More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_19430 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_3228  acetyl-CoA acetyltransferase  85.53 
 
 
395 aa  705    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.404919  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4096  Acetyl-CoA C-acyltransferase  85.28 
 
 
394 aa  684    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.521488  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1673  putative acyl-CoA thiolase  96.7 
 
 
394 aa  763    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145757  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19430  putative acyl-CoA thiolase  100 
 
 
394 aa  804    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4752  acetyl-CoA acetyltransferase  59.29 
 
 
395 aa  464  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.057105 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0755  acetyl-CoA acetyltransferase  56.85 
 
 
393 aa  442  1e-123  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1059  acetyl-CoA acetyltransferase  55.75 
 
 
394 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0494  acetyl-CoA acetyltransferase  56.72 
 
 
406 aa  432  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0361  Acetyl-CoA C-acyltransferase  54.48 
 
 
392 aa  427  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1927  acetyl-CoA acetyltransferase  54.73 
 
 
392 aa  421  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.114356  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1822  acetyl-CoA acetyltransferase  54.96 
 
 
392 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.403448  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6175  acetyl-CoA acetyltransferase  54.99 
 
 
392 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1892  acetyl-CoA acetyltransferase  54.71 
 
 
392 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.266832  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1904  acetyl-CoA acetyltransferase  54.99 
 
 
392 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5205  acetyl-CoA acetyltransferase  54.73 
 
 
392 aa  420  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.078979  normal  0.600477 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1370  acetyl-CoA acetyltransferase  53.94 
 
 
392 aa  419  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0227304  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0235  acetyl-CoA acetyltransferase  54.89 
 
 
400 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00445966 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3551  Acetyl-CoA C-acyltransferase  53.16 
 
 
395 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2331  acetyl-CoA acetyltransferase  53.94 
 
 
392 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1436  acetyl-CoA acetyltransferase  53.94 
 
 
392 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00245654  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2453  acetyl-CoA acetyltransferase  53.94 
 
 
392 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2228  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  53.16 
 
 
395 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138441  normal  0.114685 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1926  acetyl-CoA acetyltransferase  53.94 
 
 
392 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3378  acetyl-CoA acetyltransferase  53.94 
 
 
392 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.890871  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1199  acetyl-CoA acetyltransferase  53.94 
 
 
392 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2292  acetyl-CoA acetyltransferase  53.94 
 
 
392 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179446  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2144  acetyl-CoA acetyltransferase  54.71 
 
 
392 aa  409  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.391894  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2273  acetyl-CoA acetyltransferase  52.93 
 
 
392 aa  410  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0444275  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0358  Acetyl-CoA C-acyltransferase  53.42 
 
 
395 aa  410  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1394  acetyl-CoA acetyltransferase  54.29 
 
 
398 aa  406  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3636  acetyl-CoA acetyltransferase  54.52 
 
 
400 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.48902 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3019  acetyl-CoA acetyltransferase  53.27 
 
 
399 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104781  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3738  acetyl-CoA acetyltransferases  53.27 
 
 
399 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1486  acetyl-CoA acetyltransferase  52.43 
 
 
392 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.250255  normal  0.0145622 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1572  thiolase  53.12 
 
 
401 aa  404  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.922129  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1748  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  51.65 
 
 
395 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0185484 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2594  Acetyl-CoA C-acyltransferase  52.69 
 
 
393 aa  405  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4236  acetyl-CoA acetyltransferase  51.39 
 
 
395 aa  401  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1853  acetyl-CoA acetyltransferase  51.41 
 
 
392 aa  402  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.204279 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1445  acetyl-CoA acetyltransferase  51.66 
 
 
392 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0121252 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5443  acetyl-CoA acetyltransferase  52.38 
 
 
400 aa  404  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1761  acetyl-CoA acetyltransferase  51.92 
 
 
392 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.402553  normal  0.162883 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1030  acetyl-CoA acetyltransferase  53.44 
 
 
392 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.919857  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0843  acetyl-CoA acetyltransferase  51.78 
 
 
396 aa  400  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.777986  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0279  thiolase  51.65 
 
 
395 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.753614  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1927  acetyl-CoA acetyltransferase  53.44 
 
 
392 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.294769  normal  0.635162 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02317  acetyl-CoA acetyltransferase  51.27 
 
 
393 aa  401  9.999999999999999e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.342812  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1917  acetyl-CoA acetyltransferases  51.79 
 
 
394 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.520432  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4960  acetyl-CoA acetyltransferases  51.13 
 
 
400 aa  399  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.325325  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2858  acetyl-CoA acetyltransferase  51.13 
 
 
394 aa  395  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7072  acetyl-CoA acetyltransferase  50.63 
 
