More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0279 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4236  acetyl-CoA acetyltransferase  84.05 
 
 		 395 aa  677    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0279  thiolase  100 
 
 		 395 aa  793    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.753614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1748  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  83.29 
 
 		 395 aa  671    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0185484 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2228  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  84.05 
 
 		 395 aa  683    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138441  normal  0.114685 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3551  Acetyl-CoA C-acyltransferase  84.81 
 
 		 395 aa  684    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0358  Acetyl-CoA C-acyltransferase  90.63 
 
 		 395 aa  705    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7072  acetyl-CoA acetyltransferase  84.56 
 
 		 395 aa  685    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.769986  normal  0.992242 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5147  acetyl-CoA acetyltransferase  79 
 
 		 395 aa  619  1e-176  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.249101  normal  0.0151014 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5443  acetyl-CoA acetyltransferase  67.42 
 
 		 400 aa  543  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0755  acetyl-CoA acetyltransferase  67.01 
 
 		 393 aa  536  1e-151  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0235  acetyl-CoA acetyltransferase  67.92 
 
 		 400 aa  533  1e-150  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00445966 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02317  acetyl-CoA acetyltransferase  64.21 
 
 		 393 aa  512  1e-144  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.342812  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1059  acetyl-CoA acetyltransferase  66.75 
 
 		 394 aa  513  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1917  acetyl-CoA acetyltransferases  62.85 
 
 		 394 aa  510  1e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.520432  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3636  acetyl-CoA acetyltransferase  63.91 
 
 		 400 aa  509  1e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.48902 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4960  acetyl-CoA acetyltransferases  63.41 
 
 		 400 aa  504  1e-141  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.325325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5357  acetyl-CoA acetyltransferase  63.96 
 
 		 394 aa  500  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7559  Acetyl-CoA C-acyltransferase  61.93 
 
 		 394 aa  501  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0152588  normal  0.387222 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1576  acetyl-CoA acetyltransferase  65.23 
 
 		 390 aa  500  1e-140  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.221288  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1725  acetyl-CoA acetyltransferase  62.78 
 
 		 394 aa  496  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0243329  normal  0.192279 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6062  thiolase  63.45 
 
 		 394 aa  496  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4752  acetyl-CoA acetyltransferase  61.77 
 
 		 395 aa  493  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.057105 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5205  acetyl-CoA acetyltransferase  62.94 
 
 		 392 aa  488  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.078979  normal  0.600477 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1370  acetyl-CoA acetyltransferase  62.94 
 
 		 392 aa  489  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0227304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0361  Acetyl-CoA C-acyltransferase  60.91 
 
 		 392 aa  488  1e-137  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2665  acetyl-CoA acetyltransferases  63.45 
 
 		 390 aa  489  1e-137  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1822  acetyl-CoA acetyltransferase  62.69 
 
 		 392 aa  485  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.403448  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6175  acetyl-CoA acetyltransferase  62.94 
 
 		 392 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1892  acetyl-CoA acetyltransferase  62.69 
 
 		 392 aa  485  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.266832  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1904  acetyl-CoA acetyltransferase  62.94 
 
 		 392 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4857  acetyl-CoA acetyltransferase  61.83 
 
 		 392 aa  483  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.328315  hitchhiker  0.00599656 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2063  acetyl-CoA acetyltransferases  59.64 
 
 		 393 aa  483  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1927  acetyl-CoA acetyltransferase  62.94 
 
 		 392 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.114356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3098  Acetyl-CoA C-acyltransferase  61.68 
 
 		 394 aa  481  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.83721  normal  0.450292 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2858  acetyl-CoA acetyltransferase  59.75 
 
 		 394 aa  476  1e-133  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1486  acetyl-CoA acetyltransferase  61.17 
 
 		 392 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.250255  normal  0.0145622 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1761  acetyl-CoA acetyltransferase  61.68 
 
 		 392 aa  467  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.402553  normal  0.162883 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1445  acetyl-CoA acetyltransferase  61.17 
 
 		 392 aa  467  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0121252 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1572  thiolase  60.3 
 
 		 401 aa  467  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.922129  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0843  acetyl-CoA acetyltransferase  58.59 
 
 		 396 aa  465  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.777986  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2594  Acetyl-CoA C-acyltransferase  59.54 
 
 		 393 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1030  acetyl-CoA acetyltransferase  62.44 
 
 		 392 aa  462  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.919857  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1436  acetyl-CoA acetyltransferase  62.44 
 
 		 392 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00245654  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2292  acetyl-CoA acetyltransferase  62.44 
 
 		 392 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179446  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2331  acetyl-CoA acetyltransferase  62.44 
 
 		 392 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4010  acetyl-CoA acetyltransferase  62.18 
 
 		 390 aa  462  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0289806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2453  acetyl-CoA acetyltransferase  62.44 
 
 		 392 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3378  acetyl-CoA acetyltransferase  62.44 
 
 		 392 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.890871  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1445  Acetyl-CoA C-acyltransferase  59.4 
 
