More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2127 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2127  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 		 390 aa  794    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2090  acetyl-CoA acetyltransferase  96.66 
 
 		 390 aa  744    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000145195 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1592  acetyl-CoA acetyltransferase  71.01 
 
 		 390 aa  565  1e-160  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.160886  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0387  acetyl-CoA acetyltransferase  68.56 
 
 		 390 aa  542  1e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0389  acetyl-CoA acetyltransferase  67.53 
 
 		 390 aa  538  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.578535  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0359  3-ketoacyl-CoA thiolase  66.75 
 
 		 390 aa  534  1e-150  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2876  acetyl-CoA acetyltransferase  65.98 
 
 		 390 aa  509  1e-143  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.44366 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2936  acetyl-CoA acetyltransferase  58.46 
 
 		 390 aa  464  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2470  3-ketoacyl-CoA thiolase  59.13 
 
 		 391 aa  466  9.999999999999999e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.559901  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3087  acetyl-CoA acetyltransferase  57.69 
 
 		 390 aa  456  1e-127  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1886  acetyl-CoA acetyltransferase  60.1 
 
 		 391 aa  457  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00936644 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  58.52 
 
 		 392 aa  456  1e-127  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000894654  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3596  acetyl-CoA acetyltransferase  57.03 
 
 		 390 aa  448  1e-125  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2969  acetyl-CoA acetyltransferase  57.82 
 
 		 391 aa  449  1e-125  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5143  acetyl-CoA acetyltransferase  56.63 
 
 		 390 aa  442  1e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5155  acetyl-CoA acetyltransferase  56.63 
 
 		 390 aa  441  1e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4393  acetyl-CoA acetyltransferase  58.42 
 
 		 392 aa  443  1e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5149  acetyl-CoA acetyltransferase  56.38 
 
 		 390 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4876  acetyl-CoA acetyltransferase  56.38 
 
 		 390 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5117  acetyl-CoA acetyltransferase  56.38 
 
 		 390 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4718  acetyl-CoA acetyltransferase  56.38 
 
 		 390 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4733  acetyl-CoA acetyltransferase  56.38 
 
 		 390 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5248  acetyl-CoA acetyltransferase  56.38 
 
 		 390 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0095  acetyl-CoA acetyltransferase  56.12 
 
 		 390 aa  436  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4834  acetyl-CoA acetyltransferase  56.12 
 
 		 390 aa  437  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1595  acetyl-CoA acetyltransferase  57.14 
 
 		 394 aa  432  1e-120  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4531  acetyl-CoA acetyltransferase  57.03 
 
 		 384 aa  429  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  60.32 
 
 		 392 aa  431  1e-119  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.867472  hitchhiker  0.0000022311 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0618  Acetyl-CoA C-acyltransferase  54.5 
 
 		 400 aa  423  1e-117  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.206368  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1706  acetyl-CoA acetyltransferase  56.53 
 
 		 395 aa  419  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3064  acetyl-CoA acetyltransferase  55.59 
 
 		 392 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1653  acetyl-CoA acetyltransferase  56.31 
 
 		 402 aa  416  9.999999999999999e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.302534  normal  0.125875 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2125  acetyl-CoA acetyltransferase  55.75 
 
 		 396 aa  416  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.533302 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3723  acetyl-CoA acetyltransferase  52.3 
 
 		 392 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06117  acetyl-CoA acetyltransferase  54.94 
 
 		 401 aa  404  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0270862  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01049  acetyl-CoA acetyltransferase  54.94 
 
 		 401 aa  404  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.216841  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1340  acetyl-CoA acetyltransferase  53.16 
 
 		 398 aa  398  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3590  acetyl-CoA acetyltransferase  53.35 
 
 		 394 aa  401  9.999999999999999e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5109  acetyl-CoA acetyltransferase  53.09 
 
 		 392 aa  401  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4085  acetyl-CoA acetyltransferase  52.66 
 
 		 399 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.802435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0595  acetyl-CoA acetyltransferase  52.66 
 
 		 398 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.837144 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0580  acetyl-CoA acetyltransferase  53.44 
 
 		 399 aa  395  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1307  acetyl-CoA acetyltransferase  53.32 
 
 		 394 aa  395  1e-109  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1306  acetyl-CoA acetyltransferase  53.32 
 
 		 394 aa  395  1e-109  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0448  acetyl-CoA acetyltransferase  51.77 
 
 		 398 aa  397  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0365  acetyl-CoA acetyltransferase  52.79 
 
 		 399 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0350  acetyl-CoA acetyltransferase  52.79 
 
 		 399 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0574  acetyl-CoA acetyltransferase  52.41 
 
 		 398 aa  397  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2266  acetyl-CoA acetyltransferase  51.03 
 
 		 390 aa  392  1e-108  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024775 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0098  acetyl-CoA acetyltransferase  52.43 
 
 		 400 aa  391  1e-108  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.223566  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0566  acetyl-CoA acetyltransferase  53.05 
 
