More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0005 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0005  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
378 aa  746    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4443  acetyl-CoA acetyltransferase  73.95 
 
 
382 aa  558  1e-158  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0110645 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1756  acetyl-CoA acetyltransferase  69.31 
 
 
378 aa  541  1e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.404662  normal  0.415846 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3795  acetyl-CoA acetyltransferase  71.69 
 
 
378 aa  542  1e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.143554 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1310  Acetyl-CoA C-acyltransferase  71.58 
 
 
380 aa  526  1e-148  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1743  acetyl-CoA acetyltransferase  67.46 
 
 
378 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3455  acetyl-CoA acetyltransferase  65.6 
 
 
377 aa  480  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26010  acyl-CoA thiolase  63.56 
 
 
379 aa  478  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.653949  normal  0.286691 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0625  acetyl-CoA acetyltransferase  62.86 
 
 
378 aa  473  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5088  acetyl-CoA acetyltransferase  62.6 
 
 
385 aa  455  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225671  normal  0.910861 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3226  acetyl-CoA acetyltransferases  60.74 
 
 
373 aa  420  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0618  Acetyl-CoA C-acyltransferase  50.77 
 
 
400 aa  364  1e-99  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.206368  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2936  acetyl-CoA acetyltransferase  48.21 
 
 
390 aa  353  2e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3087  acetyl-CoA acetyltransferase  48.21 
 
 
390 aa  350  2e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  47.3 
 
 
392 aa  347  2e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000894654  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4531  acetyl-CoA acetyltransferase  47.14 
 
 
384 aa  345  7e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0359  3-ketoacyl-CoA thiolase  49.23 
 
 
390 aa  345  8.999999999999999e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0387  acetyl-CoA acetyltransferase  48.71 
 
 
390 aa  343  4e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1595  acetyl-CoA acetyltransferase  46.67 
 
 
394 aa  340  2e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0389  acetyl-CoA acetyltransferase  48.45 
 
 
390 aa  340  2e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.578535  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3596  acetyl-CoA acetyltransferase  47.06 
 
 
390 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5155  acetyl-CoA acetyltransferase  46.55 
 
 
390 aa  333  3e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5143  acetyl-CoA acetyltransferase  46.55 
 
 
390 aa  332  5e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5109  acetyl-CoA acetyltransferase  47.07 
 
 
392 aa  331  1e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1886  acetyl-CoA acetyltransferase  49.08 
 
 
391 aa  330  3e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00936644 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0095  acetyl-CoA acetyltransferase  46.55 
 
 
390 aa  330  3e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2969  acetyl-CoA acetyltransferase  49.07 
 
 
391 aa  330  3e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0816  acetyl-CoA acetyltransferase  48.23 
 
 
398 aa  329  4e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4834  acetyl-CoA acetyltransferase  46.04 
 
 
390 aa  329  4e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5117  acetyl-CoA acetyltransferase  46.29 
 
 
390 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4876  acetyl-CoA acetyltransferase  46.29 
 
 
390 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4718  acetyl-CoA acetyltransferase  46.29 
 
 
390 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5149  acetyl-CoA acetyltransferase  46.29 
 
 
390 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5248  acetyl-CoA acetyltransferase  46.29 
 
 
390 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4733  acetyl-CoA acetyltransferase  46.29 
 
 
390 aa  328  7e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  47.62 
 
 
398 aa  328  7e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  49.07 
 
 
392 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.867472  hitchhiker  0.0000022311 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  47.37 
 
 
398 aa  326  5e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2876  acetyl-CoA acetyltransferase  49.48 
 
 
390 aa  324  1e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.44366 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6698  acetyl-CoA acetyltransferase  48.97 
 
 
388 aa  325  1e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2266  acetyl-CoA acetyltransferase  47.56 
 
 
390 aa  324  2e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00024775 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1592  acetyl-CoA acetyltransferase  46.81 
 
 
390 aa  323  3e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.160886  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2470  3-ketoacyl-CoA thiolase  45.78 
 
 
391 aa  323  3e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.559901  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2058  thiolase  45.64 
 
 
399 aa  322  6e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.35513  normal  0.039203 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2125  acetyl-CoA acetyltransferase  46.82 
 
 
396 aa  322  6e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.533302 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1550  acetyl-CoA acetyltransferase  48.98 
 
 
399 aa  322  9.000000000000001e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000109593  hitchhiker  0.00778819 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2321  acetyl-CoA acetyltransferase  48.38 
 
 
402 aa  321  9.999999999999999e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0814  acetyl-CoA acetyltransferase  47.19 
 
 
400 aa  320  1.9999999999999998e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4085  acetyl-CoA acetyltransferase  46.7 
 
