More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0081 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3121  acetyl-CoA acetyltransferase  79.12 
 
 
406 aa  646    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000096812 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0081  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
406 aa  821    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0436  acetyl-CoA acetyltransferase  85.75 
 
 
407 aa  692    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8569  Acetyl-CoA C-acyltransferase  80.84 
 
 
406 aa  669    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1472  acetyl-CoA acetyltransferase  76.41 
 
 
406 aa  632  1e-180  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0328581  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31900  acetyl-CoA acetyltransferase  76.17 
 
 
406 aa  620  1e-176  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.213543  normal  0.245472 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0929  acetyl-CoA acetyltransferase  76.17 
 
 
406 aa  619  1e-176  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.561764  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0639  acetyl-CoA acetyltransferase  74.45 
 
 
405 aa  617  1e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.507963 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1828  acetyl-CoA acetyltransferase  75.68 
 
 
406 aa  615  1e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.901012  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0699  acetyl-CoA acetyltransferase  76.41 
 
 
406 aa  610  1e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1371  acetyl-CoA acetyltransferase  73.15 
 
 
404 aa  605  9.999999999999999e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0816349  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11092  acetyl-CoA acetyltransferase  74.69 
 
 
405 aa  600  1e-170  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.641884 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4677  acetyl-CoA acetyltransferase  72.48 
 
 
405 aa  598  1e-170  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.979867 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2040  acetyl-CoA acetyltransferase  72.24 
 
 
405 aa  595  1e-169  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.239863  normal  0.333816 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4383  acetyl-CoA acetyltransferase  71.99 
 
 
405 aa  590  1e-167  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4152  acetyl-CoA acetyltransferase  72.24 
 
 
405 aa  590  1e-167  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4227  acetyl-CoA acetyltransferase  72.24 
 
 
405 aa  590  1e-167  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117712  normal  0.70435 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0957  acetyl-CoA acetyltransferase  70.6 
 
 
414 aa  581  1.0000000000000001e-165  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.711113  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0908  acetyl-CoA acetyltransferase  69.57 
 
 
420 aa  582  1.0000000000000001e-165  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1045  acetyl-CoA acetyltransferase  74.69 
 
 
406 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0851  acetyl-CoA acetyltransferase  70.29 
 
 
420 aa  577  1e-164  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.194541 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1615  acetyl-CoA acetyltransferase  70.34 
 
 
415 aa  567  1e-160  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.690139  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07120  acetyl-CoA acetyltransferase  67.24 
 
 
407 aa  553  1e-156  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.69838  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4616  acetyl-CoA acetyltransferase  70.84 
 
 
412 aa  553  1e-156  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4451  acetyl-CoA acetyltransferase  68.55 
 
 
406 aa  550  1e-155  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30280  acetyl-CoA acetyltransferase  64.86 
 
 
405 aa  521  1e-147  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1160  acetyl-CoA acetyltransferase  64.58 
 
 
412 aa  504  1e-141  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2347  acetyl-CoA acetyltransferase  62.47 
 
 
404 aa  472  1e-132  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000971024  normal  0.0766535 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0261  acetyl-CoA acetyltransferase  54.46 
 
 
390 aa  412  1e-114  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.239081  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4698  acetyl-CoA acetyltransferase  49.53 
 
 
396 aa  381  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  45.15 
 
 
398 aa  323  3e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  44.17 
 
 
398 aa  318  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0387  acetyl-CoA acetyltransferase  43.99 
 
 
390 aa  317  3e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2969  acetyl-CoA acetyltransferase  43.92 
 
 
391 aa  316  4e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0389  acetyl-CoA acetyltransferase  43.51 
 
 
390 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.578535  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2936  acetyl-CoA acetyltransferase  42.89 
 
 
390 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1886  acetyl-CoA acetyltransferase  43.81 
 
 
391 aa  314  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00936644 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0359  3-ketoacyl-CoA thiolase  43.27 
 
 
390 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3087  acetyl-CoA acetyltransferase  42.21 
 
 
390 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3455  acetyl-CoA acetyltransferase  44.31 
 
 
377 aa  312  5.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1706  acetyl-CoA acetyltransferase  43.39 
 
 
395 aa  312  7.999999999999999e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0618  Acetyl-CoA C-acyltransferase  41.93 
 
 
400 aa  310  4e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.206368  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2470  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.25 
 
 
391 aa  309  5.9999999999999995e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.559901  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1756  acetyl-CoA acetyltransferase  43.6 
 
 
378 aa  308  1.0000000000000001e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.404662  normal  0.415846 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1310  Acetyl-CoA C-acyltransferase  44.2 
 
 
380 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2058  thiolase  43.1 
 
 
399 aa  306  3e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.35513  normal  0.039203 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1595  acetyl-CoA acetyltransferase  43.27 
 
 
394 aa  305  8.000000000000001e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3474  acetyl-CoA acetyltransferase  43.41 
 
