More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2090 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_2090  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
390 aa  793    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000145195 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2127  acetyl-CoA acetyltransferase  96.66 
 
 
390 aa  744    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1592  acetyl-CoA acetyltransferase  71.28 
 
 
390 aa  567  1e-160  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.160886  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0387  acetyl-CoA acetyltransferase  70 
 
 
390 aa  553  1e-156  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0389  acetyl-CoA acetyltransferase  68.97 
 
 
390 aa  550  1e-155  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.578535  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0359  3-ketoacyl-CoA thiolase  68.21 
 
 
390 aa  544  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2876  acetyl-CoA acetyltransferase  66.92 
 
 
390 aa  517  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.44366 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1886  acetyl-CoA acetyltransferase  60.58 
 
 
391 aa  465  9.999999999999999e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00936644 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2470  3-ketoacyl-CoA thiolase  59.64 
 
 
391 aa  467  9.999999999999999e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.559901  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2936  acetyl-CoA acetyltransferase  59.13 
 
 
390 aa  464  1e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  58.21 
 
 
392 aa  458  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000894654  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2969  acetyl-CoA acetyltransferase  58.89 
 
 
391 aa  457  1e-127  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3087  acetyl-CoA acetyltransferase  57.84 
 
 
390 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3596  acetyl-CoA acetyltransferase  57.44 
 
 
390 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4393  acetyl-CoA acetyltransferase  59.08 
 
 
392 aa  446  1.0000000000000001e-124  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5143  acetyl-CoA acetyltransferase  56.78 
 
 
390 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5155  acetyl-CoA acetyltransferase  56.78 
 
 
390 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1595  acetyl-CoA acetyltransferase  57.8 
 
 
394 aa  436  1e-121  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4876  acetyl-CoA acetyltransferase  56.78 
 
 
390 aa  437  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4718  acetyl-CoA acetyltransferase  56.78 
 
 
390 aa  437  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4733  acetyl-CoA acetyltransferase  56.78 
 
 
390 aa  437  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5248  acetyl-CoA acetyltransferase  56.78 
 
 
390 aa  437  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5117  acetyl-CoA acetyltransferase  56.78 
 
 
390 aa  437  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0095  acetyl-CoA acetyltransferase  56.52 
 
 
390 aa  436  1e-121  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4834  acetyl-CoA acetyltransferase  56.52 
 
 
390 aa  436  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5149  acetyl-CoA acetyltransferase  56.78 
 
 
390 aa  437  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  60.74 
 
 
392 aa  436  1e-121  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.867472  hitchhiker  0.0000022311 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4531  acetyl-CoA acetyltransferase  57.44 
 
 
384 aa  433  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1706  acetyl-CoA acetyltransferase  57.6 
 
 
395 aa  426  1e-118  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0618  Acetyl-CoA C-acyltransferase  55.01 
 
 
400 aa  426  1e-118  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.206368  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3064  acetyl-CoA acetyltransferase  55.88 
 
 
392 aa  425  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2125  acetyl-CoA acetyltransferase  56.52 
 
 
396 aa  417  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.533302 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1653  acetyl-CoA acetyltransferase  56.82 
 
 
402 aa  417  9.999999999999999e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.302534  normal  0.125875 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01049  acetyl-CoA acetyltransferase  55.7 
 
 
401 aa  410  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.216841  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0350  acetyl-CoA acetyltransferase  53.81 
 
 
399 aa  409  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0365  acetyl-CoA acetyltransferase  53.55 
 
 
399 aa  408  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06117  acetyl-CoA acetyltransferase  55.7 
 
 
401 aa  410  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0270862  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4085  acetyl-CoA acetyltransferase  53.94 
 
 
399 aa  411  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.802435  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0580  acetyl-CoA acetyltransferase  54.71 
 
 
399 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0448  acetyl-CoA acetyltransferase  52.16 
 
 
398 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4755  acetyl-CoA acetyltransferase  54.2 
 
 
393 aa  406  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.167553  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0566  acetyl-CoA acetyltransferase  54.2 
 
 
399 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3723  acetyl-CoA acetyltransferase  52.69 
 
 
392 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0595  acetyl-CoA acetyltransferase  53.44 
 
 
398 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.837144 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5109  acetyl-CoA acetyltransferase  53.09 
 
 
392 aa  404  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2637  acetyl-CoA acetyltransferase  54.45 
 
 
399 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.357851 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6046  acetyl-CoA acetyltransferase  54.45 
 
 
399 aa  402  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0574  acetyl-CoA acetyltransferase  53.44 
 
 
398 aa  402  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2771  acetyl-CoA acetyltransferase  54.45 
 
 
399 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0475  acetyl-CoA acetyltransferase  52.28 
 
 
399 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73599  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0663  acetyl-CoA acetyltransferase  53.18 
 