 		 399 aa  392  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0387  acetyl-CoA acetyltransferase  52.91 
 
 		 399 aa  393  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4755  acetyl-CoA acetyltransferase  52.16 
 
 		 393 aa  393  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.167553  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0475  acetyl-CoA acetyltransferase  51.52 
 
 		 399 aa  389  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0697  acetyl-CoA acetyltransferase  52.54 
 
 		 399 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.767205  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2746  acetyl-CoA acetyltransferase  52.54 
 
 		 399 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0199  acetyl-CoA acetyltransferase  52.54 
 
 		 399 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2637  acetyl-CoA acetyltransferase  53.3 
 
 		 399 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.357851 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0859  acetyl-CoA acetyltransferase  52.54 
 
 		 399 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6046  acetyl-CoA acetyltransferase  53.18 
 
 		 399 aa  389  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2412  acetyl-CoA acetyltransferase  52.54 
 
 		 399 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.804576  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7110  acetyl-CoA acetyltransferase  51.28 
 
 		 391 aa  389  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0663  acetyl-CoA acetyltransferase  52.42 
 
 		 399 aa  390  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.336951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4036  acetyl-CoA acetyltransferase  52.42 
 
 		 399 aa  389  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.105517 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2107  acetyl-CoA acetyltransferase  53.3 
 
 		 399 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0857857  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2332  acetyl-CoA acetyltransferase  52.54 
 
 		 399 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2771  acetyl-CoA acetyltransferase  53.3 
 
 		 399 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2746  acetyl-CoA acetyltransferase  53.3 
 
 		 399 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0055718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2719  acetyl-CoA acetyltransferase  53.3 
 
 		 399 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4030  acetyl-CoA acetyltransferase  52.41 
 
 		 399 aa  389  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000182841 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0682  acetyl-CoA acetyltransferase  52.54 
 
 		 399 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3553  acetyl-CoA acetyltransferase  51.67 
 
 		 392 aa  390  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0573177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3953  acetyl-CoA acetyltransferase  51.26 
 
 		 398 aa  385  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0618375  normal  0.754512 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0810  acetyl-CoA acetyltransferase  53.77 
 
 		 399 aa  385  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0416  acetyl-CoA acetyltransferase  50.89 
 
 		 399 aa  386  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2056  3-ketoacyl-CoA thiolase  55.64 
 
 		 392 aa  386  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.150034  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0814  acetyl-CoA acetyltransferase  52.15 
 
 		 400 aa  385  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06175  acetyl-CoA acyltransferase  52.66 
 
 		 396 aa  387  1e-106  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3474  acetyl-CoA acetyltransferase  51.77 
 
 		 399 aa  387  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.158133  normal  0.651546 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0221  acetyl-CoA acetyltransferase  51.15 
 
 		 394 aa  382  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0215  acetyl-CoA acetyltransferase  51.15 
 
 		 394 aa  382  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1550  acetyl-CoA acetyltransferase  52.15 
 
 		 399 aa  380  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000109593  hitchhiker  0.00778819 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  50.51 
 
 		 394 aa  379  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117931  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0387  acetyl-CoA acetyltransferase  52.66 
 
 		 398 aa  381  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.618119  decreased coverage  0.00238566 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1803  acetyl-CoA acetyltransferase  50.77 
 
 		 390 aa  375  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3516  acetyl-CoA acetyltransferase  51.01 
 
 		 398 aa  372  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0964  acetyl-CoA acetyltransferase  50.89 
 
 		 398 aa  369  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6698  acetyl-CoA acetyltransferase  49.87 
 
 		 388 aa  358  9.999999999999999e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1370  acetyl-CoA acetyltransferase  47.84 
 
 		 392 aa  347  1e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0227304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3228  acetyl-CoA acetyltransferase  48.21 
 
 		 395 aa  347  2e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.404919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1756  acetyl-CoA acetyltransferase  48.31 
 
 		 378 aa  346  3e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.404662  normal  0.415846 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0625  acetyl-CoA acetyltransferase  47.94 
 
 		 378 aa  344  2e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6175  acetyl-CoA acetyltransferase  46.56 
 
 		 392 aa  343  4e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1904  acetyl-CoA acetyltransferase  46.56 
 
 		 392 aa  343  4e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1927  acetyl-CoA acetyltransferase  46.56 
 
 		 392 aa  342  5e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.114356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1892  acetyl-CoA acetyltransferase  46.31 
 
 		 392 aa  342  7e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.266832  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1822  acetyl-CoA acetyltransferase  46.31 
 
 		 392 aa  341  1e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.403448  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5088  acetyl-CoA acetyltransferase  48.11 
 
 		 385 aa  340  2e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225671  normal  0.910861 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0816  acetyl-CoA acetyltransferase  46.93 
 
 		 398 aa  340  2.9999999999999998e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1776  acetyl-CoA acetyltransferase  47.45 
 
 		 391 aa  338  8e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289993  normal  0.098501 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>