More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3228 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3228  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 		 395 aa  811    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.404919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4096  Acetyl-CoA C-acyltransferase  85.53 
 
 		 394 aa  674    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.521488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1673  putative acyl-CoA thiolase  85.28 
 
 		 394 aa  680    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145757  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19430  putative acyl-CoA thiolase  85.53 
 
 		 394 aa  682    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4752  acetyl-CoA acetyltransferase  56.96 
 
 		 395 aa  447  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.057105 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0755  acetyl-CoA acetyltransferase  57.65 
 
 		 393 aa  445  1.0000000000000001e-124  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0494  acetyl-CoA acetyltransferase  56.22 
 
 		 406 aa  429  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6175  acetyl-CoA acetyltransferase  55.75 
 
 		 392 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1904  acetyl-CoA acetyltransferase  55.75 
 
 		 392 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1927  acetyl-CoA acetyltransferase  55.5 
 
 		 392 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.114356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1370  acetyl-CoA acetyltransferase  54.73 
 
 		 392 aa  423  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0227304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1822  acetyl-CoA acetyltransferase  55.5 
 
 		 392 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.403448  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0361  Acetyl-CoA C-acyltransferase  54.96 
 
 		 392 aa  423  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1892  acetyl-CoA acetyltransferase  55.24 
 
 		 392 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.266832  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5205  acetyl-CoA acetyltransferase  55.24 
 
 		 392 aa  420  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.078979  normal  0.600477 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1059  acetyl-CoA acetyltransferase  53.45 
 
 		 394 aa  419  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0235  acetyl-CoA acetyltransferase  54.25 
 
 		 400 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00445966 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1394  acetyl-CoA acetyltransferase  55.28 
 
 		 398 aa  413  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3378  acetyl-CoA acetyltransferase  54.73 
 
 		 392 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.890871  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1436  acetyl-CoA acetyltransferase  54.73 
 
 		 392 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00245654  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2453  acetyl-CoA acetyltransferase  54.73 
 
 		 392 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1926  acetyl-CoA acetyltransferase  54.73 
 
 		 392 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2273  acetyl-CoA acetyltransferase  53.96 
 
 		 392 aa  410  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0444275  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1199  acetyl-CoA acetyltransferase  54.73 
 
 		 392 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2292  acetyl-CoA acetyltransferase  54.73 
 
 		 392 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179446  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2331  acetyl-CoA acetyltransferase  54.73 
 
 		 392 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3636  acetyl-CoA acetyltransferase  53.25 
 
 		 400 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.48902 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02317  acetyl-CoA acetyltransferase  52.81 
 
 		 393 aa  405  1.0000000000000001e-112  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.342812  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2594  Acetyl-CoA C-acyltransferase  52.67 
 
 		 393 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3019  acetyl-CoA acetyltransferase  53.13 
 
 		 399 aa  408  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104781  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2858  acetyl-CoA acetyltransferase  52.64 
 
 		 394 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17360  Acetyl-CoA C-acyltransferase  52.16 
 
 		 393 aa  405  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.880406  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3738  acetyl-CoA acetyltransferases  53.13 
 
 		 399 aa  408  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5443  acetyl-CoA acetyltransferase  51.75 
 
 		 400 aa  402  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2144  acetyl-CoA acetyltransferase  54.99 
 
 		 392 aa  404  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.391894  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1030  acetyl-CoA acetyltransferase  55.75 
 
 		 392 aa  404  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.919857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3551  Acetyl-CoA C-acyltransferase  53.81 
 
 		 395 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1853  acetyl-CoA acetyltransferase  53.44 
 
 		 392 aa  404  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.204279 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4960  acetyl-CoA acetyltransferases  51.25 
 
 		 400 aa  403  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.325325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1572  thiolase  51.62 
 
 		 401 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.922129  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1748  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  53.55 
 
 		 395 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0185484 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2228  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  52.55 
 
 		 395 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138441  normal  0.114685 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1927  acetyl-CoA acetyltransferase  54.48 
 
 		 392 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.294769  normal  0.635162 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1917  acetyl-CoA acetyltransferases  50.76 
 
 		 394 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.520432  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1486  acetyl-CoA acetyltransferase  53.94 
 
 		 392 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.250255  normal  0.0145622 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1761  acetyl-CoA acetyltransferase  53.18 
 
 		 392 aa  395  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.402553  normal  0.162883 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1445  acetyl-CoA acetyltransferase  53.18 
 
 		 392 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0121252 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4236  acetyl-CoA acetyltransferase  53.05 
 
 		 395 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0843  acetyl-CoA acetyltransferase  51.52 
 
 		 396 aa  395  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.777986  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1407  acetyl-CoA acetyltransferase  53.94 
 
 		 392 aa  393  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1576  acetyl-CoA acetyltransferase  53.83 
 
