More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1756 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1756  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 		 378 aa  764    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.404662  normal  0.415846 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1743  acetyl-CoA acetyltransferase  74.27 
 
 		 378 aa  581  1.0000000000000001e-165  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1310  Acetyl-CoA C-acyltransferase  73.09 
 
 		 380 aa  557  1e-157  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3795  acetyl-CoA acetyltransferase  69.5 
 
 		 378 aa  541  1e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.143554 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4443  acetyl-CoA acetyltransferase  71.05 
 
 		 382 aa  538  9.999999999999999e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0110645 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0005  acetyl-CoA acetyltransferase  69.31 
 
 		 378 aa  501  1e-141  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26010  acyl-CoA thiolase  63.37 
 
 		 379 aa  489  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.653949  normal  0.286691 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3455  acetyl-CoA acetyltransferase  61.33 
 
 		 377 aa  464  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0625  acetyl-CoA acetyltransferase  59.42 
 
 		 378 aa  459  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5088  acetyl-CoA acetyltransferase  59.38 
 
 		 385 aa  461  9.999999999999999e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225671  normal  0.910861 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3226  acetyl-CoA acetyltransferases  58.36 
 
 		 373 aa  424  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0618  Acetyl-CoA C-acyltransferase  50.77 
 
 		 400 aa  380  1e-104  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.206368  normal  0.954759 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3087  acetyl-CoA acetyltransferase  49.48 
 
 		 390 aa  358  6e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2936  acetyl-CoA acetyltransferase  50.26 
 
 		 390 aa  358  8e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  47.3 
 
 		 392 aa  354  1e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000894654  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6698  acetyl-CoA acetyltransferase  50.26 
 
 		 388 aa  347  1e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4531  acetyl-CoA acetyltransferase  47.64 
 
 		 384 aa  340  2e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0387  acetyl-CoA acetyltransferase  47.16 
 
 		 390 aa  338  7e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3596  acetyl-CoA acetyltransferase  47.56 
 
 		 390 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0389  acetyl-CoA acetyltransferase  47.16 
 
 		 390 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.578535  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0359  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.42 
 
 		 390 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2321  acetyl-CoA acetyltransferase  48.27 
 
 		 402 aa  337  2.9999999999999997e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1595  acetyl-CoA acetyltransferase  45.64 
 
 		 394 aa  335  7e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0348  acetyl-CoA acetyltransferase  48.81 
 
 		 392 aa  333  3e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.867472  hitchhiker  0.0000022311 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2127  acetyl-CoA acetyltransferase  47.99 
 
 		 390 aa  333  3e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1886  acetyl-CoA acetyltransferase  48.41 
 
 		 391 aa  332  5e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00936644 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5155  acetyl-CoA acetyltransferase  47.04 
 
 		 390 aa  330  2e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2266  acetyl-CoA acetyltransferase  46.55 
 
 		 390 aa  330  3e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024775 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2969  acetyl-CoA acetyltransferase  48.01 
 
 		 391 aa  330  3e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.81 
 
 		 387 aa  330  3e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000295013 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4085  acetyl-CoA acetyltransferase  48.09 
 
 		 399 aa  330  3e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.802435  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5143  acetyl-CoA acetyltransferase  46.79 
 
 		 390 aa  329  4e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2090  acetyl-CoA acetyltransferase  46.28 
 
 		 390 aa  329  5.0000000000000004e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000145195 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0031  3-ketoacyl-CoA thiolase  48.84 
 
 		 387 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.871061  normal  0.0355813 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0022  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.56 
 
 		 387 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000376188 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5109  acetyl-CoA acetyltransferase  45.55 
 
 		 392 aa  327  2.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2125  acetyl-CoA acetyltransferase  46.84 
 
 		 396 aa  326  3e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.533302 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1592  acetyl-CoA acetyltransferase  47.34 
 
 		 390 aa  327  3e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.160886  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5149  acetyl-CoA acetyltransferase  46.79 
 
 		 390 aa  325  5e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0017  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.04 
 
 		 387 aa  325  6e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5117  acetyl-CoA acetyltransferase  46.79 
 
 		 390 aa  325  7e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4876  acetyl-CoA acetyltransferase  46.79 
 
 		 390 aa  325  7e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4718  acetyl-CoA acetyltransferase  46.79 
 
 		 390 aa  325  7e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5248  acetyl-CoA acetyltransferase  46.79 
 
 		 390 aa  325  7e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4733  acetyl-CoA acetyltransferase  46.79 
 
 		 390 aa  325  8.000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0012  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.81 
 
 		 387 aa  325  9e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1323  acetyl-CoA acetyltransferase  48.09 
 
 		 402 aa  325  1e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.158351 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4834  acetyl-CoA acetyltransferase  46.27 
 
 		 390 aa  324  1e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0095  acetyl-CoA acetyltransferase  46.02 
 
