More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1917 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02317  acetyl-CoA acetyltransferase  81.89 
 
 		 393 aa  658    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.342812  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1917  acetyl-CoA acetyltransferases  100 
 
 		 394 aa  805    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.520432  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1576  acetyl-CoA acetyltransferase  68.37 
 
 		 390 aa  553  1e-156  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.221288  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5443  acetyl-CoA acetyltransferase  65.25 
 
 		 400 aa  542  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2665  acetyl-CoA acetyltransferases  68.37 
 
 		 390 aa  541  1e-153  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0235  acetyl-CoA acetyltransferase  66.75 
 
 		 400 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00445966 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2063  acetyl-CoA acetyltransferases  66.07 
 
 		 393 aa  531  1e-150  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5357  acetyl-CoA acetyltransferase  63.87 
 
 		 394 aa  522  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2858  acetyl-CoA acetyltransferase  64.63 
 
 		 394 aa  522  1e-147  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6062  thiolase  63.61 
 
 		 394 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4236  acetyl-CoA acetyltransferase  63.61 
 
 		 395 aa  514  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1725  acetyl-CoA acetyltransferase  64.38 
 
 		 394 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0243329  normal  0.192279 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4960  acetyl-CoA acetyltransferases  63.25 
 
 		 400 aa  517  1.0000000000000001e-145  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.325325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3636  acetyl-CoA acetyltransferase  62.25 
 
 		 400 aa  511  1e-144  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.48902 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7072  acetyl-CoA acetyltransferase  63.36 
 
 		 395 aa  513  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.769986  normal  0.992242 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7559  Acetyl-CoA C-acyltransferase  62.85 
 
 		 394 aa  513  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0152588  normal  0.387222 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1748  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  63.61 
 
 		 395 aa  512  1e-144  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0185484 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3551  Acetyl-CoA C-acyltransferase  64.12 
 
 		 395 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0867  Acetyl-CoA C-acyltransferase  67.35 
 
 		 391 aa  509  1e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2228  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  63.1 
 
 		 395 aa  508  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138441  normal  0.114685 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0755  acetyl-CoA acetyltransferase  63.01 
 
 		 393 aa  506  9.999999999999999e-143  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0279  thiolase  62.85 
 
 		 395 aa  501  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.753614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4010  acetyl-CoA acetyltransferase  63.01 
 
 		 390 aa  498  1e-140  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0289806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0358  Acetyl-CoA C-acyltransferase  61.58 
 
 		 395 aa  498  1e-140  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4857  acetyl-CoA acetyltransferase  62.69 
 
 		 392 aa  494  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.328315  hitchhiker  0.00599656 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3098  Acetyl-CoA C-acyltransferase  62.09 
 
 		 394 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.83721  normal  0.450292 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2162  Acetyl-CoA C-acyltransferase  63.73 
 
 		 393 aa  493  9.999999999999999e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.226384  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1904  acetyl-CoA acetyltransferase  60.97 
 
 		 392 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1822  acetyl-CoA acetyltransferase  60.2 
 
 		 392 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.403448  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5205  acetyl-CoA acetyltransferase  60.46 
 
 		 392 aa  484  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.078979  normal  0.600477 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6175  acetyl-CoA acetyltransferase  60.97 
 
 		 392 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2051  acetyl-CoA acetyltransferase  64.63 
 
 		 394 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.258769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  58.4 
 
 		 401 aa  483  1e-135  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1892  acetyl-CoA acetyltransferase  59.95 
 
 		 392 aa  484  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.266832  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1927  acetyl-CoA acetyltransferase  60.46 
 
 		 392 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.114356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1572  thiolase  58.15 
 
 		 401 aa  478  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.922129  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3690  acetyl-CoA acetyltransferase  64.12 
 
 		 394 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1030  acetyl-CoA acetyltransferase  61.48 
 
 		 392 aa  475  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.919857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1445  Acetyl-CoA C-acyltransferase  57.39 
 
 		 401 aa  478  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1370  acetyl-CoA acetyltransferase  59.44 
 
 		 392 aa  477  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0227304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1445  acetyl-CoA acetyltransferase  60.46 
 
 		 392 aa  473  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0121252 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0843  acetyl-CoA acetyltransferase  57.07 
 
 		 396 aa  473  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.777986  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4193  acetyl-CoA acetyltransferases  58.78 
 
 		 393 aa  469  1.0000000000000001e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.451307 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5147  acetyl-CoA acetyltransferase  60.37 
 
 		 395 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.249101  normal  0.0151014 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2273  acetyl-CoA acetyltransferase  59.44 
 
 		 392 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0444275  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1853  acetyl-CoA acetyltransferase  58.93 
 
 		 392 aa  468  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.204279 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1486  acetyl-CoA acetyltransferase  59.44 
 
 		 392 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.250255  normal  0.0145622 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2292  acetyl-CoA acetyltransferase  59.69 
 
 		 392 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179446  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1761  acetyl-CoA acetyltransferase  59.18 
 
