More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1582 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1582  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  100 
 
 		 424 aa  853    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2321  acetyl-CoA acetyltransferase  70.41 
 
 		 402 aa  597  1e-169  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1323  acetyl-CoA acetyltransferase  70.74 
 
 		 402 aa  583  1.0000000000000001e-165  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.158351 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0917  acetyl-CoA acetyltransferase  66.75 
 
 		 412 aa  541  1e-153  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0816  acetyl-CoA acetyltransferase  57.28 
 
 		 398 aa  456  1e-127  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2156  acetyl-CoA acetyltransferase  59.09 
 
 		 404 aa  452  1.0000000000000001e-126  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.744792  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2013  acetyl-CoA acetyltransferase  56.8 
 
 		 401 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.536911  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2860  acetyl-CoA acetyltransferase  58.1 
 
 		 403 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1370  acetyl-CoA acetyltransferase  57.21 
 
 		 399 aa  443  1e-123  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.59343  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2698  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.58 
 
 		 404 aa  442  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.398036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0492  acetyl-CoA acetyltransferase  55.34 
 
 		 402 aa  439  9.999999999999999e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3707  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.35 
 
 		 405 aa  435  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.394558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1305  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  56.5 
 
 		 414 aa  436  1e-121  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1205  acetyl-CoA acetyltransferase  51.55 
 
 		 400 aa  435  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000642816 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3547  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.71 
 
 		 405 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.008459  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  53.22 
 
 		 398 aa  427  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0659  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.39 
 
 		 401 aa  426  1e-118  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.993676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1554  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.11 
 
 		 402 aa  422  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1902  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.48 
 
 		 405 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.19346  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  52.74 
 
 		 398 aa  424  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0798  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.48 
 
 		 400 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0482  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.71 
 
 		 400 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.807592  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0384  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.48 
 
 		 400 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.816364  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0542  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.48 
 
 		 400 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0885765  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1490  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.48 
 
 		 400 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.159653  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3097  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.61 
 
 		 404 aa  422  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99011  hitchhiker  0.000409619 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3565  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.48 
 
 		 400 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00704584  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1812  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.48 
 
 		 400 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2457  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.52 
 
 		 400 aa  421  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2616  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.14 
 
 		 406 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.232956 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3574  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.48 
 
 		 405 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.887338  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0635  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.48 
 
 		 405 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211029  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2115  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.48 
 
 		 400 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.749553  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13000  acetyl-CoA acetyltransferase  56.83 
 
 		 391 aa  422  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0932  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.48 
 
 		 405 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00352947  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0636  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.85 
 
 		 400 aa  419  1e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3361  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.76 
 
 		 400 aa  419  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.100968 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5587  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.76 
 
 		 400 aa  418  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4433  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.61 
 
 		 401 aa  420  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2126  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.24 
 
 		 400 aa  421  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2901  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55 
 
 		 400 aa  419  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00482281  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3669  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.76 
 
 		 400 aa  421  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05285  acetyl-CoA acetyltransferase  50.24 
 
 		 404 aa  419  1e-116  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3048  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.54 
 
 		 403 aa  420  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.214699  normal  0.389192 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02790  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.83 
 
 		 401 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0219063 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0598  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.61 
 
 		 400 aa  416  9.999999999999999e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.319983  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5925  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.76 
 
 		 400 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0314  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.59 
 
 		 401 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1508  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.52 
 
 		 401 aa  416  9.999999999999999e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0554104  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0875  thiolase  55.48 
 
 		 391 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4336  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.58 
 
 		 402 aa  418  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.834663 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0263  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.52 
 
 		 400 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1231  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.29 
 
 		 400 aa  416  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000042843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2167  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.52 
 
 		 400 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.34173 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1122  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.76 
 
 		 401 aa  416  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3665  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.57 
 
 		 400 aa  415  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0831  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.33 
 
 		 400 aa  415  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2064  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.81 
 
 		 400 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.664786 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3063  acetyl-CoA acetyltransferase  52.12 
 
 		 408 aa  415  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3944  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.85 
 
 		 402 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0822503  normal  0.102852 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2252  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.24 
 
 		 400 aa  414  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00123839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0222  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.03 
 
 		 400 aa  414  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0698438 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0844  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.74 
 
 		 400 aa  413  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3718  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.94 
 
 		 400 aa  414  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.33538  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20220  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.83 
 
 		 405 aa  412  1e-114  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1260  beta-ketoadipyl CoA thiolase  50.24 
 
 		 412 aa  414  1e-114  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4887  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.29 
 
 		 401 aa  411  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589853 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2629  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.59 
 
 		 406 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.577515  normal  0.0691319 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2825  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.83 
 
 		 401 aa  414  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0879  Acetyl-CoA C-acyltransferase  54.89 
 
 		 401 aa  412  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4307  3-oxoadipyl-CoA thiolase  52.39 
 
 		 399 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4011  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.39 
 
 		 399 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0170191 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3767  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.52 
 
 		 400 aa  410  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1696  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.71 
 
 		 400 aa  409  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.142195 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5022  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.05 
 
 		 399 aa  409  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.751086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1532  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.43 
 
 		 401 aa  405  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117462 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5094  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.07 
 
 		 400 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3536  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.52 
 
 		 399 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0650  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.29 
 
 		 401 aa  408  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0301  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.67 
 
 		 401 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179307  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2485  acetyl-CoA acetyltransferase  55.02 
 
 		 411 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.397708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1847  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.89 
 
 		 400 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.227996  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2998  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.52 
 
 		 400 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38200  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.39 
 
 		 401 aa  405  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5368  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.52 
 
 		 400 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.360889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4811  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.86 
 
 		 401 aa  407  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.346578 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4902  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.52 
 
 		 400 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.151617  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2248  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.9 
 
 		 401 aa  403  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0780819  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0302  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.11 
 
 		 401 aa  402  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.480832  normal  0.217803 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0375  thiolase  53.1 
 
 		 401 aa  402  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000288796  hitchhiker  0.0000265962 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5246  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.29 
 
 		 400 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1269  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.03 
 
 		 401 aa  402  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.690521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1582  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.9 
 
 		 401 aa  402  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2852  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.1 
 
 		 400 aa  403  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0252423  normal  0.507023 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4717  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.52 
 
 		 406 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3268  acetyl-CoA acetyltransferases  52.28 
 
 		 409 aa  402  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1484  beta-ketoadipyl CoA thiolase  51.9 
 
 		 401 aa  402  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0905  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.7 
 
 		 402 aa  403  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.595541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1017  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.98 
 
 		 400 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.473484  hitchhiker  0.0000869499 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3179  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.05 
 
 		 399 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.694628  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>