More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2051 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1725  acetyl-CoA acetyltransferase  80.96 
 
 		 394 aa  638    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0243329  normal  0.192279 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2051  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 		 394 aa  788    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.258769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3690  acetyl-CoA acetyltransferase  99.24 
 
 		 394 aa  783    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5357  acetyl-CoA acetyltransferase  68.45 
 
 		 394 aa  548  1e-155  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7559  Acetyl-CoA C-acyltransferase  66.92 
 
 		 394 aa  528  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0152588  normal  0.387222 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2858  acetyl-CoA acetyltransferase  62.34 
 
 		 394 aa  518  1e-146  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3098  Acetyl-CoA C-acyltransferase  66.41 
 
 		 394 aa  518  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.83721  normal  0.450292 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1917  acetyl-CoA acetyltransferases  64.63 
 
 		 394 aa  512  1e-144  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.520432  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2665  acetyl-CoA acetyltransferases  66.24 
 
 		 390 aa  506  9.999999999999999e-143  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6062  thiolase  64.63 
 
 		 394 aa  503  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02317  acetyl-CoA acetyltransferase  62.44 
 
 		 393 aa  493  9.999999999999999e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.342812  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5443  acetyl-CoA acetyltransferase  64 
 
 		 400 aa  486  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1576  acetyl-CoA acetyltransferase  63.8 
 
 		 390 aa  487  1e-136  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.221288  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3636  acetyl-CoA acetyltransferase  63.5 
 
 		 400 aa  483  1e-135  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.48902 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7072  acetyl-CoA acetyltransferase  61.01 
 
 		 395 aa  480  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.769986  normal  0.992242 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4960  acetyl-CoA acetyltransferases  62.5 
 
 		 400 aa  479  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.325325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0235  acetyl-CoA acetyltransferase  64.34 
 
 		 400 aa  474  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00445966 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3551  Acetyl-CoA C-acyltransferase  60.25 
 
 		 395 aa  472  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1748  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  60 
 
 		 395 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0185484 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4857  acetyl-CoA acetyltransferase  62.69 
 
 		 392 aa  470  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.328315  hitchhiker  0.00599656 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4010  acetyl-CoA acetyltransferase  62.69 
 
 		 390 aa  466  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0289806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2063  acetyl-CoA acetyltransferases  60.91 
 
 		 393 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4236  acetyl-CoA acetyltransferase  59.75 
 
 		 395 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0279  thiolase  60.61 
 
 		 395 aa  463  1e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.753614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2228  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  58.48 
 
 		 395 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138441  normal  0.114685 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  57.5 
 
 		 401 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1572  thiolase  59.1 
 
 		 401 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.922129  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0358  Acetyl-CoA C-acyltransferase  59.85 
 
 		 395 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0867  Acetyl-CoA C-acyltransferase  63.71 
 
 		 391 aa  449  1e-125  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0755  acetyl-CoA acetyltransferase  59.7 
 
 		 393 aa  448  1e-125  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1445  Acetyl-CoA C-acyltransferase  57.75 
 
 		 401 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1059  acetyl-CoA acetyltransferase  59.15 
 
 		 394 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5147  acetyl-CoA acetyltransferase  59.49 
 
 		 395 aa  432  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.249101  normal  0.0151014 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2162  Acetyl-CoA C-acyltransferase  58.73 
 
 		 393 aa  429  1e-119  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.226384  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1822  acetyl-CoA acetyltransferase  55.7 
 
 		 392 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.403448  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1370  acetyl-CoA acetyltransferase  56.09 
 
 		 392 aa  426  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0227304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1892  acetyl-CoA acetyltransferase  55.7 
 
 		 392 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.266832  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5205  acetyl-CoA acetyltransferase  55.44 
 
 		 392 aa  422  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.078979  normal  0.600477 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1927  acetyl-CoA acetyltransferase  55.44 
 
 		 392 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.114356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6175  acetyl-CoA acetyltransferase  55.95 
 
 		 392 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1904  acetyl-CoA acetyltransferase  55.95 
 
 		 392 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4752  acetyl-CoA acetyltransferase  56.46 
 
 		 395 aa  419  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.057105 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3738  acetyl-CoA acetyltransferases  54.75 
 
 		 399 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3019  acetyl-CoA acetyltransferase  54.75 
 
 		 399 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104781  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0843  acetyl-CoA acetyltransferase  54.55 
 
 		 396 aa  414  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.777986  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17360  Acetyl-CoA C-acyltransferase  54.18 
 
 		 393 aa  409  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.880406  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1761  acetyl-CoA acetyltransferase  55.7 
 
 		 392 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.402553  normal  0.162883 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1486  acetyl-CoA acetyltransferase  55.44 
 
 		 392 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.250255  normal  0.0145622 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3766  acetyl-CoA acetyltransferase  55.28 
 
