More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0235 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0235  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 		 400 aa  803    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00445966 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5443  acetyl-CoA acetyltransferase  90.5 
 
 		 400 aa  736    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4960  acetyl-CoA acetyltransferases  76 
 
 		 400 aa  625  1e-178  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.325325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3636  acetyl-CoA acetyltransferase  70.75 
 
 		 400 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.48902 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3551  Acetyl-CoA C-acyltransferase  68.42 
 
 		 395 aa  552  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7072  acetyl-CoA acetyltransferase  67.92 
 
 		 395 aa  548  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.769986  normal  0.992242 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1917  acetyl-CoA acetyltransferases  66.75 
 
 		 394 aa  549  1e-155  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.520432  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1748  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  67.67 
 
 		 395 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0185484 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4236  acetyl-CoA acetyltransferase  67.17 
 
 		 395 aa  543  1e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2228  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  67.17 
 
 		 395 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.138441  normal  0.114685 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02317  acetyl-CoA acetyltransferase  66.42 
 
 		 393 aa  536  1e-151  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.342812  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0279  thiolase  67.92 
 
 		 395 aa  528  1e-149  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.753614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4857  acetyl-CoA acetyltransferase  68.75 
 
 		 392 aa  530  1e-149  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.328315  hitchhiker  0.00599656 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1572  thiolase  65.41 
 
 		 401 aa  522  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.922129  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0358  Acetyl-CoA C-acyltransferase  66.42 
 
 		 395 aa  520  1e-146  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0755  acetyl-CoA acetyltransferase  65.41 
 
 		 393 aa  521  1e-146  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1576  acetyl-CoA acetyltransferase  66.83 
 
 		 390 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.221288  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7559  Acetyl-CoA C-acyltransferase  63.75 
 
 		 394 aa  508  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0152588  normal  0.387222 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5357  acetyl-CoA acetyltransferase  64.5 
 
 		 394 aa  504  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6062  thiolase  64.75 
 
 		 394 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2063  acetyl-CoA acetyltransferases  62.91 
 
 		 393 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2665  acetyl-CoA acetyltransferases  65.91 
 
 		 390 aa  504  9.999999999999999e-143  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0843  acetyl-CoA acetyltransferase  62.56 
 
 		 396 aa  503  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.777986  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1059  acetyl-CoA acetyltransferase  65.66 
 
 		 394 aa  502  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2594  Acetyl-CoA C-acyltransferase  63 
 
 		 393 aa  499  1e-140  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1370  acetyl-CoA acetyltransferase  61.65 
 
 		 392 aa  496  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0227304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1725  acetyl-CoA acetyltransferase  64.09 
 
 		 394 aa  496  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0243329  normal  0.192279 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1927  acetyl-CoA acetyltransferase  62.16 
 
 		 392 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.114356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1904  acetyl-CoA acetyltransferase  62.41 
 
 		 392 aa  498  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1445  Acetyl-CoA C-acyltransferase  61.9 
 
 		 401 aa  496  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.279088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1822  acetyl-CoA acetyltransferase  61.9 
 
 		 392 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.403448  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5147  acetyl-CoA acetyltransferase  64.08 
 
 		 395 aa  495  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.249101  normal  0.0151014 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6175  acetyl-CoA acetyltransferase  62.41 
 
 		 392 aa  498  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1892  acetyl-CoA acetyltransferase  61.9 
 
 		 392 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.266832  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4752  acetyl-CoA acetyltransferase  61.35 
 
 		 395 aa  490  1e-137  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.057105 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5205  acetyl-CoA acetyltransferase  61.15 
 
 		 392 aa  488  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.078979  normal  0.600477 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3019  acetyl-CoA acetyltransferase  62.22 
 
 		 399 aa  488  1e-137  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104781  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3738  acetyl-CoA acetyltransferases  62.22 
 
 		 399 aa  488  1e-137  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  58.9 
 
 		 401 aa  487  1e-136  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3098  Acetyl-CoA C-acyltransferase  64 
 
 		 394 aa  488  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.83721  normal  0.450292 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1199  acetyl-CoA acetyltransferase  62.66 
 
 		 392 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2331  acetyl-CoA acetyltransferase  62.66 
 
 		 392 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3378  acetyl-CoA acetyltransferase  62.66 
 
 		 392 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.890871  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1436  acetyl-CoA acetyltransferase  62.66 
 
 		 392 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00245654  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2292  acetyl-CoA acetyltransferase  62.66 
 
 		 392 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179446  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2453  acetyl-CoA acetyltransferase  62.66 
 
 		 392 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1926  acetyl-CoA acetyltransferase  62.66 
 
 		 392 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0494  acetyl-CoA acetyltransferase  61.54 
 
 		 406 aa  484  1e-135  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4010  acetyl-CoA acetyltransferase  65.09 
 
 		 390 aa  478  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0289806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2273  acetyl-CoA acetyltransferase  61.15 
 
 		 392 aa  480  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0444275  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0867  Acetyl-CoA C-acyltransferase  65.16 
 
