More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_26010 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_26010  acyl-CoA thiolase  100 
 
 		 379 aa  754    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.653949  normal  0.286691 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1756  acetyl-CoA acetyltransferase  63.37 
 
 		 378 aa  489  1e-137  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.404662  normal  0.415846 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3795  acetyl-CoA acetyltransferase  64.36 
 
 		 378 aa  487  1e-136  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.143554 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5088  acetyl-CoA acetyltransferase  65.35 
 
 		 385 aa  484  1e-135  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225671  normal  0.910861 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3455  acetyl-CoA acetyltransferase  63.76 
 
 		 377 aa  480  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1743  acetyl-CoA acetyltransferase  62.23 
 
 		 378 aa  474  1e-132  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1310  Acetyl-CoA C-acyltransferase  62.6 
 
 		 380 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4443  acetyl-CoA acetyltransferase  61.58 
 
 		 382 aa  458  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0110645 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0005  acetyl-CoA acetyltransferase  63.56 
 
 		 378 aa  444  1e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0625  acetyl-CoA acetyltransferase  59.41 
 
 		 378 aa  434  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3226  acetyl-CoA acetyltransferases  55.65 
 
 		 373 aa  395  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0618  Acetyl-CoA C-acyltransferase  50.52 
 
 		 400 aa  365  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.206368  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0389  acetyl-CoA acetyltransferase  48.94 
 
 		 390 aa  355  5.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.578535  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0387  acetyl-CoA acetyltransferase  48.94 
 
 		 390 aa  352  4e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0359  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.88 
 
 		 390 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1886  acetyl-CoA acetyltransferase  48.93 
 
 		 391 aa  341  1e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00936644 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2969  acetyl-CoA acetyltransferase  49.33 
 
 		 391 aa  340  2e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1595  acetyl-CoA acetyltransferase  47.41 
 
 		 394 aa  338  9.999999999999999e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2936  acetyl-CoA acetyltransferase  45.88 
 
 		 390 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3087  acetyl-CoA acetyltransferase  46.63 
 
 		 390 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  48.53 
 
 		 392 aa  337  2.9999999999999997e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.867472  hitchhiker  0.0000022311 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2470  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.41 
 
 		 391 aa  335  7e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.559901  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2125  acetyl-CoA acetyltransferase  48.34 
 
 		 396 aa  330  4e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.533302 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6698  acetyl-CoA acetyltransferase  46.91 
 
 		 388 aa  328  8e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1592  acetyl-CoA acetyltransferase  46.45 
 
 		 390 aa  328  8e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.160886  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2090  acetyl-CoA acetyltransferase  46.72 
 
 		 390 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000145195 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4531  acetyl-CoA acetyltransferase  46.24 
 
 		 384 aa  326  4.0000000000000003e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  43.3 
 
 		 392 aa  325  8.000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000894654  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0816  acetyl-CoA acetyltransferase  46.88 
 
 		 398 aa  324  1e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4393  acetyl-CoA acetyltransferase  44.95 
 
 		 392 aa  325  1e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2127  acetyl-CoA acetyltransferase  45.9 
 
 		 390 aa  325  1e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3064  acetyl-CoA acetyltransferase  46.51 
 
 		 392 aa  324  2e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1706  acetyl-CoA acetyltransferase  45.04 
 
 		 395 aa  322  8e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0022  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.48 
 
 		 387 aa  317  2e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000376188 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2876  acetyl-CoA acetyltransferase  47.26 
 
 		 390 aa  315  6e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.44366 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1472  acetyl-CoA acetyltransferase  44.64 
 
 		 406 aa  315  6e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0328581  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0017  3-ketoacyl-CoA thiolase  45.05 
 
 		 387 aa  315  9e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  45.11 
 
 		 398 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11092  acetyl-CoA acetyltransferase  42.61 
 
 		 405 aa  312  4.999999999999999e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.641884 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0018  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.07 
 
 		 387 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.969653 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  45.43 
 
 		 387 aa  311  1e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000295013 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4834  acetyl-CoA acetyltransferase  43.56 
 
 		 390 aa  310  2e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0261  acetyl-CoA acetyltransferase  45.38 
 
 		 390 aa  310  2e-83  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.239081  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0095  acetyl-CoA acetyltransferase  43.56 
 
 		 390 aa  310  2e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  44.61 
 
 		 398 aa  310  2e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4876  acetyl-CoA acetyltransferase  43.56 
 
 		 390 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4718  acetyl-CoA acetyltransferase  43.56 
 
 		 390 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5117  acetyl-CoA acetyltransferase  43.56 
 
 		 390 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2321  acetyl-CoA acetyltransferase  46.49 
 
 		 402 aa  310  2.9999999999999997e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2058  thiolase  44.75 
 
 		 399 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.35513  normal  0.039203 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5248  acetyl-CoA acetyltransferase  43.56 
 
