More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1340 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_0814  acetyl-CoA acetyltransferase  88.92 
 
 
400 aa  705    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0595  acetyl-CoA acetyltransferase  92.71 
 
 
398 aa  751    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.837144 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3516  acetyl-CoA acetyltransferase  80.15 
 
 
398 aa  660    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3953  acetyl-CoA acetyltransferase  84.42 
 
 
398 aa  691    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0618375  normal  0.754512 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0574  acetyl-CoA acetyltransferase  92.96 
 
 
398 aa  750    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1340  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
398 aa  800    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3474  acetyl-CoA acetyltransferase  84.13 
 
 
399 aa  684    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.158133  normal  0.651546 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4085  acetyl-CoA acetyltransferase  90.43 
 
 
399 aa  728    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.802435  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0475  acetyl-CoA acetyltransferase  77.33 
 
 
399 aa  631  1e-180  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73599  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0448  acetyl-CoA acetyltransferase  78.14 
 
 
398 aa  633  1e-180  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4030  acetyl-CoA acetyltransferase  78.09 
 
 
399 aa  626  1e-178  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000182841 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0416  acetyl-CoA acetyltransferase  76.83 
 
 
399 aa  625  1e-178  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0350  acetyl-CoA acetyltransferase  76.83 
 
 
399 aa  626  1e-178  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0387  acetyl-CoA acetyltransferase  79.65 
 
 
398 aa  624  1e-178  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.618119  decreased coverage  0.00238566 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0365  acetyl-CoA acetyltransferase  76.32 
 
 
399 aa  624  1e-177  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0387  acetyl-CoA acetyltransferase  75.31 
 
 
399 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0663  acetyl-CoA acetyltransferase  74.56 
 
 
399 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.336951  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4036  acetyl-CoA acetyltransferase  74.06 
 
 
399 aa  610  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.105517 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2746  acetyl-CoA acetyltransferase  74.31 
 
 
399 aa  608  1e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0055718  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2107  acetyl-CoA acetyltransferase  74.31 
 
 
399 aa  608  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0857857  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2719  acetyl-CoA acetyltransferase  74.31 
 
 
399 aa  608  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0199  acetyl-CoA acetyltransferase  72.8 
 
 
399 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0697  acetyl-CoA acetyltransferase  72.8 
 
 
399 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.767205  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0859  acetyl-CoA acetyltransferase  72.8 
 
 
399 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2332  acetyl-CoA acetyltransferase  72.8 
 
 
399 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2746  acetyl-CoA acetyltransferase  72.8 
 
 
399 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6046  acetyl-CoA acetyltransferase  73.8 
 
 
399 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0566  acetyl-CoA acetyltransferase  73.05 
 
 
399 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0682  acetyl-CoA acetyltransferase  72.8 
 
 
399 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0580  acetyl-CoA acetyltransferase  73.3 
 
 
399 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2412  acetyl-CoA acetyltransferase  72.8 
 
 
399 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.804576  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2771  acetyl-CoA acetyltransferase  73.55 
 
 
399 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2637  acetyl-CoA acetyltransferase  73.55 
 
 
399 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.357851 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0964  acetyl-CoA acetyltransferase  71.28 
 
 
398 aa  573  1.0000000000000001e-162  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0098  acetyl-CoA acetyltransferase  66.5 
 
 
400 aa  538  9.999999999999999e-153  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.223566  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1653  acetyl-CoA acetyltransferase  65.91 
 
 
402 aa  536  1e-151  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.302534  normal  0.125875 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06117  acetyl-CoA acetyltransferase  66.33 
 
 
401 aa  532  1e-150  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0270862  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01049  acetyl-CoA acetyltransferase  66.33 
 
 
401 aa  532  1e-150  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.216841  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1550  acetyl-CoA acetyltransferase  64.65 
 
 
399 aa  510  1e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000109593  hitchhiker  0.00778819 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2125  acetyl-CoA acetyltransferase  64.47 
 
 
396 aa  511  1e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.533302 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0810  acetyl-CoA acetyltransferase  65.34 
 
 
399 aa  501  1e-140  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1307  acetyl-CoA acetyltransferase  56.23 
 
 
394 aa  460  9.999999999999999e-129  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1306  acetyl-CoA acetyltransferase  55.73 
 
 
394 aa  457  1e-127  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5109  acetyl-CoA acetyltransferase  59.03 
 
 
392 aa  445  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0389  acetyl-CoA acetyltransferase  57.03 
 
 
390 aa  426  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.578535  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0359  3-ketoacyl-CoA thiolase  56.78 
 
 
390 aa  422  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0387  acetyl-CoA acetyltransferase  56.78 
 
 
390 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1886  acetyl-CoA acetyltransferase  56.4 
 
