More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1725 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1725  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 		 394 aa  791    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0243329  normal  0.192279 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2051  acetyl-CoA acetyltransferase  80.96 
 
 		 394 aa  608  1e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.258769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3690  acetyl-CoA acetyltransferase  80.46 
 
 		 394 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5357  acetyl-CoA acetyltransferase  68.7 
 
 		 394 aa  565  1e-160  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7559  Acetyl-CoA C-acyltransferase  66.92 
 
 		 394 aa  541  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0152588  normal  0.387222 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2858  acetyl-CoA acetyltransferase  66.16 
 
 		 394 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3098  Acetyl-CoA C-acyltransferase  66.92 
 
 		 394 aa  535  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.83721  normal  0.450292 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6062  thiolase  67.43 
 
 		 394 aa  534  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1917  acetyl-CoA acetyltransferases  64.38 
 
 		 394 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.520432  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5443  acetyl-CoA acetyltransferase  64.84 
 
 		 400 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2665  acetyl-CoA acetyltransferases  65.23 
 
 		 390 aa  506  9.999999999999999e-143  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02317  acetyl-CoA acetyltransferase  62.69 
 
 		 393 aa  499  1e-140  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.342812  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7072  acetyl-CoA acetyltransferase  62.47 
 
 		 395 aa  497  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.769986  normal  0.992242 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3551  Acetyl-CoA C-acyltransferase  62.63 
 
 		 395 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1748  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  62.31 
 
 		 395 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0185484 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2228  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  61.62 
 
 		 395 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138441  normal  0.114685 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4236  acetyl-CoA acetyltransferase  61.81 
 
 		 395 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3636  acetyl-CoA acetyltransferase  63.5 
 
 		 400 aa  484  1e-136  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.48902 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0279  thiolase  62.78 
 
 		 395 aa  485  1e-136  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.753614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4960  acetyl-CoA acetyltransferases  63.75 
 
 		 400 aa  487  1e-136  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.325325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1576  acetyl-CoA acetyltransferase  62.69 
 
 		 390 aa  485  1e-136  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.221288  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0235  acetyl-CoA acetyltransferase  64.09 
 
 		 400 aa  483  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00445966 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0358  Acetyl-CoA C-acyltransferase  61.52 
 
 		 395 aa  473  1e-132  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4857  acetyl-CoA acetyltransferase  60.91 
 
 		 392 aa  468  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.328315  hitchhiker  0.00599656 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0755  acetyl-CoA acetyltransferase  59.64 
 
 		 393 aa  468  1.0000000000000001e-131  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2063  acetyl-CoA acetyltransferases  61.52 
 
 		 393 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0867  Acetyl-CoA C-acyltransferase  62.69 
 
 		 391 aa  462  1e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4010  acetyl-CoA acetyltransferase  61.17 
 
 		 390 aa  463  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0289806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  58 
 
 		 401 aa  456  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5147  acetyl-CoA acetyltransferase  61.01 
 
 		 395 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.249101  normal  0.0151014 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1572  thiolase  58.6 
 
 		 401 aa  449  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.922129  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1822  acetyl-CoA acetyltransferase  57.79 
 
 		 392 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.403448  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2162  Acetyl-CoA C-acyltransferase  58.99 
 
 		 393 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.226384  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1892  acetyl-CoA acetyltransferase  58.19 
 
 		 392 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.266832  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5205  acetyl-CoA acetyltransferase  57.18 
 
 		 392 aa  442  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.078979  normal  0.600477 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6175  acetyl-CoA acetyltransferase  57.68 
 
 		 392 aa  441  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1904  acetyl-CoA acetyltransferase  57.68 
 
 		 392 aa  441  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1370  acetyl-CoA acetyltransferase  56.68 
 
 		 392 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0227304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1927  acetyl-CoA acetyltransferase  57.18 
 
 		 392 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.114356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4752  acetyl-CoA acetyltransferase  57.07 
 
 		 395 aa  434  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.057105 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1445  Acetyl-CoA C-acyltransferase  56 
 
 		 401 aa  431  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0843  acetyl-CoA acetyltransferase  55.3 
 
 		 396 aa  430  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.777986  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1761  acetyl-CoA acetyltransferase  56.17 
 
 		 392 aa  426  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.402553  normal  0.162883 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1059  acetyl-CoA acetyltransferase  57.61 
 
 		 394 aa  427  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1776  acetyl-CoA acetyltransferase  56.68 
 
 		 391 aa  426  1e-118  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289993  normal  0.098501 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17360  Acetyl-CoA C-acyltransferase  55.25 
 
 		 393 aa  425  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.880406  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1486  acetyl-CoA acetyltransferase  55.42 
 
 		 392 aa  423  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.250255  normal  0.0145622 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2273  acetyl-CoA acetyltransferase  56.17 
 
 		 392 aa  423  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0444275  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1853  acetyl-CoA acetyltransferase  55.67 
 