 		 390 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0012  3-ketoacyl-CoA thiolase  45.83 
 
 		 387 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5149  acetyl-CoA acetyltransferase  43.56 
 
 		 390 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4733  acetyl-CoA acetyltransferase  43.56 
 
 		 390 aa  310  4e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2266  acetyl-CoA acetyltransferase  44.2 
 
 		 390 aa  309  5e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024775 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2056  3-ketoacyl-CoA thiolase  45.6 
 
 		 392 aa  308  9e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.150034  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0019  3-ketoacyl-CoA thiolase  45.05 
 
 		 387 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0120161 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0019  3-ketoacyl-CoA thiolase  45.05 
 
 		 387 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000205749 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4383  acetyl-CoA acetyltransferase  42.86 
 
 		 405 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3596  acetyl-CoA acetyltransferase  43.3 
 
 		 390 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0015  3-ketoacyl-CoA thiolase  45.31 
 
 		 387 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0012  3-ketoacyl-CoA thiolase  45.05 
 
 		 387 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0898923  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0015  3-ketoacyl-CoA thiolase  45.05 
 
 		 387 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5143  acetyl-CoA acetyltransferase  43.04 
 
 		 390 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5155  acetyl-CoA acetyltransferase  43.3 
 
 		 390 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4152  acetyl-CoA acetyltransferase  42.86 
 
 		 405 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0023  3-ketoacyl-CoA thiolase  45.05 
 
 		 387 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.188213  hitchhiker  0.0000000293236 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  45.05 
 
 		 387 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.237064  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4227  acetyl-CoA acetyltransferase  42.86 
 
 		 405 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117712  normal  0.70435 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2973  3-ketoacyl-CoA thiolase  44.79 
 
 		 387 aa  306  4.0000000000000004e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0014  3-ketoacyl-CoA thiolase  45.05 
 
 		 387 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0013127  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  44.53 
 
 		 387 aa  305  7e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0017  3-ketoacyl-CoA thiolase  44.79 
 
 		 387 aa  305  7e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000928533 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0031  3-ketoacyl-CoA thiolase  45.57 
 
 		 387 aa  305  8.000000000000001e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.871061  normal  0.0355813 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0392  3-ketoacyl-CoA thiolase  44.53 
 
 		 386 aa  303  2.0000000000000002e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0929  acetyl-CoA acetyltransferase  43.5 
 
 		 406 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.561764  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31900  acetyl-CoA acetyltransferase  42.25 
 
 		 406 aa  303  4.0000000000000003e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.213543  normal  0.245472 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0699  acetyl-CoA acetyltransferase  43.89 
 
 		 406 aa  303  4.0000000000000003e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1160  acetyl-CoA acetyltransferase  44.58 
 
 		 412 aa  302  7.000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1606  3-ketoacyl-CoA thiolase  42.56 
 
 		 391 aa  301  1e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00425712  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3121  acetyl-CoA acetyltransferase  42.25 
 
 		 406 aa  301  1e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000096812 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0221  acetyl-CoA acetyltransferase  42.78 
 
 		 394 aa  300  3e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0215  acetyl-CoA acetyltransferase  42.78 
 
 		 394 aa  300  3e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4085  acetyl-CoA acetyltransferase  44.62 
 
 		 399 aa  300  4e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.802435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0448  acetyl-CoA acetyltransferase  43.08 
 
 		 398 aa  298  7e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0199  acetyl-CoA acetyltransferase  44.22 
 
 		 399 aa  298  8e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0682  acetyl-CoA acetyltransferase  44.22 
 
 		 399 aa  298  8e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0859  acetyl-CoA acetyltransferase  44.22 
 
 		 399 aa  298  8e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2746  acetyl-CoA acetyltransferase  44.22 
 
 		 399 aa  298  8e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2412  acetyl-CoA acetyltransferase  44.22 
 
 		 399 aa  298  8e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.804576  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2332  acetyl-CoA acetyltransferase  44.22 
 
 		 399 aa  298  8e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0697  acetyl-CoA acetyltransferase  44.22 
 
 		 399 aa  298  8e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.767205  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1370  acetyl-CoA acetyltransferase  43.56 
 
 		 392 aa  298  8e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0227304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1828  acetyl-CoA acetyltransferase  43.64 
 
 		 406 aa  298  9e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.901012  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0301  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.49 
 
 		 401 aa  298  1e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179307  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0475  acetyl-CoA acetyltransferase  43.85 
 
 		 399 aa  297  2e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3048  beta-ketoadipyl CoA thiolase  45.05 
 
 		 403 aa  297  2e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.214699  normal  0.389192 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2226  3-ketoacyl-CoA thiolase  42.16 
 
 		 390 aa  297  2e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.857113  normal  0.149332 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  43.23 
 
 		 394 aa  297  2e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117931  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3878  3-ketoacyl-CoA thiolase  42.13 
 
 		 391 aa  297  3e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.153532  normal  0.682097 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>