 		 390 aa  392  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.221288  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7559  Acetyl-CoA C-acyltransferase  51.14 
 
 		 394 aa  393  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0152588  normal  0.387222 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7072  acetyl-CoA acetyltransferase  51.79 
 
 		 395 aa  390  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.769986  normal  0.992242 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  50.5 
 
 		 401 aa  390  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2063  acetyl-CoA acetyltransferases  52.3 
 
 		 393 aa  390  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2665  acetyl-CoA acetyltransferases  53.96 
 
 		 390 aa  388  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0279  thiolase  51.28 
 
 		 395 aa  387  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.753614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0358  Acetyl-CoA C-acyltransferase  51.53 
 
 		 395 aa  385  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1776  acetyl-CoA acetyltransferase  52.43 
 
 		 391 aa  386  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289993  normal  0.098501 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5357  acetyl-CoA acetyltransferase  51.4 
 
 		 394 aa  383  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6062  thiolase  50.38 
 
 		 394 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4001  acetyl-CoA acetyltransferase  53.57 
 
 		 393 aa  380  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1843  acetyl-CoA acetyltransferase  52.15 
 
 		 391 aa  379  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.445136 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0915  thiolase  48.47 
 
 		 393 aa  375  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000139081  normal  0.129634 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4857  acetyl-CoA acetyltransferase  50.25 
 
 		 392 aa  377  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.328315  hitchhiker  0.00599656 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2879  acetyl-CoA acetyltransferase  51.65 
 
 		 391 aa  375  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3314  acetyl-CoA acetyltransferase  51.65 
 
 		 391 aa  374  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0123072 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2923  acetyl-CoA acetyltransferase  49.87 
 
 		 391 aa  373  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1445  Acetyl-CoA C-acyltransferase  50.25 
 
 		 401 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3098  Acetyl-CoA C-acyltransferase  49.75 
 
 		 394 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.83721  normal  0.450292 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1685  acetyl-CoA acetyltransferase  50.89 
 
 		 391 aa  369  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.720161 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2936  acetyl-CoA acetyltransferase  51.52 
 
 		 390 aa  371  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5147  acetyl-CoA acetyltransferase  50.66 
 
 		 395 aa  371  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.249101  normal  0.0151014 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  52.69 
 
 		 392 aa  369  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.867472  hitchhiker  0.0000022311 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2019  acetyl-CoA acetyltransferase  50.89 
 
 		 391 aa  369  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263053  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1791  acetyl-CoA acetyltransferase  50.89 
 
 		 391 aa  368  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0345  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 		 392 aa  366  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.591662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2385  acetyl-CoA acetyltransferase  50.91 
 
 		 404 aa  366  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0553923  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2162  Acetyl-CoA C-acyltransferase  52.16 
 
 		 393 aa  365  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.226384  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1595  acetyl-CoA acetyltransferase  49.24 
 
 		 394 aa  364  2e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3087  acetyl-CoA acetyltransferase  50.26 
 
 		 390 aa  363  3e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  47.58 
 
 		 392 aa  363  3e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000894654  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1725  acetyl-CoA acetyltransferase  48.61 
 
 		 394 aa  363  3e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0243329  normal  0.192279 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2125  acetyl-CoA acetyltransferase  49.36 
 
 		 396 aa  361  1e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.533302 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0867  Acetyl-CoA C-acyltransferase  53.2 
 
 		 391 aa  360  2e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4010  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 		 390 aa  353  4e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0289806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2572  acetyl-CoA acetyltransferase  50.91 
 
 		 391 aa  352  8e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2470  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.46 
 
 		 391 aa  352  8.999999999999999e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.559901  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0618  Acetyl-CoA C-acyltransferase  47.72 
 
 		 400 aa  352  1e-95  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.206368  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3766  acetyl-CoA acetyltransferase  50.25 
 
 		 400 aa  349  4e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.475759  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6698  acetyl-CoA acetyltransferase  49.87 
 
 		 388 aa  349  6e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4193  acetyl-CoA acetyltransferases  48.46 
 
 		 393 aa  347  3e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.451307 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3596  acetyl-CoA acetyltransferase  48.1 
 
 		 390 aa  345  8e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3553  acetyl-CoA acetyltransferase  48.06 
 
 		 392 aa  344  2e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0573177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0389  acetyl-CoA acetyltransferase  48.72 
 
 		 390 aa  344  2e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.578535  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2051  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 		 394 aa  341  1e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.258769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4531  acetyl-CoA acetyltransferase  46.68 
 
 		 384 aa  340  2e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0387  acetyl-CoA acetyltransferase  48.47 
 
 		 390 aa  340  2e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3690  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 		 394 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1886  acetyl-CoA acetyltransferase  48.95 
 
 		 391 aa  339  5e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00936644 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>