 
399 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.336951  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0199  acetyl-CoA acetyltransferase  53.44 
 
 
399 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1307  acetyl-CoA acetyltransferase  53.32 
 
 
394 aa  400  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0416  acetyl-CoA acetyltransferase  52.16 
 
 
399 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0682  acetyl-CoA acetyltransferase  53.44 
 
 
399 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0859  acetyl-CoA acetyltransferase  53.44 
 
 
399 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0697  acetyl-CoA acetyltransferase  53.44 
 
 
399 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.767205  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2412  acetyl-CoA acetyltransferase  53.44 
 
 
399 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.804576  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2746  acetyl-CoA acetyltransferase  54.2 
 
 
399 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0055718  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0387  acetyl-CoA acetyltransferase  53.94 
 
 
399 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1340  acetyl-CoA acetyltransferase  53.44 
 
 
398 aa  401  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4036  acetyl-CoA acetyltransferase  53.18 
 
 
399 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.105517 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2107  acetyl-CoA acetyltransferase  54.2 
 
 
399 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0857857  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3590  acetyl-CoA acetyltransferase  53.23 
 
 
394 aa  399  9.999999999999999e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2719  acetyl-CoA acetyltransferase  54.2 
 
 
399 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4030  acetyl-CoA acetyltransferase  53.44 
 
 
399 aa  399  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000182841 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2746  acetyl-CoA acetyltransferase  53.44 
 
 
399 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2332  acetyl-CoA acetyltransferase  53.44 
 
 
399 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1306  acetyl-CoA acetyltransferase  53.32 
 
 
394 aa  397  1e-109  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2266  acetyl-CoA acetyltransferase  51.03 
 
 
390 aa  395  1e-109  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00024775 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3553  acetyl-CoA acetyltransferase  52.19 
 
 
392 aa  396  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0573177  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7110  acetyl-CoA acetyltransferase  51.79 
 
 
391 aa  395  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1550  acetyl-CoA acetyltransferase  53.67 
 
 
399 aa  392  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000109593  hitchhiker  0.00778819 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0098  acetyl-CoA acetyltransferase  53.28 
 
 
400 aa  393  1e-108  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.223566  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0387  acetyl-CoA acetyltransferase  53.69 
 
 
398 aa  393  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.618119  decreased coverage  0.00238566 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0814  acetyl-CoA acetyltransferase  53.18 
 
 
400 aa  394  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2056  3-ketoacyl-CoA thiolase  56.04 
 
 
392 aa  394  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.150034  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06175  acetyl-CoA acyltransferase  53.92 
 
 
396 aa  393  1e-108  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3474  acetyl-CoA acetyltransferase  52.79 
 
 
399 aa  394  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.158133  normal  0.651546 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0156  acetyl-CoA acetyltransferase  51.15 
 
 
394 aa  388  1e-107  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117931  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3953  acetyl-CoA acetyltransferase  52.28 
 
 
398 aa  391  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0618375  normal  0.754512 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0221  acetyl-CoA acetyltransferase  51.66 
 
 
394 aa  382  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0215  acetyl-CoA acetyltransferase  51.66 
 
 
394 aa  382  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0810  acetyl-CoA acetyltransferase  54.52 
 
 
399 aa  384  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0964  acetyl-CoA acetyltransferase  52.16 
 
 
398 aa  381  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3516  acetyl-CoA acetyltransferase  52.03 
 
 
398 aa  380  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1803  acetyl-CoA acetyltransferase  51.28 
 
 
390 aa  379  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6698  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 
388 aa  359  5e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1370  acetyl-CoA acetyltransferase  48.21 
 
 
392 aa  349  4e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0227304  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6175  acetyl-CoA acetyltransferase  47.19 
 
 
392 aa  345  8e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3228  acetyl-CoA acetyltransferase  47.7 
 
 
395 aa  345  8e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.404919  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1904  acetyl-CoA acetyltransferase  47.19 
 
 
392 aa  345  8e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1927  acetyl-CoA acetyltransferase  47.19 
 
 
392 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.114356  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0625  acetyl-CoA acetyltransferase  48.21 
 
 
378 aa  345  1e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1892  acetyl-CoA acetyltransferase  46.68 
 
 
392 aa  343  2e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.266832  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1822  acetyl-CoA acetyltransferase  46.68 
 
 
392 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.403448  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1756  acetyl-CoA acetyltransferase  46.91 
 
 
378 aa  342  7e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.404662  normal  0.415846 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5205  acetyl-CoA acetyltransferase  47.07 
 
 
392 aa  340  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.078979  normal  0.600477 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0755  acetyl-CoA acetyltransferase  46.21 
 
 
393 aa  341  2e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2273  acetyl-CoA acetyltransferase  46.43 
 
 
392 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0444275  normal  0.504331 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>