 		 401 aa  462  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3019  acetyl-CoA acetyltransferase  59.65 
 
 		 399 aa  464  1e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104781  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3738  acetyl-CoA acetyltransferases  59.65 
 
 		 399 aa  464  1e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0867  Acetyl-CoA C-acyltransferase  61.17 
 
 		 391 aa  464  1e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1926  acetyl-CoA acetyltransferase  62.44 
 
 		 392 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1199  acetyl-CoA acetyltransferase  62.44 
 
 		 392 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1407  acetyl-CoA acetyltransferase  61.42 
 
 		 392 aa  458  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2144  acetyl-CoA acetyltransferase  62.44 
 
 		 392 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.391894  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2273  acetyl-CoA acetyltransferase  60.91 
 
 		 392 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0444275  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1853  acetyl-CoA acetyltransferase  59.9 
 
 		 392 aa  461  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.204279 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2923  acetyl-CoA acetyltransferase  60.15 
 
 		 391 aa  459  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4001  acetyl-CoA acetyltransferase  63.45 
 
 		 393 aa  457  1e-127  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1776  acetyl-CoA acetyltransferase  60.41 
 
 		 391 aa  455  1e-127  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289993  normal  0.098501 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17360  Acetyl-CoA C-acyltransferase  59.14 
 
 		 393 aa  457  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.880406  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0494  acetyl-CoA acetyltransferase  59.85 
 
 		 406 aa  456  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1791  acetyl-CoA acetyltransferase  60.91 
 
 		 391 aa  454  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2879  acetyl-CoA acetyltransferase  60.91 
 
 		 391 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2051  acetyl-CoA acetyltransferase  60.61 
 
 		 394 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.258769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  54.61 
 
 		 401 aa  451  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2162  Acetyl-CoA C-acyltransferase  59.64 
 
 		 393 aa  448  1e-125  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.226384  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1927  acetyl-CoA acetyltransferase  60.66 
 
 		 392 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.294769  normal  0.635162 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3690  acetyl-CoA acetyltransferase  60.61 
 
 		 394 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0345  acetyl-CoA acetyltransferase  59.39 
 
 		 392 aa  444  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.591662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1843  acetyl-CoA acetyltransferase  57.87 
 
 		 391 aa  441  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.445136 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2385  acetyl-CoA acetyltransferase  60.91 
 
 		 404 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0553923  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3314  acetyl-CoA acetyltransferase  59.39 
 
 		 391 aa  441  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0123072 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2019  acetyl-CoA acetyltransferase  59.39 
 
 		 391 aa  437  1e-121  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263053  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1394  acetyl-CoA acetyltransferase  57.79 
 
 		 398 aa  436  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1685  acetyl-CoA acetyltransferase  59.39 
 
 		 391 aa  437  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.720161 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4193  acetyl-CoA acetyltransferases  59.95 
 
 		 393 aa  436  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.451307 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2572  acetyl-CoA acetyltransferase  58.38 
 
 		 391 aa  420  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3766  acetyl-CoA acetyltransferase  55.89 
 
 		 400 aa  409  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.475759  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0915  thiolase  56.01 
 
 		 393 aa  410  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000139081  normal  0.129634 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1673  putative acyl-CoA thiolase  52.91 
 
 		 394 aa  398  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145757  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3228  acetyl-CoA acetyltransferase  51.28 
 
 		 395 aa  395  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.404919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19430  putative acyl-CoA thiolase  51.65 
 
 		 394 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4096  Acetyl-CoA C-acyltransferase  51.14 
 
 		 394 aa  387  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.521488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1595  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 		 394 aa  353  2e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2470  3-ketoacyl-CoA thiolase  48.61 
 
 		 391 aa  344  1e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.559901  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  46.21 
 
 		 392 aa  344  2e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000894654  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2936  acetyl-CoA acetyltransferase  47.98 
 
 		 390 aa  332  1e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2125  acetyl-CoA acetyltransferase  48.99 
 
 		 396 aa  329  5.0000000000000004e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.533302 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2969  acetyl-CoA acetyltransferase  50.89 
 
 		 391 aa  328  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3087  acetyl-CoA acetyltransferase  48.36 
 
 		 390 aa  327  3e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1886  acetyl-CoA acetyltransferase  50.65 
 
 		 391 aa  325  1e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00936644 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2056  3-ketoacyl-CoA thiolase  49.75 
 
 		 392 aa  321  9.999999999999999e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.150034  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0618  Acetyl-CoA C-acyltransferase  45.69 
 
 		 400 aa  320  3e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.206368  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 		 392 aa  315  9e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.867472  hitchhiker  0.0000022311 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4393  acetyl-CoA acetyltransferase  47.73 
 
 		 392 aa  315  9.999999999999999e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4531  acetyl-CoA acetyltransferase  45.82 
 
 		 384 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3596  acetyl-CoA acetyltransferase  44.7 
 
 		 390 aa  310  4e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0389  acetyl-CoA acetyltransferase  46.17 
 
 		 390 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.578535  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>