More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1822 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc1761  acetyl-CoA acetyltransferase  84.18 
 
 
392 aa  675    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.402553  normal  0.162883 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1436  acetyl-CoA acetyltransferase  89.8 
 
 
392 aa  716    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00245654  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1407  acetyl-CoA acetyltransferase  83.67 
 
 
392 aa  657    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2453  acetyl-CoA acetyltransferase  89.8 
 
 
392 aa  716    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5205  acetyl-CoA acetyltransferase  94.64 
 
 
392 aa  763    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.078979  normal  0.600477 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1445  acetyl-CoA acetyltransferase  83.42 
 
 
392 aa  672    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0121252 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3378  acetyl-CoA acetyltransferase  89.8 
 
 
392 aa  716    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.890871  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2144  acetyl-CoA acetyltransferase  90.31 
 
 
392 aa  707    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.391894  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2331  acetyl-CoA acetyltransferase  89.8 
 
 
392 aa  716    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1927  acetyl-CoA acetyltransferase  87.76 
 
 
392 aa  697    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.294769  normal  0.635162 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1822  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
392 aa  795    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.403448  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1904  acetyl-CoA acetyltransferase  95.92 
 
 
392 aa  769    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2273  acetyl-CoA acetyltransferase  88.27 
 
 
392 aa  712    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0444275  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1199  acetyl-CoA acetyltransferase  89.8 
 
 
392 aa  716    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1030  acetyl-CoA acetyltransferase  87.76 
 
 
392 aa  702    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.919857  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1853  acetyl-CoA acetyltransferase  83.67 
 
 
392 aa  679    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.204279 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1370  acetyl-CoA acetyltransferase  93.37 
 
 
392 aa  747    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0227304  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6175  acetyl-CoA acetyltransferase  95.92 
 
 
392 aa  769    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1486  acetyl-CoA acetyltransferase  83.42 
 
 
392 aa  674    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.250255  normal  0.0145622 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1926  acetyl-CoA acetyltransferase  89.8 
 
 
392 aa  716    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1927  acetyl-CoA acetyltransferase  95.66 
 
 
392 aa  767    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.114356  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1892  acetyl-CoA acetyltransferase  99.23 
 
 
392 aa  791    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.266832  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2292  acetyl-CoA acetyltransferase  89.8 
 
 
392 aa  716    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179446  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2923  acetyl-CoA acetyltransferase  75.77 
 
 
391 aa  612  9.999999999999999e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1776  acetyl-CoA acetyltransferase  75.26 
 
 
391 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289993  normal  0.098501 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1843  acetyl-CoA acetyltransferase  75.51 
 
 
391 aa  603  1.0000000000000001e-171  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.445136 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2879  acetyl-CoA acetyltransferase  76.47 
 
 
391 aa  594  1e-169  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3314  acetyl-CoA acetyltransferase  75 
 
 
391 aa  589  1e-167  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0123072 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1685  acetyl-CoA acetyltransferase  75.77 
 
 
391 aa  587  1e-166  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.720161 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2385  acetyl-CoA acetyltransferase  75.26 
 
 
404 aa  585  1e-166  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0553923  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2572  acetyl-CoA acetyltransferase  76.28 
 
 
391 aa  585  1e-166  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2019  acetyl-CoA acetyltransferase  75.77 
 
 
391 aa  587  1e-166  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263053  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17360  Acetyl-CoA C-acyltransferase  71.17 
 
 
393 aa  578  1e-164  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.880406  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1791  acetyl-CoA acetyltransferase  72.7 
 
 
391 aa  572  1.0000000000000001e-162  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0755  acetyl-CoA acetyltransferase  66.92 
 
 
393 aa  551  1e-156  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7072  acetyl-CoA acetyltransferase  62.94 
 
 
395 aa  506  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.769986  normal  0.992242 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0915  thiolase  64.01 
 
 
393 aa  504  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000139081  normal  0.129634 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5443  acetyl-CoA acetyltransferase  61.9 
 
 
400 aa  499  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3551  Acetyl-CoA C-acyltransferase  63.71 
 
 
395 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4236  acetyl-CoA acetyltransferase  62.69 
 
 
395 aa  497  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2228  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  62.69 
 
 
395 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138441  normal  0.114685 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2665  acetyl-CoA acetyltransferases  64.29 
 
 
390 aa  497  1e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1748  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  62.18 
 
 
395 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0185484 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02317  acetyl-CoA acetyltransferase  61.58 
 
 
393 aa  490  1e-137  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.342812  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1576  acetyl-CoA acetyltransferase  61.99 
 
 
390 aa  485  1e-136  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.221288  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0235  acetyl-CoA acetyltransferase  61.9 
 
 
400 aa  484  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00445966 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0358  Acetyl-CoA C-acyltransferase  62.69 
 
 
395 aa  485  1e-136  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1917  acetyl-CoA acetyltransferases  60.2 
 
 
394 aa  486  1e-136  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.520432  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1059  acetyl-CoA acetyltransferase  60.46 
 