 
395 aa  395  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.769986  normal  0.992242 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1407  acetyl-CoA acetyltransferase  52.17 
 
 
392 aa  397  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5357  acetyl-CoA acetyltransferase  53.16 
 
 
394 aa  394  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1576  acetyl-CoA acetyltransferase  52.81 
 
 
390 aa  394  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.221288  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17360  Acetyl-CoA C-acyltransferase  50.13 
 
 
393 aa  392  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.880406  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  50.62 
 
 
401 aa  390  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4001  acetyl-CoA acetyltransferase  54.82 
 
 
393 aa  388  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0915  thiolase  51.54 
 
 
393 aa  389  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000139081  normal  0.129634 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6062  thiolase  51.01 
 
 
394 aa  387  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2063  acetyl-CoA acetyltransferases  51.27 
 
 
393 aa  384  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2665  acetyl-CoA acetyltransferases  52.54 
 
 
390 aa  385  1e-105  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7559  Acetyl-CoA C-acyltransferase  50.38 
 
 
394 aa  380  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0152588  normal  0.387222 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1445  Acetyl-CoA C-acyltransferase  51.26 
 
 
401 aa  381  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279088  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3098  Acetyl-CoA C-acyltransferase  52.54 
 
 
394 aa  377  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.83721  normal  0.450292 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1791  acetyl-CoA acetyltransferase  51.65 
 
 
391 aa  375  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1776  acetyl-CoA acetyltransferase  50.9 
 
 
391 aa  375  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289993  normal  0.098501 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2162  Acetyl-CoA C-acyltransferase  52.69 
 
 
393 aa  372  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.226384  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2936  acetyl-CoA acetyltransferase  50.25 
 
 
390 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4857  acetyl-CoA acetyltransferase  50.76 
 
 
392 aa  373  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.328315  hitchhiker  0.00599656 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1843  acetyl-CoA acetyltransferase  49.87 
 
 
391 aa  373  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.445136 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5147  acetyl-CoA acetyltransferase  50.39 
 
 
395 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.249101  normal  0.0151014 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0345  acetyl-CoA acetyltransferase  51.4 
 
 
392 aa  371  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.591662  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  48.73 
 
 
392 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000894654  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2923  acetyl-CoA acetyltransferase  48.35 
 
 
391 aa  368  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3087  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 
390 aa  368  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3314  acetyl-CoA acetyltransferase  49.87 
 
 
391 aa  365  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0123072 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2019  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 
391 aa  367  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263053  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1685  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 
391 aa  367  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.720161 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2879  acetyl-CoA acetyltransferase  50.89 
 
 
391 aa  367  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1725  acetyl-CoA acetyltransferase  48.87 
 
 
394 aa  364  1e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0243329  normal  0.192279 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1595  acetyl-CoA acetyltransferase  49.87 
 
 
394 aa  363  3e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2125  acetyl-CoA acetyltransferase  51.15 
 
 
396 aa  361  9e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.533302 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  51.66 
 
 
392 aa  361  1e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.867472  hitchhiker  0.0000022311 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0867  Acetyl-CoA C-acyltransferase  52.66 
 
 
391 aa  361  1e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4010  acetyl-CoA acetyltransferase  52.28 
 
 
390 aa  360  3e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0289806  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2470  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.7 
 
 
391 aa  359  4e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.559901  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2385  acetyl-CoA acetyltransferase  48.56 
 
 
404 aa  359  5e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0553923  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3766  acetyl-CoA acetyltransferase  51.76 
 
 
400 aa  358  9.999999999999999e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.475759  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3596  acetyl-CoA acetyltransferase  48.74 
 
 
390 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4193  acetyl-CoA acetyltransferases  50.51 
 
 
393 aa  352  4e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.451307 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5143  acetyl-CoA acetyltransferase  48.23 
 
 
390 aa  351  1e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5155  acetyl-CoA acetyltransferase  48.48 
 
 
390 aa  351  1e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2572  acetyl-CoA acetyltransferase  49.08 
 
 
391 aa  350  2e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4834  acetyl-CoA acetyltransferase  48.23 
 
 
390 aa  349  5e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4876  acetyl-CoA acetyltransferase  48.23 
 
 
390 aa  348  1e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4718  acetyl-CoA acetyltransferase  48.23 
 
 
390 aa  348  1e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5117  acetyl-CoA acetyltransferase  48.23 
 
 
390 aa  348  1e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5248  acetyl-CoA acetyltransferase  48.23 
 
 
390 aa  348  1e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5149  acetyl-CoA acetyltransferase  48.23 
 
 
390 aa  348  1e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0095  acetyl-CoA acetyltransferase  47.98 
 
 
390 aa  347  2e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>