More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2056 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2056  3-ketoacyl-CoA thiolase  100 
 
 
392 aa  783    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.150034  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1886  acetyl-CoA acetyltransferase  66.75 
 
 
391 aa  506  9.999999999999999e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00936644 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2969  acetyl-CoA acetyltransferase  66.4 
 
 
391 aa  500  1e-140  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4393  acetyl-CoA acetyltransferase  62.7 
 
 
392 aa  476  1e-133  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  66.07 
 
 
392 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.867472  hitchhiker  0.0000022311 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3087  acetyl-CoA acetyltransferase  60.05 
 
 
390 aa  450  1e-125  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2936  acetyl-CoA acetyltransferase  60.1 
 
 
390 aa  449  1e-125  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1706  acetyl-CoA acetyltransferase  61.54 
 
 
395 aa  442  1e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2470  3-ketoacyl-CoA thiolase  58.42 
 
 
391 aa  444  1e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.559901  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1595  acetyl-CoA acetyltransferase  60.36 
 
 
394 aa  441  9.999999999999999e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3596  acetyl-CoA acetyltransferase  56.85 
 
 
390 aa  435  1e-121  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  56.41 
 
 
392 aa  435  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000894654  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5143  acetyl-CoA acetyltransferase  56.85 
 
 
390 aa  432  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3064  acetyl-CoA acetyltransferase  58.97 
 
 
392 aa  433  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4876  acetyl-CoA acetyltransferase  56.6 
 
 
390 aa  428  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4718  acetyl-CoA acetyltransferase  56.6 
 
 
390 aa  428  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5117  acetyl-CoA acetyltransferase  56.6 
 
 
390 aa  428  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5248  acetyl-CoA acetyltransferase  56.6 
 
 
390 aa  428  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0095  acetyl-CoA acetyltransferase  56.85 
 
 
390 aa  431  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5155  acetyl-CoA acetyltransferase  56.85 
 
 
390 aa  431  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2266  acetyl-CoA acetyltransferase  58.31 
 
 
390 aa  429  1e-119  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00024775 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0618  Acetyl-CoA C-acyltransferase  58.06 
 
 
400 aa  429  1e-119  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.206368  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4834  acetyl-CoA acetyltransferase  56.6 
 
 
390 aa  430  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5149  acetyl-CoA acetyltransferase  56.6 
 
 
390 aa  429  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4733  acetyl-CoA acetyltransferase  56.6 
 
 
390 aa  427  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0389  acetyl-CoA acetyltransferase  57.44 
 
 
390 aa  418  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.578535  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4531  acetyl-CoA acetyltransferase  54.34 
 
 
384 aa  419  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1803  acetyl-CoA acetyltransferase  58.57 
 
 
390 aa  420  1e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0387  acetyl-CoA acetyltransferase  57.44 
 
 
390 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2125  acetyl-CoA acetyltransferase  56.78 
 
 
396 aa  413  1e-114  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.533302 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3723  acetyl-CoA acetyltransferase  53.18 
 
 
392 aa  409  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0359  3-ketoacyl-CoA thiolase  55.9 
 
 
390 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2090  acetyl-CoA acetyltransferase  56.04 
 
 
390 aa  395  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000145195 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0098  acetyl-CoA acetyltransferase  53.05 
 
 
400 aa  398  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.223566  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4755  acetyl-CoA acetyltransferase  53.05 
 
 
393 aa  397  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.167553  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7110  acetyl-CoA acetyltransferase  52.3 
 
 
391 aa  392  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5109  acetyl-CoA acetyltransferase  52.67 
 
 
392 aa  393  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06175  acetyl-CoA acyltransferase  52.39 
 
 
396 aa  390  1e-107  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3553  acetyl-CoA acetyltransferase  51.4 
 
 
392 aa  388  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0573177  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1653  acetyl-CoA acetyltransferase  52.24 
 
 
402 aa  387  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.302534  normal  0.125875 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3590  acetyl-CoA acetyltransferase  52.04 
 
 
394 aa  386  1e-106  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2127  acetyl-CoA acetyltransferase  55.64 
 
 
390 aa  386  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1307  acetyl-CoA acetyltransferase  50.76 
 
 
394 aa  382  1e-105  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06117  acetyl-CoA acetyltransferase  52.39 
 
 
401 aa  384  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0270862  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01049  acetyl-CoA acetyltransferase  52.39 
 
 
401 aa  384  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.216841  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0215  acetyl-CoA acetyltransferase  53.5 
 
 
394 aa  382  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0221  acetyl-CoA acetyltransferase  53.5 
 
 
394 aa  382  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1592  acetyl-CoA acetyltransferase  54.08 
 