 		 391 aa  478  1e-133  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0361  Acetyl-CoA C-acyltransferase  60 
 
 		 392 aa  475  1e-133  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1761  acetyl-CoA acetyltransferase  59.4 
 
 		 392 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.402553  normal  0.162883 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1030  acetyl-CoA acetyltransferase  61.65 
 
 		 392 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.919857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2858  acetyl-CoA acetyltransferase  57.75 
 
 		 394 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1394  acetyl-CoA acetyltransferase  62.72 
 
 		 398 aa  471  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1486  acetyl-CoA acetyltransferase  59.15 
 
 		 392 aa  468  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.250255  normal  0.0145622 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2144  acetyl-CoA acetyltransferase  62.41 
 
 		 392 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.391894  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2162  Acetyl-CoA C-acyltransferase  62 
 
 		 393 aa  467  9.999999999999999e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.226384  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1407  acetyl-CoA acetyltransferase  59.4 
 
 		 392 aa  461  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17360  Acetyl-CoA C-acyltransferase  59.15 
 
 		 393 aa  464  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.880406  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1445  acetyl-CoA acetyltransferase  58.15 
 
 		 392 aa  462  1e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0121252 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1853  acetyl-CoA acetyltransferase  58.4 
 
 		 392 aa  464  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.204279 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1927  acetyl-CoA acetyltransferase  60.15 
 
 		 392 aa  464  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.294769  normal  0.635162 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0345  acetyl-CoA acetyltransferase  60.9 
 
 		 392 aa  462  1e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.591662  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2051  acetyl-CoA acetyltransferase  64.34 
 
 		 394 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.258769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1776  acetyl-CoA acetyltransferase  59.65 
 
 		 391 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289993  normal  0.098501 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4193  acetyl-CoA acetyltransferases  59.7 
 
 		 393 aa  456  1e-127  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.451307 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4001  acetyl-CoA acetyltransferase  61.65 
 
 		 393 aa  456  1e-127  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3690  acetyl-CoA acetyltransferase  63.84 
 
 		 394 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2923  acetyl-CoA acetyltransferase  56.14 
 
 		 391 aa  455  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1843  acetyl-CoA acetyltransferase  55.64 
 
 		 391 aa  442  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.445136 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1791  acetyl-CoA acetyltransferase  57.89 
 
 		 391 aa  441  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2879  acetyl-CoA acetyltransferase  57.25 
 
 		 391 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3766  acetyl-CoA acetyltransferase  58.4 
 
 		 400 aa  436  1e-121  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.475759  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2385  acetyl-CoA acetyltransferase  56.64 
 
 		 404 aa  435  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0553923  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3314  acetyl-CoA acetyltransferase  56.39 
 
 		 391 aa  431  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0123072 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2019  acetyl-CoA acetyltransferase  55.89 
 
 		 391 aa  426  1e-118  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263053  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0915  thiolase  56.39 
 
 		 393 aa  425  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000139081  normal  0.129634 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1685  acetyl-CoA acetyltransferase  55.89 
 
 		 391 aa  426  1e-118  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.720161 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3228  acetyl-CoA acetyltransferase  54.25 
 
 		 395 aa  424  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.404919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1673  putative acyl-CoA thiolase  56.14 
 
 		 394 aa  420  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.145757  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19430  putative acyl-CoA thiolase  54.89 
 
 		 394 aa  413  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2572  acetyl-CoA acetyltransferase  53.89 
 
 		 391 aa  411  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4096  Acetyl-CoA C-acyltransferase  53.63 
 
 		 394 aa  409  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.521488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1595  acetyl-CoA acetyltransferase  48.51 
 
 		 394 aa  358  8e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2470  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.87 
 
 		 391 aa  340  2e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.559901  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  45.52 
 
 		 392 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000894654  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2936  acetyl-CoA acetyltransferase  46.25 
 
 		 390 aa  340  4e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0618  Acetyl-CoA C-acyltransferase  47.13 
 
 		 400 aa  339  5e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.206368  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3087  acetyl-CoA acetyltransferase  46 
 
 		 390 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  51.63 
 
 		 392 aa  334  1e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.867472  hitchhiker  0.0000022311 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4393  acetyl-CoA acetyltransferase  48.25 
 
 		 392 aa  325  6e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2125  acetyl-CoA acetyltransferase  49.75 
 
 		 396 aa  324  2e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.533302 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0389  acetyl-CoA acetyltransferase  47.12 
 
 		 390 aa  317  3e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.578535  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1706  acetyl-CoA acetyltransferase  47.81 
 
 		 395 aa  316  4e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0387  acetyl-CoA acetyltransferase  46.87 
 
 		 390 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5155  acetyl-CoA acetyltransferase  44.11 
 
 		 390 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5143  acetyl-CoA acetyltransferase  43.86 
 
 		 390 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4531  acetyl-CoA acetyltransferase  44 
 
 		 384 aa  312  6.999999999999999e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>