 		 390 aa  324  2e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1160  acetyl-CoA acetyltransferase  46.12 
 
 		 412 aa  324  2e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0018  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.3 
 
 		 387 aa  322  5e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.969653 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0448  acetyl-CoA acetyltransferase  47.18 
 
 		 398 aa  322  6e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11092  acetyl-CoA acetyltransferase  45.43 
 
 		 405 aa  322  8e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.641884 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1472  acetyl-CoA acetyltransferase  45.3 
 
 		 406 aa  322  8e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0328581  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4393  acetyl-CoA acetyltransferase  45.5 
 
 		 392 aa  321  9.999999999999999e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0816  acetyl-CoA acetyltransferase  45.61 
 
 		 398 aa  320  1.9999999999999998e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  45 
 
 		 398 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0012  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.06 
 
 		 387 aa  320  3e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0898923  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.06 
 
 		 387 aa  320  3e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.237064  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0019  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.06 
 
 		 387 aa  320  3e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0120161 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0015  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.06 
 
 		 387 aa  320  3e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0019  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.06 
 
 		 387 aa  320  3e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000205749 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0023  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.04 
 
 		 387 aa  320  3e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.188213  hitchhiker  0.0000000293236 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0020  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.79 
 
 		 387 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0015  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.31 
 
 		 387 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01049  acetyl-CoA acetyltransferase  46.27 
 
 		 401 aa  320  3.9999999999999996e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.216841  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06117  acetyl-CoA acetyltransferase  46.27 
 
 		 401 aa  320  3.9999999999999996e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0270862  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  44.75 
 
 		 398 aa  319  3.9999999999999996e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0416  acetyl-CoA acetyltransferase  47.25 
 
 		 399 aa  319  5e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0014  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.3 
 
 		 387 aa  318  1e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0013127  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0017  3-ketoacyl-CoA thiolase  46.79 
 
 		 387 aa  318  1e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000928533 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2973  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.04 
 
 		 387 aa  318  1e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2470  3-ketoacyl-CoA thiolase  44.99 
 
 		 391 aa  317  2e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.559901  normal  0.822135 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1803  acetyl-CoA acetyltransferase  45.52 
 
 		 390 aa  317  3e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1071  acetyl-CoA acetyltransferase  45.82 
 
 		 402 aa  317  3e-85  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.595255 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0350  acetyl-CoA acetyltransferase  47.12 
 
 		 399 aa  316  4e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1706  acetyl-CoA acetyltransferase  45.58 
 
 		 395 aa  316  4e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7110  acetyl-CoA acetyltransferase  46.8 
 
 		 391 aa  316  4e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1582  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  44.69 
 
 		 424 aa  316  4e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3048  beta-ketoadipyl CoA thiolase  46.21 
 
 		 403 aa  315  6e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.214699  normal  0.389192 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2876  acetyl-CoA acetyltransferase  47.56 
 
 		 390 aa  315  7e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.44366 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0814  acetyl-CoA acetyltransferase  47.22 
 
 		 400 aa  315  9e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3121  acetyl-CoA acetyltransferase  44.06 
 
 		 406 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000096812 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3934  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.56 
 
 		 387 aa  313  1.9999999999999998e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4235  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.04 
 
 		 387 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2533  3-ketoacyl-CoA thiolase  49.22 
 
 		 387 aa  314  1.9999999999999998e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1911  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.56 
 
 		 387 aa  313  1.9999999999999998e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00597206 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0282  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.56 
 
 		 387 aa  313  1.9999999999999998e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.185398  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1579  3-ketoacyl-CoA thiolase  48.18 
 
 		 391 aa  313  1.9999999999999998e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.30524  normal  0.199847 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0260  3-ketoacyl-CoA thiolase  47.3 
 
 		 387 aa  313  3.9999999999999997e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.126316 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3516  acetyl-CoA acetyltransferase  46.58 
 
 		 398 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0387  acetyl-CoA acetyltransferase  46.92 
 
 		 398 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.618119  decreased coverage  0.00238566 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3064  acetyl-CoA acetyltransferase  46.67 
 
 		 392 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0365  acetyl-CoA acetyltransferase  46.37 
 
 		 399 aa  312  5.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31900  acetyl-CoA acetyltransferase  43.07 
 
 		 406 aa  312  6.999999999999999e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.213543  normal  0.245472 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0392  3-ketoacyl-CoA thiolase  45.62 
 
 		 386 aa  311  7.999999999999999e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0475  acetyl-CoA acetyltransferase  46.37 
 
 		 399 aa  311  1e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0215  acetyl-CoA acetyltransferase  44.25 
 
 		 394 aa  311  1e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0221  acetyl-CoA acetyltransferase  44.25 
 
 		 394 aa  311  1e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0566  acetyl-CoA acetyltransferase  45.59 
 
 		 399 aa  311  1e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>