 		 400 aa  405  1.0000000000000001e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.475759  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2273  acetyl-CoA acetyltransferase  54.27 
 
 		 392 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0444275  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0494  acetyl-CoA acetyltransferase  55.77 
 
 		 406 aa  406  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1445  acetyl-CoA acetyltransferase  54.68 
 
 		 392 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0121252 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4193  acetyl-CoA acetyltransferases  54.94 
 
 		 393 aa  404  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.451307 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1776  acetyl-CoA acetyltransferase  55.56 
 
 		 391 aa  403  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289993  normal  0.098501 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1436  acetyl-CoA acetyltransferase  55.44 
 
 		 392 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00245654  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2453  acetyl-CoA acetyltransferase  55.44 
 
 		 392 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2331  acetyl-CoA acetyltransferase  55.44 
 
 		 392 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2292  acetyl-CoA acetyltransferase  55.44 
 
 		 392 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179446  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2594  Acetyl-CoA C-acyltransferase  53.81 
 
 		 393 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1926  acetyl-CoA acetyltransferase  55.44 
 
 		 392 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1030  acetyl-CoA acetyltransferase  55.95 
 
 		 392 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.919857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1853  acetyl-CoA acetyltransferase  53.92 
 
 		 392 aa  399  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.204279 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3378  acetyl-CoA acetyltransferase  55.44 
 
 		 392 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.890871  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1199  acetyl-CoA acetyltransferase  55.44 
 
 		 392 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0345  acetyl-CoA acetyltransferase  53.55 
 
 		 392 aa  395  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.591662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1407  acetyl-CoA acetyltransferase  55.33 
 
 		 392 aa  395  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0361  Acetyl-CoA C-acyltransferase  53.42 
 
 		 392 aa  395  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2144  acetyl-CoA acetyltransferase  55.44 
 
 		 392 aa  392  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.391894  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1927  acetyl-CoA acetyltransferase  53.92 
 
 		 392 aa  390  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.294769  normal  0.635162 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2019  acetyl-CoA acetyltransferase  53.05 
 
 		 391 aa  386  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263053  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4001  acetyl-CoA acetyltransferase  56.35 
 
 		 393 aa  386  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1685  acetyl-CoA acetyltransferase  53.05 
 
 		 391 aa  386  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.720161 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3314  acetyl-CoA acetyltransferase  53.05 
 
 		 391 aa  385  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0123072 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1791  acetyl-CoA acetyltransferase  53.3 
 
 		 391 aa  383  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2923  acetyl-CoA acetyltransferase  50.51 
 
 		 391 aa  384  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1843  acetyl-CoA acetyltransferase  51.65 
 
 		 391 aa  384  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.445136 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1394  acetyl-CoA acetyltransferase  54.14 
 
 		 398 aa  382  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2879  acetyl-CoA acetyltransferase  52.03 
 
 		 391 aa  375  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0915  thiolase  51.53 
 
 		 393 aa  376  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000139081  normal  0.129634 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3228  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 		 395 aa  373  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.404919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2385  acetyl-CoA acetyltransferase  51.78 
 
 		 404 aa  365  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0553923  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1673  putative acyl-CoA thiolase  52.41 
 
 		 394 aa  364  1e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145757  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19430  putative acyl-CoA thiolase  51.15 
 
 		 394 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4096  Acetyl-CoA C-acyltransferase  49.62 
 
 		 394 aa  352  8.999999999999999e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.521488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2572  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 		 391 aa  350  2e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3087  acetyl-CoA acetyltransferase  46.25 
 
 		 390 aa  325  7e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  44.95 
 
 		 392 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000894654  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2936  acetyl-CoA acetyltransferase  45.25 
 
 		 390 aa  319  5e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1595  acetyl-CoA acetyltransferase  45.32 
 
 		 394 aa  319  6e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0359  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.95 
 
 		 390 aa  318  1e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0618  Acetyl-CoA C-acyltransferase  45.71 
 
 		 400 aa  315  9.999999999999999e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.206368  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0389  acetyl-CoA acetyltransferase  46.19 
 
 		 390 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.578535  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0387  acetyl-CoA acetyltransferase  46.19 
 
 		 390 aa  312  7.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5143  acetyl-CoA acetyltransferase  44.3 
 
 		 390 aa  310  2e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5155  acetyl-CoA acetyltransferase  44.56 
 
 		 390 aa  311  2e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2125  acetyl-CoA acetyltransferase  47.07 
 
 		 396 aa  310  2e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.533302 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3596  acetyl-CoA acetyltransferase  43.04 
 
 		 390 aa  309  5e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  48.25 
 
 		 392 aa  309  5e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.867472  hitchhiker  0.0000022311 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4531  acetyl-CoA acetyltransferase  45.11 
 
 		 384 aa  306  5.0000000000000004e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5149  acetyl-CoA acetyltransferase  44.05 
 
 		 390 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>