 
399 aa  305  1.0000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.158133  normal  0.651546 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4443  acetyl-CoA acetyltransferase  42.79 
 
 
382 aa  303  2.0000000000000002e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0110645 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0625  acetyl-CoA acetyltransferase  42.33 
 
 
378 aa  303  3.0000000000000004e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0301  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  42.13 
 
 
401 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179307  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3723  acetyl-CoA acetyltransferase  40.81 
 
 
392 aa  303  5.000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3953  acetyl-CoA acetyltransferase  43.3 
 
 
398 aa  303  5.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0618375  normal  0.754512 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  42.72 
 
 
392 aa  302  7.000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.867472  hitchhiker  0.0000022311 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4393  acetyl-CoA acetyltransferase  42.34 
 
 
392 aa  302  9e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0098  acetyl-CoA acetyltransferase  42.21 
 
 
400 aa  301  1e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.223566  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  39.52 
 
 
392 aa  300  2e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000894654  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2125  acetyl-CoA acetyltransferase  42.75 
 
 
396 aa  300  3e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.533302 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3795  acetyl-CoA acetyltransferase  44.31 
 
 
378 aa  300  4e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.143554 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1743  acetyl-CoA acetyltransferase  42.36 
 
 
378 aa  298  9e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4085  acetyl-CoA acetyltransferase  41.77 
 
 
399 aa  298  1e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.802435  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0221  acetyl-CoA acetyltransferase  41.53 
 
 
394 aa  297  2e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3596  acetyl-CoA acetyltransferase  40.91 
 
 
390 aa  297  2e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0215  acetyl-CoA acetyltransferase  41.53 
 
 
394 aa  297  2e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3064  acetyl-CoA acetyltransferase  41.93 
 
 
392 aa  297  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1205  acetyl-CoA acetyltransferase  41.46 
 
 
400 aa  297  2e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000642816 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2013  acetyl-CoA acetyltransferase  42.27 
 
 
401 aa  296  3e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.536911  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0595  acetyl-CoA acetyltransferase  42.21 
 
 
398 aa  296  4e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.837144 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4531  acetyl-CoA acetyltransferase  39.51 
 
 
384 aa  296  6e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0574  acetyl-CoA acetyltransferase  42.21 
 
 
398 aa  296  6e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5109  acetyl-CoA acetyltransferase  40.19 
 
 
392 aa  296  6e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1606  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.36 
 
 
391 aa  295  7e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00425712  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0022  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.02 
 
 
387 aa  295  9e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000376188 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5088  acetyl-CoA acetyltransferase  44.06 
 
 
385 aa  295  1e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225671  normal  0.910861 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5143  acetyl-CoA acetyltransferase  40.91 
 
 
390 aa  294  2e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0260  3-ketoacyl-CoA thiolase  42.03 
 
 
387 aa  294  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.126316 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5155  acetyl-CoA acetyltransferase  40.91 
 
 
390 aa  294  2e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3516  acetyl-CoA acetyltransferase  41.29 
 
 
398 aa  294  2e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  43.55 
 
 
392 aa  293  3e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0005  acetyl-CoA acetyltransferase  43.84 
 
 
378 aa  293  4e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1340  acetyl-CoA acetyltransferase  41.73 
 
 
398 aa  293  4e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0018  3-ketoacyl-CoA thiolase  42.13 
 
 
387 aa  293  5e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.969653 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3748  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.16 
 
 
387 aa  293  5e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0012  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.16 
 
 
387 aa  292  6e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26010  acyl-CoA thiolase  41.5 
 
 
379 aa  292  6e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.653949  normal  0.286691 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4834  acetyl-CoA acetyltransferase  40.43 
 
 
390 aa  292  7e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4876  acetyl-CoA acetyltransferase  40.43 
 
 
390 aa  291  1e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4718  acetyl-CoA acetyltransferase  40.43 
 
 
390 aa  291  1e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7110  acetyl-CoA acetyltransferase  39.29 
 
 
391 aa  291  1e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5248  acetyl-CoA acetyltransferase  40.43 
 
 
390 aa  291  1e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5117  acetyl-CoA acetyltransferase  40.43 
 
 
390 aa  291  1e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5149  acetyl-CoA acetyltransferase  40.67 
 
 
390 aa  291  1e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.75 
 
 
387 aa  291  2e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000295013 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4733  acetyl-CoA acetyltransferase  40.43 
 
 
390 aa  291  2e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0448  acetyl-CoA acetyltransferase  42 
 
 
398 aa  291  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0365  acetyl-CoA acetyltransferase  41.29 
 
 
399 aa  291  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0350  acetyl-CoA acetyltransferase  41.05 
 
 
399 aa  290  2e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0095  acetyl-CoA acetyltransferase  40.19 
 
 
390 aa  290  2e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2860  acetyl-CoA acetyltransferase  42.48 
 
 
403 aa  291  2e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4368  3-ketoacyl-CoA thiolase  41.4 
 
 
387 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>