More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5147 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_4236  acetyl-CoA acetyltransferase  81.77 
 
 
395 aa  670    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1748  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  80.76 
 
 
395 aa  660    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0185484 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2228  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  82.03 
 
 
395 aa  676    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138441  normal  0.114685 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5147  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
395 aa  798    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.249101  normal  0.0151014 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3551  Acetyl-CoA C-acyltransferase  81.01 
 
 
395 aa  670    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7072  acetyl-CoA acetyltransferase  78.99 
 
 
395 aa  654    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.769986  normal  0.992242 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0358  Acetyl-CoA C-acyltransferase  78.99 
 
 
395 aa  632  1e-180  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0279  thiolase  78.73 
 
 
395 aa  623  1e-177  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.753614  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5443  acetyl-CoA acetyltransferase  64.41 
 
 
400 aa  513  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0755  acetyl-CoA acetyltransferase  64.97 
 
 
393 aa  509  1e-143  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0235  acetyl-CoA acetyltransferase  64.91 
 
 
400 aa  503  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00445966 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2665  acetyl-CoA acetyltransferases  64.21 
 
 
390 aa  496  1e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02317  acetyl-CoA acetyltransferase  62.69 
 
 
393 aa  495  1e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.342812  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1822  acetyl-CoA acetyltransferase  63.2 
 
 
392 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.403448  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5205  acetyl-CoA acetyltransferase  63.45 
 
 
392 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.078979  normal  0.600477 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1059  acetyl-CoA acetyltransferase  63.87 
 
 
394 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1892  acetyl-CoA acetyltransferase  63.2 
 
 
392 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.266832  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1370  acetyl-CoA acetyltransferase  62.69 
 
 
392 aa  488  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0227304  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1927  acetyl-CoA acetyltransferase  63.2 
 
 
392 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.114356  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6175  acetyl-CoA acetyltransferase  62.94 
 
 
392 aa  488  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1917  acetyl-CoA acetyltransferases  61.07 
 
 
394 aa  489  1e-137  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.520432  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1904  acetyl-CoA acetyltransferase  62.94 
 
 
392 aa  488  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3636  acetyl-CoA acetyltransferase  62.41 
 
 
400 aa  486  1e-136  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.48902 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6062  thiolase  62.44 
 
 
394 aa  485  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4857  acetyl-CoA acetyltransferase  61.32 
 
 
392 aa  485  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.328315  hitchhiker  0.00599656 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2858  acetyl-CoA acetyltransferase  59.64 
 
 
394 aa  483  1e-135  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5357  acetyl-CoA acetyltransferase  62.69 
 
 
394 aa  483  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1576  acetyl-CoA acetyltransferase  61.93 
 
 
390 aa  481  1e-135  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.221288  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4960  acetyl-CoA acetyltransferases  59.9 
 
 
400 aa  483  1e-135  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.325325  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0361  Acetyl-CoA C-acyltransferase  60.81 
 
 
392 aa  484  1e-135  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4752  acetyl-CoA acetyltransferase  61.01 
 
 
395 aa  480  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.057105 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7559  Acetyl-CoA C-acyltransferase  61.68 
 
 
394 aa  479  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0152588  normal  0.387222 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2063  acetyl-CoA acetyltransferases  59.14 
 
 
393 aa  479  1e-134  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1486  acetyl-CoA acetyltransferase  60.91 
 
 
392 aa  476  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.250255  normal  0.0145622 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1853  acetyl-CoA acetyltransferase  60.15 
 
 
392 aa  475  1e-133  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.204279 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1445  acetyl-CoA acetyltransferase  60.15 
 
 
392 aa  471  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0121252 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1761  acetyl-CoA acetyltransferase  60.91 
 
 
392 aa  473  1e-132  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.402553  normal  0.162883 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1725  acetyl-CoA acetyltransferase  61.01 
 
 
394 aa  474  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0243329  normal  0.192279 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1436  acetyl-CoA acetyltransferase  62.69 
 
 
392 aa  471  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00245654  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1199  acetyl-CoA acetyltransferase  62.69 
 
 
392 aa  471  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2331  acetyl-CoA acetyltransferase  62.69 
 
 
392 aa  471  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2453  acetyl-CoA acetyltransferase  62.69 
 
 
392 aa  471  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3378  acetyl-CoA acetyltransferase  62.69 
 
 
392 aa  471  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.890871  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1926  acetyl-CoA acetyltransferase  62.69 
 
 
392 aa  471  1e-132  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2292  acetyl-CoA acetyltransferase  62.69 
 
 
392 aa  471  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179446  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0843  acetyl-CoA acetyltransferase  60 
 
 
396 aa  469  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.777986  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2273  acetyl-CoA acetyltransferase  60.91 
 
 
392 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0444275  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2879  acetyl-CoA acetyltransferase  62.09 
 
 
391 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1407  acetyl-CoA acetyltransferase  61.68 
 
 
392 aa  465  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2144  acetyl-CoA acetyltransferase  62.94 
 
