More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3314 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_1843  acetyl-CoA acetyltransferase  83.38 
 
 
391 aa  671    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.445136 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2019  acetyl-CoA acetyltransferase  94.88 
 
 
391 aa  734    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263053  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3314  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
391 aa  796    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0123072 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1791  acetyl-CoA acetyltransferase  85.17 
 
 
391 aa  663    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2385  acetyl-CoA acetyltransferase  81.07 
 
 
404 aa  638    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0553923  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2572  acetyl-CoA acetyltransferase  83.89 
 
 
391 aa  647    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2923  acetyl-CoA acetyltransferase  84.4 
 
 
391 aa  671    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1685  acetyl-CoA acetyltransferase  94.88 
 
 
391 aa  734    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.720161 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2879  acetyl-CoA acetyltransferase  91.05 
 
 
391 aa  702    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1776  acetyl-CoA acetyltransferase  76.98 
 
 
391 aa  624  1e-178  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289993  normal  0.098501 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5205  acetyl-CoA acetyltransferase  77.04 
 
 
392 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.078979  normal  0.600477 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2273  acetyl-CoA acetyltransferase  76.02 
 
 
392 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0444275  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1822  acetyl-CoA acetyltransferase  75 
 
 
392 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.403448  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6175  acetyl-CoA acetyltransferase  75.77 
 
 
392 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1904  acetyl-CoA acetyltransferase  75.77 
 
 
392 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1927  acetyl-CoA acetyltransferase  75.26 
 
 
392 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.114356  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1892  acetyl-CoA acetyltransferase  74.74 
 
 
392 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.266832  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1370  acetyl-CoA acetyltransferase  75.51 
 
 
392 aa  599  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0227304  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1927  acetyl-CoA acetyltransferase  76.53 
 
 
392 aa  593  1e-168  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.294769  normal  0.635162 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1445  acetyl-CoA acetyltransferase  75 
 
 
392 aa  589  1e-167  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0121252 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1030  acetyl-CoA acetyltransferase  75.77 
 
 
392 aa  588  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.919857  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1926  acetyl-CoA acetyltransferase  75.51 
 
 
392 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2292  acetyl-CoA acetyltransferase  75.51 
 
 
392 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179446  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1436  acetyl-CoA acetyltransferase  75.51 
 
 
392 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00245654  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2453  acetyl-CoA acetyltransferase  75.51 
 
 
392 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1199  acetyl-CoA acetyltransferase  75.51 
 
 
392 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2331  acetyl-CoA acetyltransferase  75.51 
 
 
392 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1853  acetyl-CoA acetyltransferase  74.49 
 
 
392 aa  587  1e-166  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.204279 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3378  acetyl-CoA acetyltransferase  75.51 
 
 
392 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.890871  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1486  acetyl-CoA acetyltransferase  73.72 
 
 
392 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.250255  normal  0.0145622 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2144  acetyl-CoA acetyltransferase  75.77 
 
 
392 aa  580  1e-164  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.391894  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1761  acetyl-CoA acetyltransferase  73.21 
 
 
392 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.402553  normal  0.162883 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1407  acetyl-CoA acetyltransferase  73.98 
 
 
392 aa  569  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17360  Acetyl-CoA C-acyltransferase  65.82 
 
 
393 aa  530  1e-149  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.880406  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0755  acetyl-CoA acetyltransferase  63.36 
 
 
393 aa  509  1e-143  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0915  thiolase  61.6 
 
 
393 aa  481  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000139081  normal  0.129634 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1917  acetyl-CoA acetyltransferases  61.22 
 
 
394 aa  479  1e-134  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.520432  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02317  acetyl-CoA acetyltransferase  60.56 
 
 
393 aa  471  1e-132  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.342812  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4236  acetyl-CoA acetyltransferase  59.39 
 
 
395 aa  461  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2228  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  58.63 
 
 
395 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138441  normal  0.114685 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3551  Acetyl-CoA C-acyltransferase  59.39 
 
 
395 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1576  acetyl-CoA acetyltransferase  57.91 
 
 
390 aa  455  1e-127  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.221288  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7072  acetyl-CoA acetyltransferase  59.14 
 
 
395 aa  457  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.769986  normal  0.992242 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0279  thiolase  59.39 
 
 
395 aa  449  1e-125  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.753614  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1748  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  58.38 
 
 
395 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0185484 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0867  Acetyl-CoA C-acyltransferase  60.97 
 
 
391 aa  450  1e-125  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2665  acetyl-CoA acetyltransferases  59.29 
 
 
390 aa  451  1e-125  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5443  acetyl-CoA acetyltransferase  56.39 
 
 
400 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2594  Acetyl-CoA C-acyltransferase  58.16 
 
 
393 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4010  acetyl-CoA acetyltransferase  58.67 
 