 
399 aa  320  3e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.802435  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2090  acetyl-CoA acetyltransferase  45.74 
 
 
390 aa  318  1e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000145195 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4393  acetyl-CoA acetyltransferase  45.5 
 
 
392 aa  318  1e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1160  acetyl-CoA acetyltransferase  45.52 
 
 
412 aa  318  1e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1306  acetyl-CoA acetyltransferase  45.69 
 
 
394 aa  317  2e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0595  acetyl-CoA acetyltransferase  47.21 
 
 
398 aa  317  2e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.837144 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4755  acetyl-CoA acetyltransferase  44.27 
 
 
393 aa  317  3e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.167553  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2127  acetyl-CoA acetyltransferase  45.48 
 
 
390 aa  316  3e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1706  acetyl-CoA acetyltransferase  45.74 
 
 
395 aa  315  6e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3516  acetyl-CoA acetyltransferase  47.46 
 
 
398 aa  315  6e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0022  3-ketoacyl-CoA thiolase  48.59 
 
 
387 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000376188 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1307  acetyl-CoA acetyltransferase  45.69 
 
 
394 aa  315  9.999999999999999e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06117  acetyl-CoA acetyltransferase  47.85 
 
 
401 aa  315  9.999999999999999e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0270862  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0574  acetyl-CoA acetyltransferase  46.95 
 
 
398 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01049  acetyl-CoA acetyltransferase  47.85 
 
 
401 aa  315  9.999999999999999e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.216841  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1803  acetyl-CoA acetyltransferase  48.33 
 
 
390 aa  314  1.9999999999999998e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1323  acetyl-CoA acetyltransferase  46.85 
 
 
402 aa  313  2.9999999999999996e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.158351 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0416  acetyl-CoA acetyltransferase  46.43 
 
 
399 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0081  acetyl-CoA acetyltransferase  43.84 
 
 
406 aa  312  4.999999999999999e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1205  acetyl-CoA acetyltransferase  45.93 
 
 
400 aa  312  6.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000642816 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1653  acetyl-CoA acetyltransferase  46.21 
 
 
402 aa  311  1e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.302534  normal  0.125875 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  48.07 
 
 
387 aa  311  1e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000295013 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0350  acetyl-CoA acetyltransferase  46.21 
 
 
399 aa  311  1e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0475  acetyl-CoA acetyltransferase  46.7 
 
 
399 aa  310  2e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73599  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0098  acetyl-CoA acetyltransferase  46.06 
 
 
400 aa  310  2e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.223566  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1582  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  46.17 
 
 
424 aa  310  2e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0365  acetyl-CoA acetyltransferase  45.96 
 
 
399 aa  310  2e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3748  3-ketoacyl-CoA thiolase  48.84 
 
 
387 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1145  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.83 
 
 
391 aa  310  2.9999999999999997e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112887  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0017  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.3 
 
 
387 aa  308  9e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11092  acetyl-CoA acetyltransferase  42.96 
 
 
405 aa  308  9e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.641884 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7110  acetyl-CoA acetyltransferase  45.66 
 
 
391 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3474  acetyl-CoA acetyltransferase  45.27 
 
 
399 aa  308  1.0000000000000001e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.158133  normal  0.651546 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0663  acetyl-CoA acetyltransferase  45.96 
 
 
399 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.336951  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0448  acetyl-CoA acetyltransferase  44.92 
 
 
398 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4036  acetyl-CoA acetyltransferase  45.96 
 
 
399 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.105517 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1305  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  45.87 
 
 
414 aa  307  2.0000000000000002e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1340  acetyl-CoA acetyltransferase  45.66 
 
 
398 aa  307  2.0000000000000002e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0580  acetyl-CoA acetyltransferase  45.96 
 
 
399 aa  306  3e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0566  acetyl-CoA acetyltransferase  45.45 
 
 
399 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1472  acetyl-CoA acetyltransferase  42.86 
 
 
406 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0328581  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3064  acetyl-CoA acetyltransferase  45.6 
 
 
392 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0282  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.83 
 
 
387 aa  305  6e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.185398  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3934  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.83 
 
 
387 aa  305  6e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1911  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.83 
 
 
387 aa  305  6e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00597206 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3553  acetyl-CoA acetyltransferase  44.53 
 
 
392 aa  305  8.000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0573177  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0012  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.55 
 
 
387 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0031  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.3 
 
 
387 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.871061  normal  0.0355813 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0387  acetyl-CoA acetyltransferase  45.43 
 
 
399 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4030  acetyl-CoA acetyltransferase  46.17 
 
 
399 aa  304  2.0000000000000002e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000182841 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2637  acetyl-CoA acetyltransferase  45.45 
 
 
399 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.357851 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4189  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.25 
 
 
387 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>