More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3953 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_0814  acetyl-CoA acetyltransferase  84.89 
 
 
400 aa  684    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4030  acetyl-CoA acetyltransferase  79.6 
 
 
399 aa  653    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000182841 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3516  acetyl-CoA acetyltransferase  82.91 
 
 
398 aa  686    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3953  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
398 aa  811    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0618375  normal  0.754512 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0574  acetyl-CoA acetyltransferase  85.68 
 
 
398 aa  704    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1340  acetyl-CoA acetyltransferase  84.42 
 
 
398 aa  691    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0416  acetyl-CoA acetyltransferase  78.34 
 
 
399 aa  648    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4085  acetyl-CoA acetyltransferase  85.39 
 
 
399 aa  702    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.802435  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3474  acetyl-CoA acetyltransferase  95.47 
 
 
399 aa  773    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.158133  normal  0.651546 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0595  acetyl-CoA acetyltransferase  85.93 
 
 
398 aa  709    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.837144 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0475  acetyl-CoA acetyltransferase  73.8 
 
 
399 aa  617  1e-176  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73599  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0448  acetyl-CoA acetyltransferase  74.62 
 
 
398 aa  620  1e-176  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0365  acetyl-CoA acetyltransferase  73.3 
 
 
399 aa  608  1e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0350  acetyl-CoA acetyltransferase  73.8 
 
 
399 aa  610  1e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0387  acetyl-CoA acetyltransferase  73.8 
 
 
399 aa  610  1e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0387  acetyl-CoA acetyltransferase  74.87 
 
 
398 aa  601  1.0000000000000001e-171  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.618119  decreased coverage  0.00238566 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0199  acetyl-CoA acetyltransferase  70.78 
 
 
399 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0859  acetyl-CoA acetyltransferase  70.78 
 
 
399 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6046  acetyl-CoA acetyltransferase  71.79 
 
 
399 aa  597  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2746  acetyl-CoA acetyltransferase  72.04 
 
 
399 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0055718  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0697  acetyl-CoA acetyltransferase  70.78 
 
 
399 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.767205  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2412  acetyl-CoA acetyltransferase  70.78 
 
 
399 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.804576  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4036  acetyl-CoA acetyltransferase  71.54 
 
 
399 aa  594  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.105517 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2107  acetyl-CoA acetyltransferase  72.04 
 
 
399 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0857857  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0682  acetyl-CoA acetyltransferase  70.78 
 
 
399 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2332  acetyl-CoA acetyltransferase  70.78 
 
 
399 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0663  acetyl-CoA acetyltransferase  71.79 
 
 
399 aa  595  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.336951  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2746  acetyl-CoA acetyltransferase  70.78 
 
 
399 aa  595  1e-169  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2719  acetyl-CoA acetyltransferase  72.04 
 
 
399 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2637  acetyl-CoA acetyltransferase  71.54 
 
 
399 aa  592  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.357851 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0566  acetyl-CoA acetyltransferase  70.78 
 
 
399 aa  593  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0580  acetyl-CoA acetyltransferase  70.53 
 
 
399 aa  592  1e-168  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2771  acetyl-CoA acetyltransferase  71.54 
 
 
399 aa  592  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0964  acetyl-CoA acetyltransferase  73.3 
 
 
398 aa  593  1e-168  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0098  acetyl-CoA acetyltransferase  64.81 
 
 
400 aa  537  1e-151  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.223566  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06117  acetyl-CoA acetyltransferase  63.41 
 
 
401 aa  512  1e-144  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0270862  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01049  acetyl-CoA acetyltransferase  63.41 
 
 
401 aa  512  1e-144  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.216841  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1653  acetyl-CoA acetyltransferase  62.16 
 
 
402 aa  510  1e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.302534  normal  0.125875 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1550  acetyl-CoA acetyltransferase  61.87 
 
 
399 aa  496  1e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000109593  hitchhiker  0.00778819 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2125  acetyl-CoA acetyltransferase  60.91 
 
 
396 aa  496  1e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.533302 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0810  acetyl-CoA acetyltransferase  62.66 
 
 
399 aa  493  9.999999999999999e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1307  acetyl-CoA acetyltransferase  55.5 
 
 
394 aa  461  9.999999999999999e-129  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1306  acetyl-CoA acetyltransferase  54.99 
 
 
394 aa  459  9.999999999999999e-129  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5109  acetyl-CoA acetyltransferase  57 
 
 
392 aa  436  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4393  acetyl-CoA acetyltransferase  57.11 
 
 
392 aa  419  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0359  3-ketoacyl-CoA thiolase  53.45 
 
 
390 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0387  acetyl-CoA acetyltransferase  53.96 
 
 
390 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4531  acetyl-CoA acetyltransferase  53.44 
 