 		 392 aa  422  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.204279 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1030  acetyl-CoA acetyltransferase  56.68 
 
 		 392 aa  419  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.919857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1407  acetyl-CoA acetyltransferase  56.42 
 
 		 392 aa  419  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1445  acetyl-CoA acetyltransferase  55.42 
 
 		 392 aa  421  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0121252 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4193  acetyl-CoA acetyltransferases  56.89 
 
 		 393 aa  412  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.451307 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1436  acetyl-CoA acetyltransferase  55.78 
 
 		 392 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00245654  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3378  acetyl-CoA acetyltransferase  55.78 
 
 		 392 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.890871  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2331  acetyl-CoA acetyltransferase  55.78 
 
 		 392 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2453  acetyl-CoA acetyltransferase  55.78 
 
 		 392 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2292  acetyl-CoA acetyltransferase  55.78 
 
 		 392 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179446  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2594  Acetyl-CoA C-acyltransferase  54.06 
 
 		 393 aa  413  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1199  acetyl-CoA acetyltransferase  55.78 
 
 		 392 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1926  acetyl-CoA acetyltransferase  55.78 
 
 		 392 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1927  acetyl-CoA acetyltransferase  55.67 
 
 		 392 aa  410  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.294769  normal  0.635162 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0494  acetyl-CoA acetyltransferase  54.59 
 
 		 406 aa  408  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2144  acetyl-CoA acetyltransferase  56.53 
 
 		 392 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.391894  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3019  acetyl-CoA acetyltransferase  52.25 
 
 		 399 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104781  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3738  acetyl-CoA acetyltransferases  52.25 
 
 		 399 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0361  Acetyl-CoA C-acyltransferase  52.41 
 
 		 392 aa  402  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3766  acetyl-CoA acetyltransferase  54.86 
 
 		 400 aa  399  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.475759  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2923  acetyl-CoA acetyltransferase  52.39 
 
 		 391 aa  397  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1394  acetyl-CoA acetyltransferase  54.39 
 
 		 398 aa  394  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0345  acetyl-CoA acetyltransferase  52.28 
 
 		 392 aa  392  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.591662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2019  acetyl-CoA acetyltransferase  53.9 
 
 		 391 aa  387  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263053  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4001  acetyl-CoA acetyltransferase  55.3 
 
 		 393 aa  387  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3314  acetyl-CoA acetyltransferase  53.9 
 
 		 391 aa  387  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0123072 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2879  acetyl-CoA acetyltransferase  52.64 
 
 		 391 aa  385  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1685  acetyl-CoA acetyltransferase  53.9 
 
 		 391 aa  387  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.720161 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1791  acetyl-CoA acetyltransferase  52.9 
 
 		 391 aa  387  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1843  acetyl-CoA acetyltransferase  51.5 
 
 		 391 aa  380  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.445136 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0915  thiolase  51.52 
 
 		 393 aa  378  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000139081  normal  0.129634 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2385  acetyl-CoA acetyltransferase  52.39 
 
 		 404 aa  374  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0553923  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3228  acetyl-CoA acetyltransferase  48.61 
 
 		 395 aa  363  3e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.404919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1673  putative acyl-CoA thiolase  50.13 
 
 		 394 aa  358  7e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145757  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2572  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 		 391 aa  352  5e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19430  putative acyl-CoA thiolase  48.87 
 
 		 394 aa  350  2e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4096  Acetyl-CoA C-acyltransferase  48.11 
 
 		 394 aa  348  9e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.521488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0618  Acetyl-CoA C-acyltransferase  46.19 
 
 		 400 aa  323  3e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.206368  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3087  acetyl-CoA acetyltransferase  45.32 
 
 		 390 aa  317  2e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1595  acetyl-CoA acetyltransferase  45.82 
 
 		 394 aa  316  4e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2936  acetyl-CoA acetyltransferase  44.81 
 
 		 390 aa  316  4e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  44.7 
 
 		 392 aa  316  5e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000894654  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2470  3-ketoacyl-CoA thiolase  43.18 
 
 		 391 aa  309  6.999999999999999e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.559901  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0359  3-ketoacyl-CoA thiolase  44.42 
 
 		 390 aa  303  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4531  acetyl-CoA acetyltransferase  44.11 
 
 		 384 aa  302  5.000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0389  acetyl-CoA acetyltransferase  44.16 
 
 		 390 aa  302  6.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.578535  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2969  acetyl-CoA acetyltransferase  47.49 
 
 		 391 aa  301  1e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4876  acetyl-CoA acetyltransferase  43.8 
 
 		 390 aa  300  2e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4718  acetyl-CoA acetyltransferase  43.8 
 
 		 390 aa  300  2e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5117  acetyl-CoA acetyltransferase  43.8 
 
 		 390 aa  300  2e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5248  acetyl-CoA acetyltransferase  43.8 
 
 		 390 aa  300  2e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5149  acetyl-CoA acetyltransferase  43.8 
 
 		 390 aa  301  2e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>