 		 392 aa  468  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.402553  normal  0.162883 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1926  acetyl-CoA acetyltransferase  59.69 
 
 		 392 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1436  acetyl-CoA acetyltransferase  59.69 
 
 		 392 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00245654  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2453  acetyl-CoA acetyltransferase  59.69 
 
 		 392 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1199  acetyl-CoA acetyltransferase  59.69 
 
 		 392 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2331  acetyl-CoA acetyltransferase  59.69 
 
 		 392 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3378  acetyl-CoA acetyltransferase  59.69 
 
 		 392 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.890871  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2019  acetyl-CoA acetyltransferase  61.22 
 
 		 391 aa  463  1e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263053  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1407  acetyl-CoA acetyltransferase  59.18 
 
 		 392 aa  463  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3314  acetyl-CoA acetyltransferase  61.22 
 
 		 391 aa  464  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0123072 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2144  acetyl-CoA acetyltransferase  60.2 
 
 		 392 aa  462  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.391894  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1685  acetyl-CoA acetyltransferase  61.22 
 
 		 391 aa  463  1e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.720161 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2923  acetyl-CoA acetyltransferase  58.93 
 
 		 391 aa  461  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1927  acetyl-CoA acetyltransferase  59.95 
 
 		 392 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.294769  normal  0.635162 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4752  acetyl-CoA acetyltransferase  57.22 
 
 		 395 aa  461  9.999999999999999e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.057105 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1776  acetyl-CoA acetyltransferase  58.16 
 
 		 391 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289993  normal  0.098501 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2879  acetyl-CoA acetyltransferase  60.31 
 
 		 391 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1059  acetyl-CoA acetyltransferase  56.6 
 
 		 394 aa  456  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2594  Acetyl-CoA C-acyltransferase  56.09 
 
 		 393 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0361  Acetyl-CoA C-acyltransferase  56.85 
 
 		 392 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1791  acetyl-CoA acetyltransferase  57.91 
 
 		 391 aa  448  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1843  acetyl-CoA acetyltransferase  58.16 
 
 		 391 aa  450  1e-125  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.445136 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17360  Acetyl-CoA C-acyltransferase  54.96 
 
 		 393 aa  450  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.880406  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0494  acetyl-CoA acetyltransferase  56.19 
 
 		 406 aa  442  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4001  acetyl-CoA acetyltransferase  57.4 
 
 		 393 aa  440  9.999999999999999e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3019  acetyl-CoA acetyltransferase  53.88 
 
 		 399 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104781  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3738  acetyl-CoA acetyltransferases  53.88 
 
 		 399 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2385  acetyl-CoA acetyltransferase  57.4 
 
 		 404 aa  435  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0553923  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0915  thiolase  55.33 
 
 		 393 aa  434  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000139081  normal  0.129634 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2572  acetyl-CoA acetyltransferase  58.93 
 
 		 391 aa  428  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0345  acetyl-CoA acetyltransferase  53.83 
 
 		 392 aa  424  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.591662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3766  acetyl-CoA acetyltransferase  55.14 
 
 		 400 aa  421  1e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.475759  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1394  acetyl-CoA acetyltransferase  54.14 
 
 		 398 aa  406  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3228  acetyl-CoA acetyltransferase  50.76 
 
 		 395 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.404919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1673  putative acyl-CoA thiolase  52.55 
 
 		 394 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145757  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19430  putative acyl-CoA thiolase  51.79 
 
 		 394 aa  388  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4096  Acetyl-CoA C-acyltransferase  50.51 
 
 		 394 aa  384  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.521488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0618  Acetyl-CoA C-acyltransferase  46.33 
 
 		 400 aa  332  5e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.206368  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1595  acetyl-CoA acetyltransferase  46.08 
 
 		 394 aa  331  2e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3087  acetyl-CoA acetyltransferase  44.81 
 
 		 390 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2936  acetyl-CoA acetyltransferase  45.06 
 
 		 390 aa  324  2e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2470  3-ketoacyl-CoA thiolase  44.16 
 
 		 391 aa  324  2e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.559901  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  44.05 
 
 		 392 aa  320  3e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000894654  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3596  acetyl-CoA acetyltransferase  44.3 
 
 		 390 aa  315  7e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1706  acetyl-CoA acetyltransferase  45.17 
 
 		 395 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6698  acetyl-CoA acetyltransferase  45.04 
 
 		 388 aa  309  6.999999999999999e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5155  acetyl-CoA acetyltransferase  43.8 
 
 		 390 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5143  acetyl-CoA acetyltransferase  43.54 
 
 		 390 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4531  acetyl-CoA acetyltransferase  43.53 
 
 		 384 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5149  acetyl-CoA acetyltransferase  43.54 
 
 		 390 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4876  acetyl-CoA acetyltransferase  43.54 
 
 		 390 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5117  acetyl-CoA acetyltransferase  43.54 
 
 		 390 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>