 
394 aa  481  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0279  thiolase  62.69 
 
 
395 aa  481  1e-134  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.753614  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4001  acetyl-CoA acetyltransferase  64.38 
 
 
393 aa  480  1e-134  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4960  acetyl-CoA acetyltransferases  59.4 
 
 
400 aa  478  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.325325  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0345  acetyl-CoA acetyltransferase  60.97 
 
 
392 aa  474  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.591662  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0843  acetyl-CoA acetyltransferase  60.51 
 
 
396 aa  473  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.777986  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2594  Acetyl-CoA C-acyltransferase  60.97 
 
 
393 aa  472  1e-132  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5147  acetyl-CoA acetyltransferase  63.2 
 
 
395 aa  473  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.249101  normal  0.0151014 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3738  acetyl-CoA acetyltransferases  60.85 
 
 
399 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3019  acetyl-CoA acetyltransferase  60.85 
 
 
399 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104781  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4193  acetyl-CoA acetyltransferases  60.36 
 
 
393 aa  467  9.999999999999999e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.451307 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0361  Acetyl-CoA C-acyltransferase  59.9 
 
 
392 aa  465  9.999999999999999e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2063  acetyl-CoA acetyltransferases  59.29 
 
 
393 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4010  acetyl-CoA acetyltransferase  60.71 
 
 
390 aa  462  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0289806  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7559  Acetyl-CoA C-acyltransferase  59.29 
 
 
394 aa  463  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0152588  normal  0.387222 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6062  thiolase  59.03 
 
 
394 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4752  acetyl-CoA acetyltransferase  59.9 
 
 
395 aa  460  9.999999999999999e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.057105 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5357  acetyl-CoA acetyltransferase  60.05 
 
 
394 aa  459  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1445  Acetyl-CoA C-acyltransferase  57.64 
 
 
401 aa  457  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279088  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1572  thiolase  58 
 
 
401 aa  451  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.922129  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2858  acetyl-CoA acetyltransferase  57.51 
 
 
394 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3636  acetyl-CoA acetyltransferase  59.15 
 
 
400 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.48902 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1394  acetyl-CoA acetyltransferase  59.95 
 
 
398 aa  449  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0867  Acetyl-CoA C-acyltransferase  60.97 
 
 
391 aa  451  1e-125  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4857  acetyl-CoA acetyltransferase  59.95 
 
 
392 aa  449  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.328315  hitchhiker  0.00599656 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1725  acetyl-CoA acetyltransferase  57.79 
 
 
394 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0243329  normal  0.192279 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2162  Acetyl-CoA C-acyltransferase  59.69 
 
 
393 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.226384  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3098  Acetyl-CoA C-acyltransferase  57.76 
 
 
394 aa  442  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.83721  normal  0.450292 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0494  acetyl-CoA acetyltransferase  59.2 
 
 
406 aa  440  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  55.14 
 
 
401 aa  430  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3228  acetyl-CoA acetyltransferase  55.5 
 
 
395 aa  424  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.404919  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1673  putative acyl-CoA thiolase  56.01 
 
 
394 aa  418  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145757  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19430  putative acyl-CoA thiolase  54.96 
 
 
394 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2051  acetyl-CoA acetyltransferase  55.7 
 
 
394 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.258769  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3690  acetyl-CoA acetyltransferase  55.7 
 
 
394 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4096  Acetyl-CoA C-acyltransferase  53.18 
 
 
394 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.521488  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3766  acetyl-CoA acetyltransferase  53.88 
 
 
400 aa  391  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.475759  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1595  acetyl-CoA acetyltransferase  54.45 
 
 
394 aa  388  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2936  acetyl-CoA acetyltransferase  52.03 
 
 
390 aa  383  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3087  acetyl-CoA acetyltransferase  52.41 
 
 
390 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 
392 aa  372  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000894654  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0618  Acetyl-CoA C-acyltransferase  52.28 
 
 
400 aa  373  1e-102  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.206368  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4393  acetyl-CoA acetyltransferase  53.55 
 
 
392 aa  367  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2470  3-ketoacyl-CoA thiolase  50.13 
 
 
391 aa  362  4e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.559901  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3596  acetyl-CoA acetyltransferase  49.24 
 
 
390 aa  358  8e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4531  acetyl-CoA acetyltransferase  49.24 
 
 
384 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5155  acetyl-CoA acetyltransferase  49.24 
 
 
390 aa  354  2e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2969  acetyl-CoA acetyltransferase  51.32 
 
 
391 aa  352  5e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1886  acetyl-CoA acetyltransferase  51.71 
 
 
391 aa  352  5.9999999999999994e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00936644 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5143  acetyl-CoA acetyltransferase  48.73 
 
 
390 aa  352  7e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4733  acetyl-CoA acetyltransferase  49.24 
 
 
390 aa  351  1e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4718  acetyl-CoA acetyltransferase  48.98 
 
 
390 aa  350  3e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>