e-119  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1305  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  58.59 
 
 
414 aa  427  1e-118  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0917  acetyl-CoA acetyltransferase  60.1 
 
 
412 aa  420  1e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2013  acetyl-CoA acetyltransferase  54.72 
 
 
401 aa  421  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.536911  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2860  acetyl-CoA acetyltransferase  55.5 
 
 
403 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2248  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.06 
 
 
401 aa  412  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0780819  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2058  thiolase  52.8 
 
 
399 aa  414  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.35513  normal  0.039203 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0816  acetyl-CoA acetyltransferase  56.31 
 
 
398 aa  411  1e-114  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  52.2 
 
 
398 aa  412  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1484  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.06 
 
 
401 aa  411  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2156  acetyl-CoA acetyltransferase  58.11 
 
 
404 aa  410  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.744792  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1370  acetyl-CoA acetyltransferase  56.9 
 
 
399 aa  411  1e-113  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.59343  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1582  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.06 
 
 
401 aa  411  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2258  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.06 
 
 
401 aa  411  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.127272  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02905  beta-ketoadipyl CoA thiolase  56.52 
 
 
402 aa  408  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6183  beta-ketoadipyl CoA thiolase  56.63 
 
 
401 aa  410  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02790  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.74 
 
 
401 aa  408  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0219063 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0314  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.99 
 
 
401 aa  408  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  51.46 
 
 
398 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1554  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.48 
 
 
402 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1260  beta-ketoadipyl CoA thiolase  49.39 
 
 
412 aa  405  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1582  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  55.02 
 
 
424 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3361  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.07 
 
 
402 aa  403  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408018  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0492  acetyl-CoA acetyltransferase  52.67 
 
 
402 aa  402  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0879  Acetyl-CoA C-acyltransferase  55.21 
 
 
401 aa  402  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2698  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.03 
 
 
404 aa  405  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.398036  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1696  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.72 
 
 
400 aa  399  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.142195 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4307  3-oxoadipyl-CoA thiolase  52.78 
 
 
399 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38200  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.26 
 
 
401 aa  398  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4011  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.27 
 
 
399 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0170191 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7640  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.51 
 
 
402 aa  399  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.202781  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4336  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.86 
 
 
402 aa  400  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.834663 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0905  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.11 
 
 
402 aa  399  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0659  beta-ketoadipyl CoA thiolase  49.15 
 
 
401 aa  400  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.993676  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0844  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.75 
 
 
400 aa  395  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0514  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.54 
 
 
402 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.201521  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3536  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.75 
 
 
399 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0263  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.82 
 
 
400 aa  395  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3665  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.75 
 
 
400 aa  397  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0320  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.3 
 
 
402 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2196  beta-ketoadipyl CoA thiolase  56.8 
 
 
400 aa  398  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3669  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.06 
 
 
400 aa  396  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2616  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.78 
 
 
406 aa  398  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.232956 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2457  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.3 
 
 
400 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4887  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.54 
 
 
401 aa  392  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0589853 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3081  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.27 
 
 
401 aa  393  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.426252 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0636  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.27 
 
 
400 aa  394  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0598  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.03 
 
 
400 aa  393  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.319983  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1532  beta-ketoadipyl CoA thiolase  49.27 
 
 
401 aa  394  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.117462 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0831  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.03 
 
 
400 aa  392  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0525  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.82 
 
 
402 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.859351  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3718  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.78 
 
 
400 aa  392  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.33538  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2629  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54 
 
 
406 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.577515  normal  0.0691319 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2064  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.33 
 
 
400 aa  392  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.664786 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0875  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.81 
 
 
404 aa  394  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2252  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.54 
 
 
400 aa  388  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00123839  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5587  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.09 
 
 
400 aa  391  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1269  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.78 
 
 
401 aa  389  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.690521  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2398  beta-ketoadipyl CoA thiolase  56.83 
 
 
404 aa  391  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.681376  normal  0.0712183 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3179  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.03 
 
 
399 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.694628  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3707  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.06 
 
 
405 aa  389  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.394558  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0301  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.93 
 
 
401 aa  391  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179307  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2690  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.82 
 
 
400 aa  390  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0340832  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2825  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.3 
 
 
401 aa  389  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3361  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.33 
 
 
400 aa  391  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.100968 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1205  acetyl-CoA acetyltransferase  48.79 
 
 
400 aa  387  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000642816 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4433  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.67 
 
 
401 aa  388  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3492  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.54 
 
 
397 aa  387  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.141414  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1017  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.54 
 
 
400 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.473484  hitchhiker  0.0000869499 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0916  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.72 
 
 
400 aa  388  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3547  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.45 
 
 
405 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.008459  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4811  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.45 
 
 
401 aa  387  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.346578 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2479  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.16 
 
 
406 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.612376  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1122  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.78 
 
 
401 aa  387  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05285  acetyl-CoA acetyltransferase  46.62 
 
 
404 aa  384  1e-105  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3280  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.91 
 
 
406 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.939828  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1902  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.21 
 
 
405 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.19346  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0542  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.21 
 
 
400 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0885765  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1490  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.21 
 
 
400 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.159653  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1508  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.33 
 
 
401 aa  382  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0554104  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3048  beta-ketoadipyl CoA thiolase  48.18 
 
 
403 aa  382  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.214699  normal  0.389192 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3565  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.21 
 
 
400 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00704584  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1812  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.21 
 
 
400 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2126  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.57 
 
 
400 aa  384  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2901  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.33 
 
 
400 aa  383  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00482281  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3574  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.21 
 
 
405 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.887338  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0932  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.21 
 
 
405 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00352947  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0482  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.45 
 
 
400 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.807592  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1231  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.09 
 
 
400 aa  383  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000042843  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2167  beta-ketoadipyl CoA thiolase  50.61 
 
 
400 aa  383  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.34173 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2115  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.21 
 
 
400 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.749553  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3487  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.09 
 
 
400 aa  383  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00319846  hitchhiker  0.000297737 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5368  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.57 
 
 
400 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.360889  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0798  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.21 
 
 
400 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5925  beta-ketoadipyl CoA thiolase  50.61 
 
 
400 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>