 
390 aa  380  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.160886  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0580  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 
399 aa  375  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4085  acetyl-CoA acetyltransferase  50.89 
 
 
399 aa  377  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.802435  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1306  acetyl-CoA acetyltransferase  50.51 
 
 
394 aa  377  1e-103  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0663  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 
399 aa  375  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.336951  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0416  acetyl-CoA acetyltransferase  51.25 
 
 
399 aa  372  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0365  acetyl-CoA acetyltransferase  48.86 
 
 
399 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0387  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 
399 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2876  acetyl-CoA acetyltransferase  53.85 
 
 
390 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.44366 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4036  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 
399 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.105517 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0350  acetyl-CoA acetyltransferase  49.24 
 
 
399 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4030  acetyl-CoA acetyltransferase  51.89 
 
 
399 aa  369  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000182841 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2746  acetyl-CoA acetyltransferase  49.62 
 
 
399 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0055718  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6046  acetyl-CoA acetyltransferase  49.37 
 
 
399 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2637  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 
399 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.357851 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0566  acetyl-CoA acetyltransferase  49.87 
 
 
399 aa  371  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0964  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 
398 aa  369  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2107  acetyl-CoA acetyltransferase  49.62 
 
 
399 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0857857  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2771  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 
399 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2719  acetyl-CoA acetyltransferase  49.62 
 
 
399 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0475  acetyl-CoA acetyltransferase  48.1 
 
 
399 aa  368  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73599  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0682  acetyl-CoA acetyltransferase  49.87 
 
 
399 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0199  acetyl-CoA acetyltransferase  49.87 
 
 
399 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0448  acetyl-CoA acetyltransferase  47.85 
 
 
398 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0859  acetyl-CoA acetyltransferase  49.87 
 
 
399 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2746  acetyl-CoA acetyltransferase  49.87 
 
 
399 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3516  acetyl-CoA acetyltransferase  51.14 
 
 
398 aa  365  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2332  acetyl-CoA acetyltransferase  49.87 
 
 
399 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2412  acetyl-CoA acetyltransferase  49.87 
 
 
399 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.804576  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0697  acetyl-CoA acetyltransferase  49.87 
 
 
399 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.767205  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1340  acetyl-CoA acetyltransferase  49.37 
 
 
398 aa  362  4e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0595  acetyl-CoA acetyltransferase  49.62 
 
 
398 aa  360  2e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.837144 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0814  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 
400 aa  358  6e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0574  acetyl-CoA acetyltransferase  49.62 
 
 
398 aa  358  7e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0810  acetyl-CoA acetyltransferase  49.63 
 
 
399 aa  358  9e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4752  acetyl-CoA acetyltransferase  50.25 
 
 
395 aa  357  1.9999999999999998e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.057105 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2273  acetyl-CoA acetyltransferase  51.02 
 
 
392 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0444275  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3953  acetyl-CoA acetyltransferase  48.86 
 
 
398 aa  357  2.9999999999999997e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0618375  normal  0.754512 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0915  thiolase  50.9 
 
 
393 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000139081  normal  0.129634 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3474  acetyl-CoA acetyltransferase  49.62 
 
 
399 aa  356  5e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.158133  normal  0.651546 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0755  acetyl-CoA acetyltransferase  51.14 
 
 
393 aa  355  5.999999999999999e-97  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0387  acetyl-CoA acetyltransferase  49.11 
 
 
398 aa  354  2e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.618119  decreased coverage  0.00238566 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1370  acetyl-CoA acetyltransferase  50.77 
 
 
392 aa  350  2e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0227304  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1822  acetyl-CoA acetyltransferase  50.26 
 
 
392 aa  350  3e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.403448  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1445  Acetyl-CoA C-acyltransferase  50.88 
 
 
401 aa  348  9e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279088  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1407  acetyl-CoA acetyltransferase  49.37 
 
 
392 aa  348  1e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4857  acetyl-CoA acetyltransferase  49.87 
 
 
392 aa  347  2e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.328315  hitchhiker  0.00599656 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1892  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 
392 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.266832  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1927  acetyl-CoA acetyltransferase  50.51 
 
 
392 aa  346  4e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.294769  normal  0.635162 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1927  acetyl-CoA acetyltransferase  49.75 
 
 
392 aa  346  4e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.114356  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1843  acetyl-CoA acetyltransferase  48.85 
 
 
391 aa  346  5e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.445136 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1550  acetyl-CoA acetyltransferase  47.73 
 
 
399 aa  345  8e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000109593  hitchhiker  0.00778819 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6175  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 
392 aa  345  8e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>