 
391 aa  409  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00936644 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4393  acetyl-CoA acetyltransferase  56.49 
 
 
392 aa  409  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2470  3-ketoacyl-CoA thiolase  52.41 
 
 
391 aa  409  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.559901  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2969  acetyl-CoA acetyltransferase  56.17 
 
 
391 aa  406  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1595  acetyl-CoA acetyltransferase  53.94 
 
 
394 aa  407  1.0000000000000001e-112  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3553  acetyl-CoA acetyltransferase  52.42 
 
 
392 aa  404  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0573177  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  56.17 
 
 
392 aa  399  9.999999999999999e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.867472  hitchhiker  0.0000022311 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0618  Acetyl-CoA C-acyltransferase  53.67 
 
 
400 aa  399  9.999999999999999e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.206368  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4531  acetyl-CoA acetyltransferase  50.89 
 
 
384 aa  396  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2936  acetyl-CoA acetyltransferase  51.39 
 
 
390 aa  395  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3590  acetyl-CoA acetyltransferase  53.83 
 
 
394 aa  396  1e-109  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3064  acetyl-CoA acetyltransferase  55.36 
 
 
392 aa  395  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1592  acetyl-CoA acetyltransferase  53.42 
 
 
390 aa  393  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.160886  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06175  acetyl-CoA acyltransferase  52.41 
 
 
396 aa  392  1e-108  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0215  acetyl-CoA acetyltransferase  51.39 
 
 
394 aa  389  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0221  acetyl-CoA acetyltransferase  51.39 
 
 
394 aa  389  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2090  acetyl-CoA acetyltransferase  53.44 
 
 
390 aa  385  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000145195 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3087  acetyl-CoA acetyltransferase  50.76 
 
 
390 aa  385  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  48.48 
 
 
392 aa  382  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000894654  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3723  acetyl-CoA acetyltransferase  51.65 
 
 
392 aa  382  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2127  acetyl-CoA acetyltransferase  53.16 
 
 
390 aa  382  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7110  acetyl-CoA acetyltransferase  51.24 
 
 
391 aa  378  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1706  acetyl-CoA acetyltransferase  52.71 
 
 
395 aa  377  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3596  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 
390 aa  375  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4755  acetyl-CoA acetyltransferase  49.62 
 
 
393 aa  374  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.167553  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5143  acetyl-CoA acetyltransferase  49.62 
 
 
390 aa  369  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5155  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 
390 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5117  acetyl-CoA acetyltransferase  49.87 
 
 
390 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5149  acetyl-CoA acetyltransferase  49.62 
 
 
390 aa  365  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4876  acetyl-CoA acetyltransferase  49.87 
 
 
390 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4718  acetyl-CoA acetyltransferase  49.87 
 
 
390 aa  366  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4733  acetyl-CoA acetyltransferase  49.87 
 
 
390 aa  366  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2876  acetyl-CoA acetyltransferase  53.15 
 
 
390 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.44366 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5248  acetyl-CoA acetyltransferase  49.87 
 
 
390 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0095  acetyl-CoA acetyltransferase  49.62 
 
 
390 aa  364  1e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4834  acetyl-CoA acetyltransferase  49.36 
 
 
390 aa  364  2e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2266  acetyl-CoA acetyltransferase  51.01 
 
 
390 aa  353  2.9999999999999997e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00024775 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2056  3-ketoacyl-CoA thiolase  49.37 
 
 
392 aa  347  2e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.150034  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6698  acetyl-CoA acetyltransferase  48.1 
 
 
388 aa  344  1e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  46.34 
 
 
398 aa  342  9e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2058  thiolase  47.22 
 
 
399 aa  340  2e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.35513  normal  0.039203 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  45.82 
 
 
394 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117931  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  46.34 
 
 
398 aa  338  7e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1803  acetyl-CoA acetyltransferase  49.87 
 
 
390 aa  337  1.9999999999999998e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0816  acetyl-CoA acetyltransferase  46.57 
 
 
398 aa  333  4e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1323  acetyl-CoA acetyltransferase  49.27 
 
 
402 aa  332  9e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.158351 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2321  acetyl-CoA acetyltransferase  47.83 
 
 
402 aa  330  2e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0301  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  47.93 
 
 
401 aa  330  3e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179307  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0659  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.21 
 
 
401 aa  328  9e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.993676  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2013  acetyl-CoA acetyltransferase  46.72 
 
 
401 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.536911  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2156  acetyl-CoA acetyltransferase  49.26 
 
 
404 aa  326  4.0000000000000003e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.744792  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1582  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  44.91 
 
 
424 aa  325  7e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3228  acetyl-CoA acetyltransferase  45.04 
 
 
395 aa  325  9e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.404919  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>