 
390 aa  446  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0289806  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4960  acetyl-CoA acetyltransferases  56.39 
 
 
400 aa  444  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.325325  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0358  Acetyl-CoA C-acyltransferase  58.38 
 
 
395 aa  444  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4752  acetyl-CoA acetyltransferase  57.64 
 
 
395 aa  442  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.057105 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0843  acetyl-CoA acetyltransferase  56.03 
 
 
396 aa  438  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.777986  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4193  acetyl-CoA acetyltransferases  57.18 
 
 
393 aa  438  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.451307 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3636  acetyl-CoA acetyltransferase  56.64 
 
 
400 aa  436  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.48902 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4857  acetyl-CoA acetyltransferase  56.89 
 
 
392 aa  437  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.328315  hitchhiker  0.00599656 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1059  acetyl-CoA acetyltransferase  54.59 
 
 
394 aa  436  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4001  acetyl-CoA acetyltransferase  59.29 
 
 
393 aa  435  1e-121  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0345  acetyl-CoA acetyltransferase  56.38 
 
 
392 aa  437  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.591662  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1445  Acetyl-CoA C-acyltransferase  55.64 
 
 
401 aa  433  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279088  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5147  acetyl-CoA acetyltransferase  58.27 
 
 
395 aa  433  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.249101  normal  0.0151014 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0235  acetyl-CoA acetyltransferase  56.39 
 
 
400 aa  434  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00445966 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0361  Acetyl-CoA C-acyltransferase  54.96 
 
 
392 aa  431  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5357  acetyl-CoA acetyltransferase  57.25 
 
 
394 aa  426  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3738  acetyl-CoA acetyltransferases  55.36 
 
 
399 aa  424  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3019  acetyl-CoA acetyltransferase  55.36 
 
 
399 aa  424  1e-117  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104781  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6062  thiolase  54.96 
 
 
394 aa  420  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2162  Acetyl-CoA C-acyltransferase  56.74 
 
 
393 aa  419  1e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.226384  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2063  acetyl-CoA acetyltransferases  55.22 
 
 
393 aa  420  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0494  acetyl-CoA acetyltransferase  56.36 
 
 
406 aa  417  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7559  Acetyl-CoA C-acyltransferase  54.2 
 
 
394 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0152588  normal  0.387222 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2858  acetyl-CoA acetyltransferase  54.45 
 
 
394 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1572  thiolase  52.62 
 
 
401 aa  410  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.922129  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3098  Acetyl-CoA C-acyltransferase  54.2 
 
 
394 aa  408  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.83721  normal  0.450292 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  53.13 
 
 
401 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1394  acetyl-CoA acetyltransferase  54.66 
 
 
398 aa  407  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1725  acetyl-CoA acetyltransferase  53.9 
 
 
394 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0243329  normal  0.192279 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3228  acetyl-CoA acetyltransferase  51.65 
 
 
395 aa  387  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.404919  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2051  acetyl-CoA acetyltransferase  53.05 
 
 
394 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.258769  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1673  putative acyl-CoA thiolase  50.63 
 
 
394 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145757  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3690  acetyl-CoA acetyltransferase  53.05 
 
 
394 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4096  Acetyl-CoA C-acyltransferase  50.51 
 
 
394 aa  367  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.521488  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19430  putative acyl-CoA thiolase  50.13 
 
 
394 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0618  Acetyl-CoA C-acyltransferase  51.02 
 
 
400 aa  358  7e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.206368  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3087  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 
390 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3766  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 
400 aa  356  2.9999999999999997e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.475759  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1595  acetyl-CoA acetyltransferase  51.15 
 
 
394 aa  352  7e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2936  acetyl-CoA acetyltransferase  49.36 
 
 
390 aa  350  3e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2470  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.97 
 
 
391 aa  346  4e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.559901  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4531  acetyl-CoA acetyltransferase  48.49 
 
 
384 aa  342  5.999999999999999e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  47.07 
 
 
392 aa  342  7e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000894654  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 
392 aa  337  2.9999999999999997e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.867472  hitchhiker  0.0000022311 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0387  acetyl-CoA acetyltransferase  46.55 
 
 
390 aa  329  4e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3596  acetyl-CoA acetyltransferase  45.55 
 
 
390 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0389  acetyl-CoA acetyltransferase  46.29 
 
 
390 aa  326  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.578535  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0359  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.04 
 
 
390 aa  325  8.000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2266  acetyl-CoA acetyltransferase  47.45 
 
 
390 aa  322  5e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00024775 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5143  acetyl-CoA acetyltransferase  45.29 
 
 
390 aa  322  7e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1886  acetyl-CoA acetyltransferase  47.66 
 
 
391 aa  322  8e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00936644 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>