 
384 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2470  3-ketoacyl-CoA thiolase  52.51 
 
 
391 aa  407  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.559901  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0389  acetyl-CoA acetyltransferase  53.71 
 
 
390 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.578535  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3553  acetyl-CoA acetyltransferase  52.3 
 
 
392 aa  399  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0573177  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06175  acetyl-CoA acyltransferase  53.06 
 
 
396 aa  400  9.999999999999999e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1595  acetyl-CoA acetyltransferase  52.67 
 
 
394 aa  394  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1592  acetyl-CoA acetyltransferase  53.03 
 
 
390 aa  389  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.160886  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  54.77 
 
 
392 aa  389  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.867472  hitchhiker  0.0000022311 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3590  acetyl-CoA acetyltransferase  52.81 
 
 
394 aa  390  1e-107  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2969  acetyl-CoA acetyltransferase  53.28 
 
 
391 aa  390  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1886  acetyl-CoA acetyltransferase  53.14 
 
 
391 aa  389  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00936644 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0618  Acetyl-CoA C-acyltransferase  51.4 
 
 
400 aa  388  1e-106  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.206368  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3064  acetyl-CoA acetyltransferase  53.44 
 
 
392 aa  385  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3723  acetyl-CoA acetyltransferase  50.64 
 
 
392 aa  385  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4755  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 
393 aa  384  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.167553  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7110  acetyl-CoA acetyltransferase  51.74 
 
 
391 aa  378  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  48.23 
 
 
392 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000894654  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2090  acetyl-CoA acetyltransferase  52.28 
 
 
390 aa  375  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000145195 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1706  acetyl-CoA acetyltransferase  50.39 
 
 
395 aa  376  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2936  acetyl-CoA acetyltransferase  48.61 
 
 
390 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3087  acetyl-CoA acetyltransferase  48.35 
 
 
390 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3596  acetyl-CoA acetyltransferase  49.88 
 
 
390 aa  371  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2127  acetyl-CoA acetyltransferase  51.26 
 
 
390 aa  369  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0221  acetyl-CoA acetyltransferase  49.37 
 
 
394 aa  368  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0215  acetyl-CoA acetyltransferase  49.37 
 
 
394 aa  368  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5143  acetyl-CoA acetyltransferase  49.63 
 
 
390 aa  363  3e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5155  acetyl-CoA acetyltransferase  49.63 
 
 
390 aa  362  8e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4876  acetyl-CoA acetyltransferase  49.38 
 
 
390 aa  359  5e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4718  acetyl-CoA acetyltransferase  49.38 
 
 
390 aa  359  5e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5248  acetyl-CoA acetyltransferase  49.38 
 
 
390 aa  359  5e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5149  acetyl-CoA acetyltransferase  49.38 
 
 
390 aa  359  5e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5117  acetyl-CoA acetyltransferase  49.38 
 
 
390 aa  359  5e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4733  acetyl-CoA acetyltransferase  49.13 
 
 
390 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2876  acetyl-CoA acetyltransferase  50.64 
 
 
390 aa  357  2.9999999999999997e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.44366 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  48.61 
 
 
394 aa  356  2.9999999999999997e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117931  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4834  acetyl-CoA acetyltransferase  48.88 
 
 
390 aa  356  3.9999999999999996e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0095  acetyl-CoA acetyltransferase  48.88 
 
 
390 aa  356  5e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1803  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 
390 aa  344  1e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2266  acetyl-CoA acetyltransferase  48.99 
 
 
390 aa  342  7e-93  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00024775 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2056  3-ketoacyl-CoA thiolase  48.86 
 
 
392 aa  340  2e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.150034  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2013  acetyl-CoA acetyltransferase  47.8 
 
 
401 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.536911  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1205  acetyl-CoA acetyltransferase  46.84 
 
 
400 aa  339  5e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000642816 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6698  acetyl-CoA acetyltransferase  46.85 
 
 
388 aa  332  8e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0816  acetyl-CoA acetyltransferase  46.57 
 
 
398 aa  330  3e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2058  thiolase  45.61 
 
 
399 aa  329  5.0000000000000004e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.35513  normal  0.039203 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  44.15 
 
 
398 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  44.15 
 
 
398 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2860  acetyl-CoA acetyltransferase  45.72 
 
 
403 aa  326  5e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1554  beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.2 
 
 
402 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1323  acetyl-CoA acetyltransferase  46.6 
 
 
402 aa  321  1.9999999999999998e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.158351 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05285  acetyl-CoA acetyltransferase  45.54 
 
 
404 aa  320  3e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3228  acetyl-CoA acetyltransferase  44.16 
 
 
395 aa  320  3e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.404919  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1822  acetyl-CoA acetyltransferase  46.31 
 
 
392 aa  319  5e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.403448  normal  0.861875 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>