 
392 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.391894  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1030  acetyl-CoA acetyltransferase  62.18 
 
 
392 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.919857  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1776  acetyl-CoA acetyltransferase  60.15 
 
 
391 aa  462  1e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289993  normal  0.098501 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3098  Acetyl-CoA C-acyltransferase  60.66 
 
 
394 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.83721  normal  0.450292 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2594  Acetyl-CoA C-acyltransferase  58.27 
 
 
393 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1927  acetyl-CoA acetyltransferase  60.91 
 
 
392 aa  457  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.294769  normal  0.635162 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3019  acetyl-CoA acetyltransferase  57.79 
 
 
399 aa  457  1e-127  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104781  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1843  acetyl-CoA acetyltransferase  59.14 
 
 
391 aa  456  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.445136 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2923  acetyl-CoA acetyltransferase  58.63 
 
 
391 aa  457  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3738  acetyl-CoA acetyltransferases  57.79 
 
 
399 aa  457  1e-127  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2385  acetyl-CoA acetyltransferase  59.74 
 
 
404 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0553923  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1791  acetyl-CoA acetyltransferase  59.9 
 
 
391 aa  453  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2162  Acetyl-CoA C-acyltransferase  59.54 
 
 
393 aa  450  1e-125  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.226384  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4010  acetyl-CoA acetyltransferase  59.64 
 
 
390 aa  448  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0289806  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0867  Acetyl-CoA C-acyltransferase  61.42 
 
 
391 aa  445  1.0000000000000001e-124  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4001  acetyl-CoA acetyltransferase  62.18 
 
 
393 aa  444  1e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17360  Acetyl-CoA C-acyltransferase  57.36 
 
 
393 aa  444  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.880406  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2572  acetyl-CoA acetyltransferase  60 
 
 
391 aa  441  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2019  acetyl-CoA acetyltransferase  58.63 
 
 
391 aa  436  1e-121  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263053  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3314  acetyl-CoA acetyltransferase  58.63 
 
 
391 aa  437  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0123072 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1572  thiolase  56 
 
 
401 aa  437  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.922129  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0494  acetyl-CoA acetyltransferase  56.97 
 
 
406 aa  435  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1685  acetyl-CoA acetyltransferase  58.63 
 
 
391 aa  436  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.720161 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1445  Acetyl-CoA C-acyltransferase  55.64 
 
 
401 aa  432  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279088  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  53.63 
 
 
401 aa  433  1e-120  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1394  acetyl-CoA acetyltransferase  58.04 
 
 
398 aa  430  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2051  acetyl-CoA acetyltransferase  59.49 
 
 
394 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.258769  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0915  thiolase  57.8 
 
 
393 aa  424  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000139081  normal  0.129634 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3690  acetyl-CoA acetyltransferase  58.99 
 
 
394 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4193  acetyl-CoA acetyltransferases  56.89 
 
 
393 aa  421  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.451307 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0345  acetyl-CoA acetyltransferase  56.09 
 
 
392 aa  415  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.591662  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3766  acetyl-CoA acetyltransferase  56.64 
 
 
400 aa  410  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.475759  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3228  acetyl-CoA acetyltransferase  51.53 
 
 
395 aa  389  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.404919  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1673  putative acyl-CoA thiolase  52.55 
 
 
394 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145757  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4096  Acetyl-CoA C-acyltransferase  51.14 
 
 
394 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.521488  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19430  putative acyl-CoA thiolase  51.14 
 
 
394 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2470  3-ketoacyl-CoA thiolase  50.38 
 
 
391 aa  359  5e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.559901  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1595  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 
394 aa  358  9.999999999999999e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  45.98 
 
 
392 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000894654  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2936  acetyl-CoA acetyltransferase  47.22 
 
 
390 aa  335  7.999999999999999e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0618  Acetyl-CoA C-acyltransferase  47.97 
 
 
400 aa  332  5e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.206368  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3087  acetyl-CoA acetyltransferase  47.36 
 
 
390 aa  331  2e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2125  acetyl-CoA acetyltransferase  48.75 
 
 
396 aa  328  9e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.533302 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6698  acetyl-CoA acetyltransferase  47.98 
 
 
388 aa  322  9.999999999999999e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2969  acetyl-CoA acetyltransferase  49.24 
 
 
391 aa  321  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4393  acetyl-CoA acetyltransferase  48.61 
 
 
392 aa  320  1.9999999999999998e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1886  acetyl-CoA acetyltransferase  49.75 
 
 
391 aa  320  3e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00936644 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2266  acetyl-CoA acetyltransferase  44.67 
 
 
390 aa  315  9.999999999999999e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00024775 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3596  acetyl-CoA acetyltransferase  43.43 
 
 
390 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4531  acetyl-CoA acetyltransferase  44.56 
 
 
384 aa  312  7.999999999999999e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0663  acetyl-CoA acetyltransferase  46.48 
 
 
399 aa  311  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.336951  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>